Lambda核酸外切酶（LambdaExonuclease，簡(jiǎn)稱λExonuclease）是一種具有特定特性和應(yīng)用的酶，以下是其主要特點(diǎn)和應(yīng)用：1.**特異性作用**：λExonuclease是一種5'→3'核酸外切酶，能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**酶切活性**：對(duì)單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低，不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**嗜磷酸性**：該酶具有非常強(qiáng)的嗜磷酸性，磷酸化的核酸鏈與非磷酸化的核酸鏈的切割效率相差達(dá)200倍以上。4.**切割效率**：Lambda核酸外切酶是一種具有高度持續(xù)性的堿性核酸外切酶，可以連續(xù)地將核酸切割成為單個(gè)堿基，切割比較高速率可以達(dá)到1000nt/S。5.**應(yīng)用領(lǐng)域**：-生成單鏈PCR產(chǎn)物用于DNA測(cè)序。-DNA單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)分析。-滾環(huán)擴(kuò)增。-從雙鏈DNA片段生成單鏈DNA。-PCR產(chǎn)物的克隆。-質(zhì)粒制備凈化。6.**酶活性定義**：Oneunitisdefinedastheamountofenzymerequiredtoproduce10nmolofacid-solubledeoxyribonucleotidefromdouble-strandedsubstrateinatotalreactionvolumeof50μlin30minutesat37oCin1XLambdaExonucleaseReactionBufferwith1μgsonicatedduplex[3H]-DNA。牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I具有解超螺旋的活性，可以解開(kāi)雙鏈閉合環(huán)狀DNA的超螺旋結(jié)構(gòu)，便于后續(xù)的酶切反應(yīng)。Recombinant Human IL-28B Protein

ExoIII（ExonucleaseIII）和Lambda核酸外切酶（λExonuclease）在DNA末端處理上的主要不同點(diǎn)如下：1.**作用方向**：-**ExoIII**：具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性，它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**：是一種5'→3'核酸外切酶，能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**：-**ExoIII**：適底物是平末端或5'末端突出的DNA，但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點(diǎn)產(chǎn)生單鏈缺口。由于對(duì)單鏈DNA無(wú)活性，因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**：適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA，對(duì)單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低，不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**：-**ExoIII**：對(duì)具有3'-突出末端(至少有4個(gè)堿基，且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無(wú)活性。-**Lambda核酸外切酶**：對(duì)5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍；對(duì)單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應(yīng)用場(chǎng)景**：-**ExoIII**：可以用于生產(chǎn)特定方向的單鏈DNA，將線性化DNA設(shè)計(jì)成為一端為不切割末端（3'突出端），另一端則設(shè)計(jì)為易切割末端（平端或5'突出端）。

提取的病毒核酸可以直接用于多種實(shí)驗(yàn)，主要包括：1.**實(shí)時(shí)熒光定量PCR（qPCR）**：這是一種常用的技術(shù)，可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量檢測(cè)。它通過(guò)實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR過(guò)程中的熒光信號(hào)來(lái)確定病毒核酸的數(shù)量。例如，病毒核酸檢測(cè)就是基于此技術(shù)，通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物和探針，對(duì)病毒的靶基因進(jìn)行定性檢測(cè)。2.**逆轉(zhuǎn)錄PCR（RT-PCR）**：這項(xiàng)技術(shù)用于檢測(cè)RNA病毒，通過(guò)將病毒RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA，然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增，以檢測(cè)病毒的存在。RT-PCR技術(shù)靈敏而且用途廣，可以用于檢測(cè)細(xì)胞、組織中RNA病毒的含量。3.**等溫?cái)U(kuò)增法**：包括環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增（LAMP）和切口延伸等溫?cái)U(kuò)增（NEAR），這些方法在恒溫條件下進(jìn)行，無(wú)需復(fù)雜的設(shè)備，適用于快速、現(xiàn)場(chǎng)的病毒核酸檢測(cè)。4.**數(shù)字PCR（dPCR）**：這是一種高度靈敏的技術(shù)，可以對(duì)病毒核酸進(jìn)行定量。它通過(guò)將樣本分配到成千上萬(wàn)的微小反應(yīng)室中，每個(gè)反應(yīng)室單獨(dú)進(jìn)行PCR擴(kuò)增，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)病毒核酸的精確計(jì)數(shù)。5.**核酸雜交技術(shù)**：如熒光原位雜交（FISH），可以用于檢測(cè)特定病毒核酸序列在細(xì)胞或組織中的存在和定位。

