genovis的FucosEXO在生理緩沖液和中性pH值中具有活性,使其與大多數(shù)樣品相容。此外,F(xiàn)ucosEXO活性不依賴于任何可能影響LC-MS分析的輔因子,如BSA。根據(jù)底物的性質(zhì),F(xiàn)ucosEXO 可在 1 至 2 小時內(nèi)水解糖蛋白上的末端 α1-2,3,4 連接的巖藻糖殘基,而對于非常復(fù)雜的樣品可能需要更長的孵育時間。FucoseEXO也可固定在離心柱中,可快速方便地處理高達(dá)0.5mg的糖蛋白。使用離心柱形式,將糖蛋白樣品與固定化的FucosEXO樹脂一起孵育,然后在離心步驟中輕松收集消化的糖蛋白。將依那西普與GalactEXO固定化孵育60分鐘。湖北凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
我們測量了FucosEXO從一組dai表不同鍵的不同寡糖底物中釋放的巖藻糖。FucosEXO可有效釋放α1-2、α1-3和α1-4連接的巖藻糖,對α1-6連接的巖藻糖殘基沒有活Genovis的FucosEXO的底物特異性:巖藻糖以不同的鍵存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 連接的巖藻糖常見于 O-聚糖中,并作為 N-聚糖的天線巖藻糖基化,而 α1-6 連接的巖藻糖被發(fā)現(xiàn)是 N-聚糖he心的修飾。β1-3,4半乳糖的水解:Genovis的GalactEXO 是一種β-半乳糖苷酶混合物,可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-連接末端半乳糖。湖北固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究瑞典生物技術(shù)公司Genovis率先次提供IdeS工具酶等,用于mAb、ADC藥物的開發(fā)、生產(chǎn)和質(zhì)量控制。
OglyZOR 來源于口腔鏈球菌,在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽,分子量為 227 kDa。SialEXO來源于Akkermansia muciniphila,在大腸桿菌中表達(dá)。SialEXO酶含有His標(biāo)簽,組分的分子量分別為42 kDa和66 kDa。1.高效O-糖苷酶;2. 降低樣品異質(zhì)性,揭示潛在的關(guān)鍵蛋白質(zhì)修飾;3. 完全、穩(wěn)健地去除 O-糖he心 1 二糖。Genovis的凍干酶,用于水解糖蛋白上的he心1 O-聚糖。OglyZOR 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 個單位的小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。它需要去除唾液酸助劑才能發(fā)揮作用,因此與2000單位的SialEXO凍干一起提供。
對Genovis的ImpaRATOR處理的樣品的分析表明,ImpaRATOR很好地消化了所有三種底物并產(chǎn)生了相似的糖肽,但預(yù)期的聚糖種類不同。用ImpaRATOR處理的樣品比其他樣品含有更多的變異,因為每種肽都檢測到多種聚糖結(jié)構(gòu)。觀察到的聚糖種類主要是單唾液酸化和二唾液酸化he心1結(jié)構(gòu),這與依那西普的預(yù)期一致。用ImpaRATOR或OpeRATOR消化的SialEXO預(yù)處理樣品均產(chǎn)生具有裸核1結(jié)構(gòu)的肽,但攜帶在ImpaRATOR消化樣品中觀察到的Tn抗原的肽T205-P207除外。依那西普用 SialEXO 和 GalactEXO 預(yù)處理,然后用 ImpaRATOR 消化,得到含有 Tn 抗原的肽??傊?,這些數(shù)據(jù)證明了ImpaRATOR的高聚糖底物接受度。ImpaRATOR處理的依那西普顯示出與相應(yīng)的去唾液酸化OpeRATOR處理樣品略有不同的消化模式。例如,OpeRATOR在兩個O-糖基化氨基酸之間消化的效率比ImpaRATOR更有效。具有完整唾液酸或Tn抗原的依那西普被OpeRATOR消化得非常弱(數(shù)據(jù)未顯示)。并且該酶還在 α1-3 連接的末端 GalNAcs 上顯示出活性。
Genovis的PNGase F(肽 N-糖苷酶 F)是一種糖酰胺酶,可水解多肽天冬酰胺與所有哺乳動物天冬酰胺連接復(fù)合物、雜交或高甘露糖寡糖的內(nèi)層 GlcNAc 之間的酰胺鍵。該酶用于MS分析前的樣品制備,以降低蛋白質(zhì)異質(zhì)性并實現(xiàn)游離的聚糖分析,并研究N-聚糖的功能作用。1. 對所有哺乳動物N-聚糖的高效水解;2.對多種糖蛋白具有活性;3.可固定在即用型離心柱產(chǎn)品形式;4. 自動化友好型,96孔板,用于高通量 N-糖去除。Genovis的ImpaRATOR 是一種 O-糖依賴性蛋白酶,可消化攜帶粘蛋白型。O-聚糖的蛋白質(zhì),包括唾液酸化物質(zhì)、糖基化絲氨酸和 Thr 殘基的 N-末端。該酶產(chǎn)生攜帶 O-糖的糖肽,從而實現(xiàn) O-糖譜分析、位點占用測定和 O-糖肽圖譜以及使用 LC-MS 分析的中級方法。1. 特異性廣 - 接受多種 O-聚糖變體,包括唾液酸化物種;2. 可靠O-聚糖特異性蛋白酶 – 消化絲氨酸/蘇氨酸糖基化位點的 N 末端;3. 穩(wěn)健的消化,增強(qiáng)復(fù)雜生物制藥的表征。SialEXO和GalactEXO截斷O-聚糖后,應(yīng)用GalNAcEXO酶去除剩余的GalNAc殘基。遼寧固定化小柱形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
ImpaRATOR 來源于銅綠假單胞菌,在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽,分子量為 97 kDa。湖北凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
GalactEXO中的酶來源于Akkermansia muciniphila,并在大腸桿菌中表達(dá)。GalactEXO由兩種半乳糖苷酶組成,均帶有His標(biāo)簽,組分的分子量為87 kDa和109 kDa。用于水解糖蛋白上β1-3,4-連接半乳糖的凍干酶。Genovis的GalactEXO 凍干劑以凍干粉的形式提供,裝在 2000 單位小瓶中,用于在 2 mg 糖蛋白上水解 β1-3,4-連接的半乳糖。1. 用于方法開發(fā)的靈活格式;2. 可以結(jié)合酶以提高效率; 3. 適用于自動化工作流程;4. 即用型 - 只需加水即可!將混合物加載到GlycOCATCH上,洗滌樹脂,并用8M尿素洗脫結(jié)合的肽。純化后,在RP-LC-MS上分離樣品。數(shù)據(jù)顯示,糖苷酸肽的選擇性純化,攜帶he心1-O-聚糖。IgA 特異性 O-糖肽富集:IgA 抗體包含 N-連接的糖基化和重度 O-糖基化的鉸鏈區(qū)域。胰蛋白酶消化IgA后,將肽和genovis 的SialEXO的混合物加載到GlycOCATCH樹脂上,并用PBS和離心洗滌。用 8 M 尿素洗脫顯示預(yù)期的 O-糖基化鉸鏈肽富集,具有不同程度的糖基化。湖北凍干粉形式PNGaseF去糖基化酶蛋白質(zhì)組學(xué)研究
糖蛋白性能測試:O-聚糖的巖藻糖基化參與功能上重要的聚糖表位的合成,例如血型抗原和劉易斯結(jié)構(gòu)。分析用...
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