5'DNA腺苷?;噭┖兄惺褂玫拿竿ǔ1环Q為腺苷酰化酶(Adenylase),這種酶能夠催化5'端磷酸化的單鏈DNA或RNA(pDNA或pRNA)轉(zhuǎn)換成5'端腺苷酰化DNA或RNA(AppDNA或AppRNA)。根據(jù)搜索結(jié)果,該酶的來源是嗜熱古細(xì)菌,在大腸桿菌中進行表達并純化而獲得。這種酶在反應(yīng)中將ATP分解成AMP和PPi,然后將AMP轉(zhuǎn)移到單鏈DNA的5'磷酸基團上,形成腺苷?;瘑捂淒NA,從而制備出腺苷?;宇^(linker)。此外,一些5'DNA腺苷?;噭┖兄惺褂玫拿甘荕thRNA連接酶(例如NEB#M2611A),這種酶也用于生成高產(chǎn)量的5'腺苷?;疍NA,并且操作簡便,具有超過95%的效率,無需凝膠純化即可完成單步反應(yīng)。MthRNA連接酶是一種已知能夠在65℃下有效工作的酶,有助于避免DNA的二級結(jié)構(gòu)對腺苷?;磻?yīng)的干擾。這些酶的高效率和特異性使得5'DNA腺苷?;噭┖性趩捂淒NA的5'端腺苷?;揎椫蟹浅S行ВS糜趍iRNA等3'端為羥基的RNA或單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等應(yīng)用中。在MAGE-A3基因序列的C末端添加His標(biāo)簽和Avi標(biāo)簽序列。His標(biāo)簽有助于通過金屬螯合親和層析進行蛋白純化。Recombinant Mouse PRNP Protein,hFc Tag
5'DNA腺苷?;噭┖械膯尾椒磻?yīng)是一種高效的酶促反應(yīng),用于在DNA分子的5'端添加一個腺苷酸(AMP)基團。這個過程通常涉及以下步驟:1.**準(zhǔn)備反應(yīng)混合物**:-根據(jù)試劑盒說明書,將所需的5'磷酸化的單鏈DNA(ssDNA或pDNA)、MthRNA連接酶(或其他腺苷?;福TP和相應(yīng)的緩沖液按比例混合。2.**孵育反應(yīng)**:-將混合好的反應(yīng)體系在指定的溫度(通常是65℃)下孵育一定的時間,以允許酶將ATP中的AMP部分轉(zhuǎn)移到DNA的5'端。3.**酶失活**:-反應(yīng)完成后,通常在85℃孵育5分鐘以失活腺苷?;福@一步是為了防止后續(xù)的去腺苷?;F(xiàn)象,確保反應(yīng)的穩(wěn)定性。4.**產(chǎn)物收集**:-由于轉(zhuǎn)化效率高,通常不需要進行凝膠純化步驟??梢酝ㄟ^乙醇沉淀等方法收集腺苷酰化后的DNA產(chǎn)物。5.**產(chǎn)物應(yīng)用**:-收集的腺苷?;疍NA可以直接用于后續(xù)的克隆、測序、連接或其他分子生物學(xué)實驗。6.**注意事項**:-確保所有操作在無RNA酶和無DNA酶的環(huán)境中進行,以避免污染。-使用時需注意反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性,確保底物、酶和ATP的比例適當(dāng)。單步反應(yīng)的優(yōu)勢在于簡化了操作流程,減少了樣品處理的復(fù)雜性,并且由于高轉(zhuǎn)化效率,避免了耗時的純化步驟,從而節(jié)省了時間和成本。One Step RT-qPCR SYBR Green Kit (UDG Plus)Phusion DNA Polymerase 應(yīng)在后面加入反應(yīng)體系中,以避免其3'-5'外切酶活性降解引物。
核酸(DNA和RNA)的可視化是分子生物學(xué)實驗中的一項基本技術(shù),用于檢測和分析核酸的存在、大小、數(shù)量和純度。以下是幾種常用的核酸可視化方法:1.**紫外線(UV)檢測**:-利用核酸分子對UV光的吸收特性,特別是在260nm波長下的吸收峰。-常用的UV檢測方法包括凝膠電泳后的凝膠成像系統(tǒng),可以觀察到凝膠中DNA或RNA的條帶。2.**熒光染料染色**:-使用熒光染料,如溴化乙錠(EthidiumBromide,EB)或SYBRGreen,這些染料可以與核酸結(jié)合并在特定波長的光照射下發(fā)出熒光。-EB常用于凝膠電泳后的DNA可視化,而SYBRGreen可用于實時定量PCR(qPCR)中DNA的檢測。3.**凝膠電泳**:-通過將核酸樣品加載到凝膠中,利用電場驅(qū)動核酸分子按大小分離,然后通過上述的UV或熒光染料進行可視化。4.**紫外交聯(lián)**:-某些熒光染料,如BODIPY或Cy5,可以通過紫外交聯(lián)直接結(jié)合到核酸上,提供更高的靈敏度和特異性。5.**銀染**:-一種比EB染色更靈敏的染色方法,通過銀離子與核酸的結(jié)合,然后還原成金屬銀,形成可見的黑色或棕色條帶。6.**化學(xué)發(fā)光檢測**:-使用特定的化學(xué)發(fā)光底物,如熒光素或魯米諾,與核酸結(jié)合后,在氧化過程中產(chǎn)生光信號。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶組成,具有以下主要應(yīng)用:1.**高通量測序建庫**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶可以用于快速構(gòu)建用于高通量測序的DNA文庫,通過其轉(zhuǎn)座酶活性實現(xiàn)DNA片段化,同時加上測序接頭,簡化了傳統(tǒng)DNA測序建庫的多步過程。2.