Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease,簡(jiǎn)稱λExonuclease)是一種具有特定特性和應(yīng)用的酶,以下是其主要特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**特異性作用**:λExonuclease是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**酶切活性**:對(duì)單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**嗜磷酸性**:該酶具有非常強(qiáng)的嗜磷酸性,磷酸化的核酸鏈與非磷酸化的核酸鏈的切割效率相差達(dá)200倍以上。4.**切割效率**:Lambda核酸外切酶是一種具有高度持續(xù)性的堿性核酸外切酶,可以連續(xù)地將核酸切割成為單個(gè)堿基,切割比較高速率可以達(dá)到1000nt/S。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-生成單鏈PCR產(chǎn)物用于DNA測(cè)序。-DNA單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)分析。-滾環(huán)擴(kuò)增。-從雙鏈DNA片段生成單鏈DNA。-PCR產(chǎn)物的克隆。-質(zhì)粒制備凈化。6.**酶活性定義**:Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37oCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。Endo H,糖苷內(nèi)切酶 H 具有高度特異性的催化活性,它能夠特異性地水解 N - 連接寡糖鏈中兩個(gè)糖苷鍵。Recombinant Mouse CD180 Protein,His Tag
T5核酸外切酶在基因克隆中的優(yōu)勢(shì)主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**高效性**:T5核酸外切酶依賴性組裝(TEDA)方法在常規(guī)克隆中的效率與使用專有DNA聚合酶的商業(yè)In-Fusion方法相似,但高于使用T5核酸外切酶、PhusionDNA聚合酶和DNA連接酶的Gibson方法。2.**低成本**:TEDA方法每個(gè)反應(yīng)使用0.04U的T5核酸外切酶,價(jià)格為0.25美分,具有很高的成本效益。3.**簡(jiǎn)單性**:TEDA方法的反應(yīng)混合物非常簡(jiǎn)單,易于操作,這使得它在預(yù)算有限的實(shí)驗(yàn)室中尤其有用。4.**靈活性**:TEDA方法能夠組裝多個(gè)DNA片段,并在多個(gè)位點(diǎn)同時(shí)進(jìn)行定點(diǎn)誘變,提供了一種靈活的克隆和突變方法。5.**陽(yáng)性克隆率**:使用T5核酸外切酶的無(wú)縫克隆技術(shù)可以確保100%的陽(yáng)性克隆率,這提高了實(shí)驗(yàn)的成功率。6.**協(xié)同作用**:在無(wú)縫克隆中,T5核酸外切酶與Phusion高保真DNA聚合酶和TaqDNA連接酶協(xié)同作用,通過(guò)切割、填補(bǔ)和連接三個(gè)步驟,高效地完成DNA片段的連接。7.**減少污染**:T5核酸外切酶可以降解堿裂解提取質(zhì)粒中的變性DNA,減少超螺旋DNA的污染,提高DNA克隆和轉(zhuǎn)染效率。這些優(yōu)勢(shì)使得T5核酸外切酶成為基因克隆中一個(gè)非常有價(jià)值的工具,尤其是在需要高效、低成本和操作簡(jiǎn)便的實(shí)驗(yàn)環(huán)境中。Recombinant Human IFN alpha/beta R1 Protein,His-Avi TagPfu DNA Polymerase的優(yōu)化反應(yīng)條件:通過(guò)優(yōu)化Mg2?濃度和pH值,可提高Pfu DNA Polymerase的擴(kuò)增效率。
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種經(jīng)過(guò)改造的酶,它來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通過(guò)重組技術(shù)在大腸桿菌中表達(dá)并純化獲得。這種酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)中非常有用,如環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**等溫?cái)U(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很強(qiáng)的鏈置換能力,適用于多種等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),這些反應(yīng)通常在50-68°C之間進(jìn)行,比較好反應(yīng)溫度為65°C。2.**快速測(cè)序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速測(cè)序,特別是對(duì)于高GC含量的DNA模板或微量(納克量級(jí))DNA模板的測(cè)序。3.**全基因組擴(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因組擴(kuò)增(WGA),這是一種在不需要熱循環(huán)儀的情況下擴(kuò)增整個(gè)基因組DNA的技術(shù)。4.**高dUTP耐受性**:與BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增時(shí)不具有將dUTP摻入合成的DNA鏈的能力,這使得它在某些應(yīng)用中更具優(yōu)勢(shì)。
