內(nèi)生菌共生于植物內(nèi)部,要獲得內(nèi)生菌首先需要破碎植物組織。植物組織和內(nèi)生菌在形態(tài)、硬度等性質(zhì)上均有差異,想要獲得更多內(nèi)生菌基因組DNA,對(duì)裂解介質(zhì)的選擇是難點(diǎn)。2、相對(duì)于植物基因組,雖然內(nèi)生菌包括細(xì)菌,***,放線菌等不同類型微生物,但其基因組*占微小部分單獨(dú)提取內(nèi)生菌DNA比較困難,提取到的是混合DNA,通過PCR才能鑒定。內(nèi)生菌DNA提取思路:STEP1破壞植物釋放菌體;STEP2破壞菌體釋放核酸;STEP3提取DNA。有沒有合適的土壤DNA提取的直銷公司。嘉定區(qū)FastDNA Spin Kit土壤DNA提取參數(shù)
實(shí)驗(yàn)的時(shí)候,有沒有遇到過實(shí)驗(yàn)結(jié)果不符合預(yù)期的情況,提取DNA的純度過低、濃度達(dá)不到預(yù)期或者是出現(xiàn)彌散現(xiàn)象。***給大家聊一聊一下其他同學(xué)遇到的問題,以及MP技術(shù)人員給出的解決方案,希望可以幫到大家,在以后的實(shí)驗(yàn)中順順利利~問題1:土壤樣品含水量過高怎么辦?解決思路:· 如果土壤樣品過濕,可先將樣本10,000 x g,離心30s,盡可能多的去除液體。問題2:DNA產(chǎn)量低怎么辦?解決思路:· 樣本微生物含量低:【1】增加樣本量【2】嘉定區(qū)FastDNA Spin Kit土壤DNA提取參數(shù)在線訂購(gòu)MP正規(guī)產(chǎn)品土壤DNA提取。
(a)土壤裂解液,其組成成分包括表面活性劑、螯合劑、pH緩沖劑; 所述表面活性劑為:十二烷基硫酸鈉、十二烷基磺酸鈉、月桂?;“彼徕c、聚乙二醇辛基苯基醚、TWEEN 20、TWEEN 40、TWEEN 60、TWEEN 80、NP 40、十六烷基三甲基溴化銨中的一種或兩種及以上的混合,所述表面活性劑的質(zhì)量濃度為1-100g/L,推薦的表面活性劑成分是十二烷基硫酸鈉或十二烷基磺酸鈉中的一種或兩種的混合,推薦的表面活性劑質(zhì)量濃度為1-10g/L; 所述螯合劑為乙二胺四乙酸二鈉、乙二胺四乙酸三鉀中的一種或兩種,所述離液鹽的濃度為1-100 mmol/L;
:沙漠土;Lane 5:陰性對(duì)照。圖:提取不同土壤基因組DNA PCR擴(kuò)增結(jié)果。M: 1kb plus DNA ladder;Lane 1/3/5/7: 酶切前;Lane 2/4/6/8: 酶切后;Lane 1&2:有機(jī)營(yíng)養(yǎng)士;Lane 3&4:花壇土;Lane 5&6:鹽堿土;Lane 78&8:沙漠土。圖:提取不同土壤基因組DNA用Apa I酶切結(jié)果。PART.03。選擇MP試劑盒的理由。MagBeads FastDNATM Kit for Soil:A260/A280更接近1.8, A260/A230更高, 提取純度高于平均水平,提取效果穩(wěn)定。DNA收率效果對(duì)比—濃度更高上海益啟,采購(gòu)?fù)寥繢NA提取的放心之選。
1.0視為提取效果良好。土壤類型:有機(jī)營(yíng)養(yǎng)土100mg、花壇土100mg、鹽堿土250mg、沙漠土250mg。提取方法:自動(dòng)化/手工、自動(dòng)化/手工、自動(dòng)化/手工、自動(dòng)化/手工。DNA收率(ng/mg樣本):130.25+4.95;196.08+3.92、19.92+0.95;24.43+0.74、11.75+0.37;13.43+0.39、2.47+0.13;2.97+0.13。A260/A280:1.84+0.00;1.98+0.02、1.86+0.01;1.85+0.02、1.87+0.02;1.90+0.01、1.85士0.00;1.91+0.03。A260/A230:1.23+0.02;1.08+0.01、1上海益啟生物的土壤DNA提取操作是否簡(jiǎn)易?徐匯區(qū)土壤DNA提取批發(fā)
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