Cre重組酶在基因編輯中的操作主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**識(shí)別與結(jié)合**:-Cre重組酶首先識(shí)別并分別結(jié)合兩個(gè)LoxP序列的兩個(gè)反向重復(fù)序列,形成一個(gè)二聚體。2.**四聚體形成**:-兩個(gè)二聚體互相靠近,形成由四個(gè)Cre分子與兩個(gè)LoxP位點(diǎn)結(jié)合形成的四聚體復(fù)合物。3.**DNA切割與交換**:-Cre重組酶在每個(gè)LoxP位點(diǎn)的間隔序列中引導(dǎo)單鏈切割,產(chǎn)生帶有3’端羥基的斷裂。每個(gè)LoxP位點(diǎn)的兩個(gè)單鏈分別被切割。切割產(chǎn)生的自由3’端與對(duì)側(cè)的3’端進(jìn)行交換和重連,形成Holliday交叉結(jié)構(gòu)。4.**分子重組與解旋**:-Holliday交叉結(jié)構(gòu)通過Cre酶的作用被解旋并重組,形成新的重組產(chǎn)物。這個(gè)過程導(dǎo)致兩個(gè)LoxP位點(diǎn)之間的DNA序列被刪除、反轉(zhuǎn)或易位,具體效果取決于LoxP序列的排列方式(方向和位置)。5.**條件性基因編輯**:-通過建立特異性Cre小鼠,該小鼠中的Cre重組酶由特定啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng),可在特定細(xì)胞或組織或全身表達(dá)Cre重組酶。與帶有Lox位點(diǎn)的Flox小鼠雜交,子代中可以獲得既帶有Cre又帶有Flox基因的小鼠,實(shí)現(xiàn)條件性基因打靶(表達(dá)或敲除靶基因)。E2酶接收來自E1的激起泛素,并在E3酶的協(xié)助下將泛素分子轉(zhuǎn)移到靶蛋白上。Recombinant Cynomolgus MMP-9 Protein,His Tag
耐高鹽全能核酸酶(SaltActiveUltraNuclease)是一種重組非特異性核酸內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**來源與表達(dá)**:耐高鹽全能核酸酶來源于海洋微生物,通過基因工程改造在大腸桿菌(_Escherichiacoli_)中表達(dá)純化。2.**活性條件**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**病毒純化、疫苗生產(chǎn)**:作為宿主殘留核酸去除試劑,將宿主殘留核酸降至皮克(pg)級(jí)別,提高生物制品功效和安全性。-**蛋白和多糖類制藥工業(yè)**:用于去除核酸污染,降低細(xì)胞上清和細(xì)胞裂解液的粘度,提高蛋白純化效率及功能研究。-**防止細(xì)胞結(jié)團(tuán)**:有效防止細(xì)胞和疫苗研究中外周血單核細(xì)胞(PBMC)的結(jié)團(tuán)。4.**產(chǎn)品性質(zhì)**:-分子量:24.7kDa。-等電點(diǎn):9.61。-純度:≥99%。-酶活:250-300U/μL。-適溫度:37℃(工作范圍0-42℃)。-輔助因子:1-10mMMg2+。5.**儲(chǔ)存條件**:以無菌液體酶的形式提供,儲(chǔ)存于緩沖液(25mMTris-HCl,5mMMgCl2,500mMNaCl,50%Glycerol,pH7.5)中,無色透明液體。干冰運(yùn)輸,-15℃~-25℃保存,有效期2年。RNases抑制劑FnCas12a的雙鏈或單鏈DNA靶標(biāo)都能激發(fā)其反式剪切活性,即在形成三元復(fù)合物后,針對(duì)非特異序列ssDNA的剪切。
T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn):1.**識(shí)別錯(cuò)配DNA**:T7EI能夠識(shí)別并切割不完全配對(duì)的DNA、十字型結(jié)構(gòu)DNA、Holliday結(jié)構(gòu)或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點(diǎn)**:T7EI切割錯(cuò)配位點(diǎn)5'端的、第二或第三個(gè)磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對(duì)錯(cuò)配DNA的識(shí)別非常靈敏,能夠檢測(cè)并切割單堿基和多堿基的錯(cuò)配。4.**應(yīng)用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)導(dǎo)致的基因突變的鑒定。它通過識(shí)別錯(cuò)配DNA來幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標(biāo)效應(yīng)。5.**直接電泳檢測(cè)**:T7EI的產(chǎn)物可以直接通過電泳進(jìn)行檢測(cè),這使得它在實(shí)驗(yàn)操作中更為方便。6.**來源**:T7EI來源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)和T7核酸內(nèi)切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業(yè)上使用時(shí)成本較高,但它在大規(guī)模樣本測(cè)試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項(xiàng)**:T7EI能夠識(shí)別長(zhǎng)度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯(cuò)配DNA,但不能識(shí)別1bp的插入、缺失或突變。這些特點(diǎn)使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個(gè)非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的應(yīng)用中。
