嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I（BstDNAPolymeraseI）和它的大片段（LargeFragment）是兩種在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中常用的酶。它們的主要區(qū)別在于結(jié)構(gòu)和活性：1.**結(jié)構(gòu)**：-完整的BstDNAPolymeraseI包含一個(gè)5'→3'的核酸外切酶活性區(qū)域，而大片段是通過(guò)基因工程改造或蛋白酶處理去掉了這個(gè)外切酶活性區(qū)域的酶。因此，大片段沒(méi)有5'→3'的核酸外切酶活性，但保留了5'→3'的DNA聚合酶活性。2.**活性**：-BstDNAPolymeraseI具有5'→3'的核酸外切酶活性，這意味著它在合成DNA的同時(shí)可以“校對(duì)”錯(cuò)誤，切除不匹配的核苷酸。而大片段由于缺少外切酶活性區(qū)域，不具有這種校對(duì)能力。-大片段具有更強(qiáng)的鏈置換能力，這使得它非常適合于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)，如環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增（LAMP）和滾環(huán)擴(kuò)增（RCA）。3.**應(yīng)用**：-BstDNAPolymeraseI由于具有校對(duì)功能，可能更適合于需要高保真度的DNA合成反應(yīng)。-BstDNAPolymerase,LargeFragment由于其鏈置換能力，更適合于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)，這些技術(shù)不需要熱循環(huán)儀，可以在恒定溫度下進(jìn)行DNA擴(kuò)增。4.**熱穩(wěn)定性**：-BstDNAPolymerase,LargeFragment通常在65°C左右的溫度下進(jìn)行反應(yīng)，而BstDNAPolymeraseI可能具有更寬的反應(yīng)溫度范圍。Tn5 轉(zhuǎn)座酶的 DNA 結(jié)合元件分布在幾乎整個(gè)一級(jí)序列上，在與 DNA 結(jié)合時(shí)會(huì)使 DNA 發(fā)生彎曲。Recombinant Human SCF Protein

蛋白A-微球菌核酸酶（pA-MNase）是一種特殊的融合蛋白，它結(jié)合了蛋白A和微球菌核酸酶（MNase，MicrococcalNuclease）的特性。以下是pA-MNase的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用：1.**融合表達(dá)產(chǎn)物**：pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達(dá)產(chǎn)物，因此它同時(shí)具有ProteinA的抗體結(jié)合活性和MNase的核酸內(nèi)切酶活性。2.**雙重功能**：由于其雙重功能，pA-MNase常用于蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究，特別是在ChIC（ChromatinImmunocleavage）和CUT&RUN（CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease）技術(shù)中。3.**ProteinA的特性**：ProteinA是一種發(fā)現(xiàn)于金黃色葡萄球菌（Staphylococcusaureus）的細(xì)胞壁表面蛋白，分子量為42kDa，能特異性地與哺乳動(dòng)物免疫球蛋白（Immunoglobulin,Ig）結(jié)合，通常結(jié)合部位為免疫球蛋白的Fc區(qū)。4.**微球菌核酸酶（MNase）的特性**：MNase是一種核酸內(nèi)切酶，能夠降解核酸，常用于降解蛋白質(zhì)制備中存在的核酸，減少細(xì)胞裂解液的粘度，以及用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和快速RNA測(cè)序。5.**反應(yīng)條件**：MNase的反應(yīng)條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer，需要補(bǔ)充100μg/ml重組白蛋白，分子生物學(xué)級(jí)，并在37°C下孵化。Recombinant Cynomolgus NKG2C/CD159c Protein,His Tag將Cas9/sgRNA復(fù)合物轉(zhuǎn)染到目標(biāo)細(xì)胞中。可以使用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染、電穿孔或其他轉(zhuǎn)染技術(shù) 。

核酸內(nèi)切酶VIII（EndonucleaseVIII）是一種來(lái)自大腸桿菌的DNA損傷修復(fù)酶，具有以下特點(diǎn)：1.**雙功能活性**：核酸內(nèi)切酶VIII具有N-糖基化酶(N-glycosylase)活性和AP裂解酶(AP-lyase)活性。2.**釋放受損嘧啶堿基**：N-糖基化酶活性可以釋放雙鏈DNA上受損的嘧啶堿基，如胸腺嘧啶乙二醇和尿嘧啶乙二醇，生成一個(gè)脫嘌呤(apurinic,AP)位點(diǎn)。3.**切割A(yù)P位點(diǎn)**：AP裂解酶活性可以切割A(yù)P位點(diǎn)的3'和5'端，產(chǎn)生一個(gè)具有3'和5'磷酸的堿基缺口(Gap)。4.**識(shí)別并切除受損堿基**：核酸內(nèi)切酶VIII可以識(shí)別并切除多種受損堿基，包括尿素、5,6-二羥基胸腺嘧啶、胸腺嘧啶乙二醇、5-羥基-5-甲內(nèi)酰脲、尿嘧啶乙二醇、6-羥基-5,6-二氫胸腺嘧啶和甲基羥丙二酰脲。5.**與EndonucleaseIII的區(qū)別**：雖然核酸內(nèi)切酶VIII與核酸內(nèi)切酶III相似，但核酸內(nèi)切酶VIII具有β和δ裂解酶活性，而核酸內(nèi)切酶III具有β裂解酶活性。6.**應(yīng)用領(lǐng)域**：核酸內(nèi)切酶VIII可以應(yīng)用于單細(xì)胞凝膠電泳、NGS建庫(kù)中DNA損傷修復(fù)、酶法合成DNA中釋放DNA鏈、堿洗脫，搭配尿嘧啶-DNA糖基化酶(UDG)進(jìn)行含U片段的克隆等。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I（VacciniaVirusDNATopoisomeraseI）在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟：1.**DNA載體連接**：-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接，特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT]，并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物，遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后，重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**：-在NGS建庫(kù)中，牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育，以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**：-**質(zhì)粒解旋**：將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**：將接頭A（含CCCTT序列）和接頭B（含5’OH）與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合，在37°C下孵育5-15分鐘，以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**：-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾，以防止自連接；接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴，再長(zhǎng)的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣，在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同，需要靈活運(yùn)用，并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。