確保Cre重組酶只作用于特定細(xì)胞,主要通過(guò)以下幾種方式實(shí)現(xiàn):1.**組織特異性啟動(dòng)子**:-利用組織特異性啟動(dòng)子控制Cre重組酶的表達(dá),可以確保Cre酶只在特定組織或細(xì)胞中表達(dá)。這種方法通過(guò)將Cre基因置于特定細(xì)胞類型特有的啟動(dòng)子控制之下,實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre酶表達(dá)的精確控制。2.**誘導(dǎo)型Cre重組酶系統(tǒng)**:-通過(guò)使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)Cre活性的時(shí)間控制。在無(wú)他莫昔芬誘導(dǎo)時(shí),Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合,定位于細(xì)胞質(zhì)中;當(dāng)他莫昔芬給藥誘導(dǎo)時(shí),Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進(jìn)入細(xì)胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當(dāng)于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個(gè)由他莫昔芬控制的外源開(kāi)關(guān),使得體內(nèi)基因編輯更具時(shí)空靈活性。3.**藥物誘導(dǎo)的Cre系統(tǒng)**:-例如Tet-on系統(tǒng),通過(guò)四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來(lái)激起基因表達(dá)。在三重轉(zhuǎn)基因動(dòng)物中,rtTA在特定啟動(dòng)子的控制下表達(dá),多西環(huán)素與rtTA結(jié)合,Cre的表達(dá),導(dǎo)致固定的報(bào)告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動(dòng)子的腺相關(guān)病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細(xì)胞。
Cpf1是一種新發(fā)現(xiàn)的類2/型V CRISPR-Cas DNA內(nèi)切酶,在不同系統(tǒng)中顯示出一系列的活性。
蛋白A-微球菌核酸酶(pA-MNase)是一種特殊的融合蛋白,它結(jié)合了蛋白A和微球菌核酸酶(MNase,MicrococcalNuclease)的特性。以下是pA-MNase的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**融合表達(dá)產(chǎn)物**:pA-MNase是蛋白A與微球菌核酸酶MNase的融合表達(dá)產(chǎn)物,因此它同時(shí)具有ProteinA的抗體結(jié)合活性和MNase的核酸內(nèi)切酶活性。2.**雙重功能**:由于其雙重功能,pA-MNase常用于蛋白質(zhì)-DNA相互作用研究,特別是在ChIC(ChromatinImmunocleavage)和CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)技術(shù)中。3.**ProteinA的特性**:ProteinA是一種發(fā)現(xiàn)于金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)的細(xì)胞壁表面蛋白,分子量為42kDa,能特異性地與哺乳動(dòng)物免疫球蛋白(Immunoglobulin,Ig)結(jié)合,通常結(jié)合部位為免疫球蛋白的Fc區(qū)。4.**微球菌核酸酶(MNase)的特性**:MNase是一種核酸內(nèi)切酶,能夠降解核酸,常用于降解蛋白質(zhì)制備中存在的核酸,減少細(xì)胞裂解液的粘度,以及用于染色質(zhì)結(jié)構(gòu)分析和快速RNA測(cè)序。5.**反應(yīng)條件**:MNase的反應(yīng)條件包括1XMicrococcalNucleaseReactionBuffer,需要補(bǔ)充100μg/ml重組白蛋白,分子生物學(xué)級(jí),并在37°C下孵化。UBE2L3與其他E2酶的區(qū)別在于它具有特定的結(jié)構(gòu)特征,它包含一個(gè)高度保守的UBC結(jié)構(gòu)域,這是E2酶家族的標(biāo)志。Recombinant Rat VCC-1/CXCL17
Cas12a還可以高效地在一些重要的工業(yè)鏈霉菌菌株中產(chǎn)生編輯,這些菌株由于毒性而不能使用SpCas9進(jìn)行編輯。Recombinant Mouse CD180 Protein,His Tag
BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中都是常用的酶,但它們之間存在一些關(guān)鍵的不同點(diǎn):1.**來(lái)源和熱穩(wěn)定性**:-**TaqDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱菌Thermusaquaticus,具有很好的耐熱性,能夠承受PCR的熱變性步驟。-**BstDNA聚合酶**來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),同樣具有較高的熱穩(wěn)定性,適用于等溫?cái)U(kuò)增,如LAMP技術(shù),無(wú)需PCR熱循環(huán)。2.**酶活性**:-**TaqDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和5'-3'外切酶活性,但沒(méi)有3'-5'外切酶活性。這意味著它在DNA合成過(guò)程中可以校正一些錯(cuò)誤,但保真性相對(duì)較低。-**BstDNA聚合酶**具有5'-3'聚合酶活性和強(qiáng)鏈置換活性,但缺乏5'-3'外切酶活性。這使得它在等溫?cái)U(kuò)增中更為有效,尤其是在需要高保真度和快速擴(kuò)增的應(yīng)用中。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**TaqDNA聚合酶**主要用于PCR技術(shù),適用于各種DNA片段的擴(kuò)增,包括復(fù)雜模板和長(zhǎng)片段的擴(kuò)增。-**BstDNA聚合酶**特別適用于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,這些技術(shù)不需要溫度循環(huán),適用于快速、低成本的DNA擴(kuò)增。4.**擴(kuò)增速度和效率**:-**BstDNA聚合酶**在等溫?cái)U(kuò)增中顯示出比傳統(tǒng)TaqDNA聚合酶更快的擴(kuò)增速度和更高的產(chǎn)量,尤其是在優(yōu)化的LAMP反應(yīng)中。
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過(guò)添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測(cè)手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過(guò)程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...