我們展示了使用兩種蛋白作為底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一種 Fc 融合蛋白,含有 TNFα 受體的胞外結(jié)構(gòu)域。該結(jié)構(gòu)域用 2 個 N-糖和 8-11 個 1 個具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修飾。在 37°C 下將這種重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小時,可完全去除所有 N-和 O-糖,如中級 LC-MS 分析所示。促紅xibao生成素 (EPO) 是一種攜帶 3 個 N-聚糖和 1 個he心 1 個 O-聚糖的小蛋白質(zhì),其總質(zhì)量的近 40% 由聚糖組成。O-連接聚糖通常存在于蛋白質(zhì)的暴露位置,因?yàn)樗鼈冊诘鞍踪|(zhì)折疊發(fā)生后附著。只有負(fù)責(zé)其合成的糖基轉(zhuǎn)移酶才能接觸到這些暴露的位點(diǎn)。依那西普的磷性能測試?:PNGaseF去除N-聚糖。吉林用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究
Genovis的ImpaRATOR? 和 OpeRATOR? - 兩種協(xié)同的作用:O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化區(qū)域O-聚糖位點(diǎn)的覆蓋率(圖3)。使用OpeRATOR鑒定對應(yīng)于所有13個O-聚糖位點(diǎn)的肽,而使用ImpaRATOR只能明確鑒定10個位點(diǎn)。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR (1) 具有更具選擇性的氨基酸序列偏好,此處由 S186 和 T245 位點(diǎn)缺乏消化來表明。此外,ImpaRATOR 在兩個相鄰的 O-糖基化氨基酸之間顯示出有限的裂解,如 S213 位點(diǎn)酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位點(diǎn)酶解肽的低強(qiáng)度所證明的那樣。在OpeRATOR酶解樣品(T184-S199和T200-H204;圖2b和d),而在ImpaRATOR消化的樣品中,具有漏裂的相應(yīng)肽(S184-H204)的強(qiáng)度更高。 雖然OpeRATOR顯示出更高的O-聚糖位點(diǎn)覆蓋率,但使用ImpaRATOR進(jìn)行消化可以表征O-聚糖結(jié)構(gòu),包括唾液酸化物種。例如,條形圖插入顯示了兩種糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖種類。這應(yīng)該與使用OpeRATOR的消化進(jìn)行比較,在OpeRATOR中,必須去除唾液酸才能產(chǎn)生酶活性,這意味著有關(guān)唾液酸化的信息丟失??偠灾琁mpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有關(guān)聚糖組成和 O-聚糖位點(diǎn)的完整信息。吉林用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究對天然糖蛋白或游離的聚糖結(jié)構(gòu)上存在的 N- 和 O-連接聚糖均具有活性。
使用Genovis的OpeRATOR圖譜O-聚糖位點(diǎn)對依那西普進(jìn)行LC-MS分析:依那西普是一種 Fc 融合蛋白,具有高度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。將依那西普與OpeRAT一起孵育,并使用LC-MS/MS分析所得糖肽。促紅xibao生成素 (EPO) 是一種具有單個 O-糖基化位點(diǎn)的 ~30 kDa 糖蛋白。在PNGase F去除N-糖并使用SialEXO進(jìn)行去唾液酸化后,用OpeRAT消化天然蛋白,并通過反相LC-MS分析所得蛋白質(zhì)片段。O-糖基化的位點(diǎn)可以通過識別OeRATOR消化位點(diǎn)直接推斷出來。為了獲得良好性能,需要去除唾液酸助劑,因此購買中包括2000個單位(如果SialEXO凍干)。1. 用于方法開發(fā)的靈活產(chǎn)品形式;2. 可以結(jié)合酶以提高效率;3. 適用于自動化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可。O-聚糖是OpeRATOR活性所必需的,而該酶在N-聚糖上沒有活性。OpeRATOR和SialEXO處理后,O-糖基化蛋白被消化成攜帶O-聚糖的肽。消化發(fā)生在O-糖基化位點(diǎn)的N端。
OglyZOR 來源于口腔鏈球菌,在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽,分子量為 227 kDa。SialEXO來源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達(dá)。SialEXO酶含有His標(biāo)簽,組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶;2. 降低樣品異質(zhì)性,揭示潛在的關(guān)鍵蛋白質(zhì)修飾;3. 完全、穩(wěn)健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶,用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 個單位的小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發(fā)揮作用,因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。采用合適的酶策略來去除這些GalNAc并簡化生物制藥的表征。
用于水解β1-3,4-連接半乳糖的固定化酶在離心柱中的糖蛋白上。Genovis的GalactEXO固定化離心柱含有與瓊脂糖珠共價偶聯(lián)的GalactEXO酶,用于糖蛋白上β1-3,4-連接半乳糖的水解,而不會用酶污染z終制劑。Microspin 色譜柱可用于水解 5 或 10 x 0.5 mg 糖蛋白。1. 易于使用的離心柱;2. 提高酶與底物的比例,提高消化效率;3. z終樣品中不含酶。GalactEXO 酶來源于 Akkermansia muciniphila 并重組表達(dá),可有效水解 β1-3 和 β1-4 連接的半乳糖。GalactEXO微離心柱經(jīng)過格式化,可在30-60分鐘內(nèi)水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。用于水解天然 N-和 O-糖基化蛋白或游離寡糖上的α1-2、α1-3和α1-4-連接巖藻糖殘基。陜西N-聚糖水解酶PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究
N-聚糖在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)zhong共翻譯地連接到未折疊的蛋白質(zhì)上;吉林用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究
GlycOCATCH?親和純化:用于粘蛋白型O-糖蛋白和肽親和純化的富集樹脂。GlycOCATCH親和純化以方便的離心柱形式提供。該產(chǎn)品包含:4 個 GlycOCATCH 親和純化微離心柱,每個柱能夠結(jié)合 50 μg 粘蛋白型 O-糖蛋白(總共 200 μg)。Genovis的SialEXO 凍干 200 單位,用于去除唾液酸;OpeRATOR 凍干 200 單位,用于結(jié)合的 O-糖蛋白的可選洗脫方法。1. 靶向 O-糖蛋白富集;2. 復(fù)雜樣品的特異性凈化;3. 用于改進(jìn) MS 分析的樣品制備。O-糖基化蛋白和肽的特異性富集:O-連接聚糖參與多種生物過程,包括抑制病原體引起的gan染、炎癥反應(yīng)、造血和細(xì)胞信號傳導(dǎo)。吉林用于自動化系統(tǒng)的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶疾病機(jī)理研究
糖蛋白性能測試:O-聚糖的巖藻糖基化參與功能上重要的聚糖表位的合成,例如血型抗原和劉易斯結(jié)構(gòu)。分析用...
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