在目標(biāo)蛋白的C末端添加His標(biāo)簽和Avi標(biāo)簽。有助于通過(guò)親和層析進(jìn)行蛋白純化，而Avi標(biāo)簽則可以用于生物素。

BstDNA聚合酶在等溫?cái)U(kuò)增中的優(yōu)勢(shì)主要包括以下幾點(diǎn)：1.**高靈敏度和擴(kuò)增效率**：BstDNA聚合酶具有鏈置換能力，能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地?cái)U(kuò)增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高，低至5copies目的基因可測(cè)，且始終能比競(jìng)品更快達(dá)到閾值，擴(kuò)增速率更快。2.**高dUTP耐受性**：BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性，在反應(yīng)體系中添加dUTP對(duì)BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴(kuò)增效率無(wú)影響，這使得它在防污染系統(tǒng)中表現(xiàn)出色。3.**快速擴(kuò)增**：使用BstDNA聚合酶的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)，如LAMP，可以在15-60分鐘內(nèi)實(shí)現(xiàn)109-1010倍的擴(kuò)增，顯示出快速的擴(kuò)增能力。4.**熱穩(wěn)定性**：BstDNA聚合酶具有較強(qiáng)的熱穩(wěn)定性，能在60-65℃的恒溫條件下保持活性，這使得它非常適合于不需要溫度循環(huán)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。5.**簡(jiǎn)化的反應(yīng)設(shè)置**：Bst3.0DNAPolymerase優(yōu)化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應(yīng)，簡(jiǎn)化了反應(yīng)設(shè)置，可以實(shí)現(xiàn)單酶RT-LAMP反應(yīng)。6.**抗抑制劑能力強(qiáng)**：Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴(kuò)增抑制劑中，包括dUTP，也能展現(xiàn)出強(qiáng)大的性能。

牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I是TOPO克隆技術(shù)的關(guān)鍵組分，該技術(shù)允許快速、簡(jiǎn)便地將PCR產(chǎn)物克隆到質(zhì)粒載體中。Recombinant Human SCF Protein

在PCR實(shí)驗(yàn)中，為了避免引物與已知序列的交叉反應(yīng)，從而確保實(shí)驗(yàn)的特異性，以下是一些關(guān)鍵的引物設(shè)計(jì)原則和策略：1.**選擇高保守性區(qū)域**：引物比較好設(shè)計(jì)在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi)，這樣可以確保引物與目標(biāo)序列的特異性結(jié)合。通過(guò)比較不同物種的同一基因序列，可以確定基因的保守區(qū)。2.**避免引物與非目標(biāo)序列的同源性**：設(shè)計(jì)引物時(shí)，應(yīng)避免與基因組中的重復(fù)序列、假基因或高同源性區(qū)域設(shè)計(jì)引物。可以通過(guò)BLAST等工具對(duì)引物進(jìn)行同源性分析，確保引物只與目標(biāo)序列結(jié)合。3.**引物長(zhǎng)度和GC含量**：引物長(zhǎng)度一般在15-30堿基之間，常用的是18-27bp。GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜。過(guò)高或過(guò)低的GC含量都不利于引發(fā)反應(yīng)，上下游引物的GC含量和Tm值應(yīng)保持接近。4.**避免引物的3'端錯(cuò)配**：引物3'端的堿基應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì)，特別是倒數(shù)第二個(gè)堿基，以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失敗。引物3'端比較好不要選擇A，比較好選擇T，因?yàn)楫?dāng)末位鏈為T時(shí)，錯(cuò)配的引發(fā)效率降低。5.**避免引物自身及引物之間的互補(bǔ)序列**：引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列，否則引物自身會(huì)折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)，影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。前后引物之間也不應(yīng)具有互補(bǔ)性，尤其應(yīng)避免3'端的互補(bǔ)重疊以防止引物二聚體的形成。Recombinant Human SCF Protein