CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),它們有一些關(guān)鍵的區(qū)別:1.**技術(shù)原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術(shù)利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結(jié)合來進(jìn)行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結(jié)合位點裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術(shù)則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復(fù)合物,留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進(jìn)行簡短的消化反應(yīng),在TF結(jié)合的MNase擴(kuò)散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復(fù)TF-DNA復(fù)合物。2.**操作步驟和簡便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題,如交聯(lián)導(dǎo)致的DNA和蛋白質(zhì)的化學(xué)修飾。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡化了操作步驟,使用磁珠固定細(xì)胞核,適用于新鮮和冷凍組織樣本,縮短了生成DNA測序文庫的時間(1-2天)。3.**背景信號和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產(chǎn)生的背景信號可能較高,因為它可能涉及到非特異性的DNA切割。
T5核酸外切酶在基因編輯中確實有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血?。–ML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時。Recombinant Cynomolgus IL-18BP Protein,His TagPhusion Master Mix (2×) 是一種即用型預(yù)混液包含dNTPs、Mg2?和優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液加入模板和引物可進(jìn)行反應(yīng)。
一、靈敏度與特異性該試劑采用 SYBR Green I 熒光染料,這種染料能夠特異性地結(jié)合到雙鏈 DNA 上,當(dāng) DNA 在 PCR 過程中被擴(kuò)增時,熒光信號也隨之增強(qiáng)。其靈敏度極高,即使在樣本中目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)極低的情況下,也能準(zhǔn)確地檢測到其擴(kuò)增信號。同時,通過優(yōu)化的反應(yīng)體系,有效減少了非特異性擴(kuò)增的產(chǎn)生,確保了實驗結(jié)果的特異性。例如,在對微量的病毒核酸進(jìn)行檢測時,SYBR Green qPCR Mix (2×, High ROX, UDG Plus) 能夠識別并擴(kuò)增目標(biāo)病毒基因,避免了其他非病毒核酸的干擾,為病原體的早期診斷提供了有力支持。二、高濃度 ROX 參考染料,穩(wěn)定可靠qPCR 實驗中,ROX 參考染料的作用不容小覷。SYBR Green qPCR Mix (2×, High ROX, UDG Plus) 中的高濃度 ROX 參考染料,能夠有效校正孔間熒光信號的差異,提高實驗結(jié)果的重復(fù)性和穩(wěn)定性。在多孔板實驗中,不同孔之間的熒光信號可能會因儀器的微小差異、加樣量的不均勻等因素而產(chǎn)生波動。高濃度的 ROX 參考染料如同一把標(biāo)尺,對這些波動進(jìn)行校正,使得實驗數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確可靠。無論是單次實驗還是大規(guī)模的樣本檢測,都能保證結(jié)果的一致性,為科研數(shù)據(jù)的統(tǒng)計分析提供了堅實基礎(chǔ)。