為了確保PCR實(shí)驗(yàn)中BstDNAPolymeraseI的活性比較大化,以下是一些關(guān)鍵的優(yōu)化措施:1.**反應(yīng)緩沖液**:使用適合BstDNAPolymeraseI的反應(yīng)緩沖液,如NEB提供的IsothermalAmplificationBufferIIPack,該緩沖液包含Tris-HCl、(NH4)2SO4、KCl、MgSO4和Tween®20,pH值為8.8,專為等溫?cái)U(kuò)增設(shè)計(jì)。2.**反應(yīng)條件**:BstDNAPolymeraseI的比較好反應(yīng)溫度通常在65°C左右。確保PCR儀能夠精確控制并保持這一溫度,以保證酶的活性和穩(wěn)定性。3.**酶的濃度**:根據(jù)反應(yīng)體系的需要調(diào)整BstDNAPolymeraseI的用量。過多的酶可能導(dǎo)致非特異性擴(kuò)增,而過少則可能降低擴(kuò)增效率。通常,一個(gè)單位的酶能夠在65°C下,30分鐘內(nèi)將25nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)。4.**Mg2+濃度**:Mg2+是DNA聚合酶活性的關(guān)鍵輔因子。其濃度對(duì)PCR反應(yīng)有影響,需要根據(jù)具體情況調(diào)整Mg2+濃度,以獲得比較好的擴(kuò)增效果。5.**dNTPs濃度**:dNTPs是DNA合成的基礎(chǔ)原料,其濃度約為200-300μM較為適宜。過高會(huì)增加非特異性擴(kuò)增。6.**引物設(shè)計(jì)**:設(shè)計(jì)特異性引物,通常長(zhǎng)度為18-30個(gè)堿基,Tm(熔解溫度)相近,以保證同時(shí)退火。7.**模板DNA的質(zhì)量和純度**:確保模板DNA無蛋白質(zhì)、RNA和其他雜質(zhì)的污染,這些雜質(zhì)可能會(huì)抑制酶的活性。Pfu DNA Polymerase的熱穩(wěn)定性和保真性使其在優(yōu)化PCR條件時(shí)更為靈活,比如在GC含量較高的模板中。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)與細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶的主要區(qū)別如下:1.**來源不同**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I來源于牛痘病毒,是一種真核生物病毒中的酶。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶則來源于原核生物,如大腸桿菌的ω蛋白等。2.**功能特性**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能夠解旋DNA的超螺旋結(jié)構(gòu),并且識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶,如大腸桿菌的ω蛋白,主要功能是催化DNA鏈斷開和結(jié)合的偶聯(lián)反應(yīng),以改變DNA的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。3.**活性條件**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I即使在Mg2+不存在的條件下也顯示活性。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶可能需要Mg2+等金屬離子作為輔因子來發(fā)揮活性。4.**作用的DNA鏈**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I能使正負(fù)兩方的超螺旋分子均形成松散型。-原核生物由來的DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I只作用負(fù)鏈的超螺旋分子。5.**共價(jià)鍵形成**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I與DNA形成共價(jià)連接,此酯鍵中所貯存的能量可能在切斷端的再結(jié)合上起著作用。-細(xì)菌DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶在原核生物中是游離型的5′-OH末端扣3′-磷酸末端與酶形成共價(jià)鍵。
使用 Tn5 轉(zhuǎn)座酶可以保證 DNA的 片段化的質(zhì)量,同時(shí)獲得的蛋白純度高、核酸殘留低,能夠?yàn)楹罄m(xù)的實(shí)驗(yàn)。Recombinant Human Notch 3 Protein,His-Avi Tag
激發(fā)的泛素被轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2的活性位點(diǎn)半胱氨酸殘基上,形成E2-泛素硫酯中間體。Recombinant Cynomolgus MMP-9 Protein,His Tag
BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)是一種來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillussubtilis)的DNA聚合酶。這種酶保留了BsuDNAPolymeraseI的5'-3'聚合酶活性,但缺失了5'-3'核酸外切酶結(jié)構(gòu)域,因此它具有鏈置換活性,可以用于重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)等恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。以下是BsuDNAPolymerase(LargeFragment,5U/μL)的一些關(guān)鍵特性和應(yīng)用:1.**活性定義**:在37°C條件下,30分鐘內(nèi)將10nmol的dNTP摻入酸不溶性物質(zhì)所需的酶量定義為1個(gè)活性單位(U)。2.**熱失活條件**:75°C,20分鐘。3.**酶保存液成分**:25mMTris-HCl,50mMNaCl,1mMDTT,0.1mMEDTA,50%Glycerol,pH7.4@25°C。4.**儲(chǔ)存條件**:-25~-15°C保存,有效期2年。5.**注意事項(xiàng)**:-由于缺乏3'-5'核酸外切酶活性,BsuDNAPolymerase(LargeFragment)不能切除3'未配對(duì)的突出末端,因而不適用于生成平齊末端。-25°C時(shí)BsuDNAPolymerase(LargeFragment)保留50%的活性,是同溫度下Klenow片段(3'-5'exo-)的兩倍。6.**應(yīng)用**:-隨機(jī)引物法標(biāo)記。-cDNA第二條鏈的合成。-單個(gè)dA的加尾。-鏈置換的DNA合成。Recombinant Cynomolgus MMP-9 Protein,His Tag
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測(cè)手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...