**CUT&Tag技術(shù)**:這是一種新興的蛋白質(zhì)與DNA相互作用研究方法,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶利用ProteinA與特定抗體結(jié)合,將轉(zhuǎn)座酶帶到目標(biāo)蛋白附近進行DNA切割和標(biāo)簽添加,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)結(jié)合位點的高通量測序分析。CUT&Tag技術(shù)具有高特異性、低背景噪音、高靈敏度、良好重復(fù)性等優(yōu)點,適用于表觀遺傳學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶也可用于ATAC-seq實驗,這是一種研究染色質(zhì)可及性的方法,通過轉(zhuǎn)座酶在沒有核酸酶消化的情況下切割染色質(zhì)DNA,然后在切割位點加上測序接頭,進行后續(xù)的測序分析。4.**轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫**:有研究開發(fā)了基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5轉(zhuǎn)座酶直接作用于RNA/DNA雜交鏈,簡化了建庫過程,適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,提高了樣本的利用率和測序速度。
T4UvsX重組酶是一種來源于T4噬菌體的酶,屬于RecA/Rad51家族的同源體。這種重組酶在雙鏈DNA斷裂的修復(fù)以及復(fù)制叉重新啟動的過程中扮演著重要角色。T4UvsX重組酶能夠與其他DNA結(jié)合蛋白或輔助因子協(xié)同作用,與單鏈DNA形成核酸蛋白復(fù)合物。該復(fù)合物通過尋找與目標(biāo)DNA互補的區(qū)域進行雜交,以完成鏈置換反應(yīng),且此酶本身不具有核酸酶活性。產(chǎn)品應(yīng)用方面,T4UvsX重組酶主要用于等溫擴增技術(shù),如重組酶聚合酶擴增(RPA)技術(shù)。它在實驗中與T4UvsY重組酶、BsuDNA聚合酶(大片段)、T4基因32蛋白(gp32)等組分一同使用,以優(yōu)化RPA擴增反應(yīng)。T4UvsX重組酶的保存條件為-20℃,可保存3年,或者-20℃儲存有效期為2年,避免反復(fù)凍融。其儲存液通常包含Tris-HCl、KCl、DTT、EDTA和甘油等成分,以保持酶的穩(wěn)定性和活性。熱失活處理為60℃孵育10分鐘。在使用T4UvsX重組酶時,需要注意其保存液中甘油含量較高,建議單獨分裝保存,并且在操作時穿著實驗服并佩戴一次性手套,以確保安全。此外,該產(chǎn)品供科研使用,不應(yīng)用于臨床診斷。在一項研究中,比較了具有不同NLS融合的Cas9蛋白和Cas9 mRNA在斑馬魚基因組編輯中的效率。Recombinant Human IL-27RA/TCCR Protein,His Tag
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I具有特異性識別能力,能夠識別雙鏈DNA中的5'-(C/T)CCTT-3'序列。Recombinant Mouse PRNP Protein,hFc Tag
Lambda核酸外切酶(LambdaExonuclease)高度特異性地作用于5'端磷酸化的雙鏈DNA主要通過以下幾個方面實現(xiàn):1.**結(jié)構(gòu)特異性識別**:Lambda核酸外切酶具有識別特定DNA結(jié)構(gòu)的能力,特別是5'端磷酸化的雙鏈DNA。這種識別能力通常由酶的活性位點結(jié)構(gòu)決定,能夠與5'-磷酸基團形成特定的相互作用。2.**酶活性位點**:酶的活性位點含有氨基酸殘基,這些殘基能夠與5'-磷酸基團形成氫鍵或其他非共價相互作用,從而穩(wěn)定酶與DNA的結(jié)合。3.**切割機制**:Lambda核酸外切酶通過水解5'-磷酸二酯鍵來降解DNA鏈。它從5'端開始,逐個移除核苷酸,直到遇到非5'-磷酸化的末端或遇到結(jié)構(gòu)上的障礙。4.**低活性對非特異性底物**:對于5'-羥基(OH)末端的DNA或單鏈DNA,Lambda核酸外切酶的活性降低,因為這些底物缺乏與酶活性位點結(jié)合所需的特異性相互作用。5.**酶動力學(xué)**:Lambda核酸外切酶對5'-磷酸化雙鏈DNA的酶動力學(xué)參數(shù)(如Km和Vmax)與對非特異性底物的參數(shù)有差異,這反映了其對特異性底物的高親和力和高催化效率。6.**過程性(Processivity)**:一旦Lambda核酸外切酶結(jié)合到特異性底物上,它可以連續(xù)移除多個核苷酸,而不需要頻繁地與底物解離和重新結(jié)合,這增加了酶的效率。Recombinant Mouse PRNP Protein,hFc Tag
在分子生物學(xué)實驗中,PCR技術(shù)是基因擴增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實驗提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實時監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯誤摻入的堿基,提高擴增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯誤率更低,...