在分子生物學(xué)研究中,RNA的完整性和純度是影響實驗結(jié)果的重要因素。5×RNALoadingBuffer作為一種專為RNA非變性凝膠電泳設(shè)計的上樣緩沖液,憑借其獨特配方和性能,為RNA分析提供了可靠的工具。產(chǎn)品特點高效沉降與指示功能5×RNALoadingBuffer的主要成分包括甘油、EDTA、溴酚藍(lán)和二甲苯青。甘油的高密度特性能夠使RNA樣品在凝膠電泳中順利沉入加樣孔,而溴酚藍(lán)和二甲苯青則作為指示劑,幫助實時監(jiān)測電泳進(jìn)程。無RNase污染該緩沖液經(jīng)過DEPC(焦碳酸二乙酯)處理,確保無RNase污染,從而有效保護(hù)RNA樣品免受降解,保證實驗結(jié)果的可靠性。優(yōu)化的配方5×RNALoadingBuffer含有5mMEDTA,能夠螯合二價金屬離子,進(jìn)一步防止RNA在電泳過程中被降解。操作簡便使用時只需將RNA樣品與1/4體積的5×RNALoadingBuffer混合,即可直接上樣電泳。這種簡便的操作流程提高了實驗效率。適用性該緩沖液適用于多種類型的RNA樣品,包括小分子RNA和長鏈RNA,且在非變性條件下能夠保持RNA的天然結(jié)構(gòu)。穩(wěn)定的保存條件5×RNALoadingBuffer在-20℃條件下可保存兩年,室溫運輸也不會影響其性能,這為實驗室的長期使用提供了便利。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I的反應(yīng)溫度為37°C。在這個溫度下,酶的活性高,能夠有效地進(jìn)行DNA的切割和連接。
高靈敏度與特異性該試劑盒采用優(yōu)化的緩沖體系和新一代TaqDNA聚合酶,結(jié)合高效的逆轉(zhuǎn)錄酶,能夠在低濃度RNA樣本中實現(xiàn)高靈敏度的檢測。其特異性高,即使在復(fù)雜的樣本中,也能通過熔解曲線分析呈現(xiàn)單一峰,避免非特異性擴(kuò)增。防污染設(shè)計OneStepRT-qPCRSYBRGreenKit(UDGPlus)內(nèi)置dUTP/UDG防污染系統(tǒng),能夠有效降解含有尿嘧啶的PCR產(chǎn)物,防止實驗室氣溶膠污染對實驗結(jié)果的干擾。這一特性在病毒檢測和低豐度基因表達(dá)分析中尤為重要。操作簡便該試劑盒將逆轉(zhuǎn)錄和qPCR反應(yīng)整合在同一管中完成,避免了多次開蓋操作,減少了人為誤差和污染風(fēng)險。同時,預(yù)混液的設(shè)計使得實驗操作更加便捷,用戶只需加入引物和模板即可進(jìn)行反應(yīng)。示蹤染料輔助試劑盒中的反應(yīng)緩沖液含有惰性示蹤染料,通過顏色變化(如藍(lán)色與黃色混合后變?yōu)榫G色)直觀判斷樣本是否加入,提高了實驗操作的準(zhǔn)確性和可靠性。兼容性該試劑盒適用于多種qPCR儀器,并提供不同濃度的ROX校正染料,以滿足不同儀器的需求。通過工程化改造,如將FnCas12a與單鏈DNA外切酶融合,可以提高基因編輯效率,擴(kuò)大FnCas12a可以靶向的范圍 。Recombinant Human LEC/CCL16
CRISPR-Cas12a(以前稱為Cpf1)是一種類II型V型內(nèi)切酶,偏好富含胸腺嘧啶的原間隔短回文重復(fù)序列鄰近基序。Recombinant Human LEC/CCL16
SYBR Green qPCR Mix (2×):助力定量PCR實驗實時熒光定量PCR(qPCR)作為一種高效、靈敏的分子生物學(xué)技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因表達(dá)分析、病原體檢測、基因分型等領(lǐng)域。SYBR Green qPCR Mix (2×) 是一種專為qPCR設(shè)計的預(yù)混液,憑借其的性能和特點,成為分子生物學(xué)研究中的重要工具。產(chǎn)品特點SYBR Green qPCR Mix (2×) 是一種2倍濃縮的預(yù)混液,包含qPCR反應(yīng)所需的所有關(guān)鍵組分,如Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、緩沖液、SYBR Green I染料等。這種預(yù)混液的設(shè)計簡化了實驗操作流程,用戶只需加入模板和引物即可進(jìn)行反應(yīng)。其成分SYBR Green I染料能夠特異性結(jié)合雙鏈DNA,并在PCR擴(kuò)增過程中發(fā)出熒光信號,熒光強(qiáng)度與DNA擴(kuò)增產(chǎn)物的量成正比。這種實時監(jiān)測機(jī)制使得qPCR能夠精確地定量分析目標(biāo)基因的初始拷貝數(shù)。產(chǎn)品性能SYBR Green qPCR Mix (2×) 具有高靈敏度和特異性,能夠檢測低拷貝數(shù)的DNA模板,適用于多種復(fù)雜的樣本類型。其優(yōu)化的反應(yīng)體系和熱啟動Taq DNA聚合酶確保了快速、高效的擴(kuò)增效率,同時減少了非特異性產(chǎn)物的生成。Recombinant Human LEC/CCL16
在分子生物學(xué)實驗中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實驗提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實時監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯誤率更低,...