Lambda核酸外切酶（λExonuclease）在PCR產(chǎn)物的克隆中主要應(yīng)用在以下幾個(gè)方面：1.**單鏈DNA的生成**：-Lambda核酸外切酶可以用于從雙鏈DNA中生成單鏈DNA。由于該酶沿5'→3'方向逐步切去5'單核苷酸，底物是5'磷酸化的雙鏈DNA，因此可以用來(lái)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈，從而生成單鏈DNA，這對(duì)于某些克隆技術(shù)來(lái)說(shuō)是必要的步驟。2.**PCR產(chǎn)物的克隆**：-在克隆過(guò)程中，有時(shí)需要將PCR產(chǎn)物的5'端磷酸化，以便與載體連接。Lambda核酸外切酶可以消化非磷酸化的DNA，從而在一定程度上幫助準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物。3.**減少自身環(huán)化和非特異性連接**：-在連接反應(yīng)中，為了減少質(zhì)粒載體的自身環(huán)化，可以使用堿性磷酸酶處理質(zhì)粒DNA以去除5'磷酸基團(tuán)。而Lambda核酸外切酶可以消化5'端磷酸化的DNA，因此在某些情況下，它可以輔助減少PCR產(chǎn)物的自身環(huán)化，尤其是在PCR產(chǎn)物和質(zhì)粒載體的連接反應(yīng)中。4.**提高克隆效率**：-通過(guò)消化PCR產(chǎn)物中的一條鏈，Lambda核酸外切酶可以幫助減少PCR產(chǎn)物的非特異性連接，從而提高克隆的效率和準(zhǔn)確性。綜上所述，Lambda核酸外切酶在PCR產(chǎn)物的克隆中主要通過(guò)生成單鏈DNA、準(zhǔn)備適合克隆的PCR產(chǎn)物、減少自身環(huán)化和非特異性連接以及提高克隆效率等方面發(fā)揮作用。Endo H 是一種糖蛋白特異性的酶，主要作用于含有 N - 連接寡糖鏈的糖蛋白，對(duì)其他類型的生物大分子如核酸。

在PCR實(shí)驗(yàn)中，為了避免引物與已知序列的交叉反應(yīng)，從而確保實(shí)驗(yàn)的特異性，以下是一些關(guān)鍵的引物設(shè)計(jì)原則和策略：1.**選擇高保守性區(qū)域**：引物比較好設(shè)計(jì)在模板cDNA的保守區(qū)內(nèi)，這樣可以確保引物與目標(biāo)序列的特異性結(jié)合。通過(guò)比較不同物種的同一基因序列，可以確定基因的保守區(qū)。2.**避免引物與非目標(biāo)序列的同源性**：設(shè)計(jì)引物時(shí)，應(yīng)避免與基因組中的重復(fù)序列、假基因或高同源性區(qū)域設(shè)計(jì)引物。可以通過(guò)BLAST等工具對(duì)引物進(jìn)行同源性分析，確保引物只與目標(biāo)序列結(jié)合。3.**引物長(zhǎng)度和GC含量**：引物長(zhǎng)度一般在15-30堿基之間，常用的是18-27bp。GC含量一般為40%-60%，以45-55%為宜。過(guò)高或過(guò)低的GC含量都不利于引發(fā)反應(yīng)，上下游引物的GC含量和Tm值應(yīng)保持接近。4.**避免引物的3'端錯(cuò)配**：引物3'端的堿基應(yīng)嚴(yán)格要求配對(duì)，特別是倒數(shù)第二個(gè)堿基，以避免因末端堿基不配對(duì)而導(dǎo)致PCR失敗。引物3'端比較好不要選擇A，比較好選擇T，因?yàn)楫?dāng)末位鏈為T時(shí)，錯(cuò)配的引發(fā)效率降低。5.**避免引物自身及引物之間的互補(bǔ)序列**：引物自身不應(yīng)存在互補(bǔ)序列，否則引物自身會(huì)折疊成發(fā)夾結(jié)構(gòu)，影響引物與模板的復(fù)性結(jié)合。前后引物之間也不應(yīng)具有互補(bǔ)性，尤其應(yīng)避免3'端的互補(bǔ)重疊以防止引物二聚體的形成。泛素分子可以通過(guò)其內(nèi)部的賴氨酸殘基（如Lys48）與其他泛素分子形成多聚泛素鏈。Recombinant Mouse PLA2G1B Protein,hFc Tag

在某些糖蛋白的純化方案中，利用 Endo H 對(duì)糖鏈的特異性水解作用，去除糖蛋白上的糖鏈。Recombinant Human IL-28B Protein

不同的DNA聚合酶在PCR中的應(yīng)用差異主要體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面：1.**TaqDNAPolymerase**：是常用的DNA聚合酶之一，來(lái)源于Thermusaquaticus，具有較高的熱穩(wěn)定性及擴(kuò)增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性，即沒(méi)有校正功能，因此其保真性相對(duì)較低。Taq酶適合擴(kuò)增較短的DNA片段（通常不超過(guò)3kb），且在PCR產(chǎn)物的3'端帶A堿基，可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**：來(lái)源于Pyrococcusfuriosus，是一種高保真聚合酶，具有3'-5'外切酶活性，可以修復(fù)并糾正PCR反應(yīng)中的腺嘌呤堿基誤配，有效防止誤差累積。Pfu聚合酶適用于需要高度準(zhǔn)確的PCR擴(kuò)增和DNA測(cè)序。3.**VentDNAPolymerase**：來(lái)源于Thermuslitoralis，具有中等保真度，比Taq聚合酶高兩倍。它適用于GC含量高或復(fù)雜序列的PCR擴(kuò)增，具有較高的熱穩(wěn)定性，半衰期可達(dá)6.7小時(shí)。4.**KODDNAPolymerase**：來(lái)源于Thermococcuskodakaraensis，具有高保真性和高熱穩(wěn)定性，保真性是Taq的約50倍，同時(shí)具有合成速度快的特點(diǎn)，聚合速度約為普通PfuDNAPolymerase的5倍，特別適合于高保真地?cái)U(kuò)增6kb以內(nèi)的PCR產(chǎn)物。Recombinant Human IL-28B Protein