T7EndonucleaseI(T7EI)是一種特殊的DNA內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn):1.**識別錯配DNA**:T7EI能夠識別并切割不完全配對的DNA、十字型結(jié)構(gòu)DNA、Holliday結(jié)構(gòu)或交叉DNA以及異源雙鏈DNA。2.**切割位點(diǎn)**:T7EI切割錯配位點(diǎn)5'端的、第二或第三個磷酸二酯鍵。3.**靈敏度**:T7EI對錯配DNA的識別非常靈敏,能夠檢測并切割單堿基和多堿基的錯配。4.**應(yīng)用**:T7EI常用于CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)導(dǎo)致的基因突變的鑒定。它通過識別錯配DNA來幫助鑒定基因編輯是否成功以及是否有非目標(biāo)效應(yīng)。5.**直接電泳檢測**:T7EI的產(chǎn)物可以直接通過電泳進(jìn)行檢測,這使得它在實(shí)驗(yàn)操作中更為方便。6.**來源**:T7EI來源于大腸桿菌菌株,是一種麥芽糖結(jié)合蛋白(MBP)和T7核酸內(nèi)切酶I(T7EI)的融合蛋白。7.**成本效益**:盡管T7EI在商業(yè)上使用時成本較高,但它在大規(guī)模樣本測試中,尤其是在基因突變鑒定方面,提供了一種有效的篩選方法。8.**特殊注意事項(xiàng)**:T7EI能夠識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯配DNA,但不能識別1bp的插入、缺失或突變。這些特點(diǎn)使得T7EndonucleaseI成為基因突變鑒定中一個非常有用的工具,尤其是在CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)的應(yīng)用中。FnCas12a產(chǎn)品不含DNA內(nèi)切酶和外切酶,也不含RNA酶,保證了實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。Recombinant Human FGFR4 beta Protein,His-Avi Tag
T5核酸外切酶在基因編輯中確實(shí)有應(yīng)用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達(dá)或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達(dá)或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強(qiáng)基因編輯效果**:在另一項(xiàng)研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達(dá)和直接融合,其中強(qiáng)的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應(yīng)用于多種細(xì)胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細(xì)胞系和原代細(xì)胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細(xì)胞以及異種移植動物模型中展示了其應(yīng)用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進(jìn)行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構(gòu)建表達(dá)載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應(yīng)用可以增強(qiáng)編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時。Recombinant Human Ephrin-A4/EFNA4 Protein,hFc Tag由于Pfu DNA Polymerase 對引物的質(zhì)量要求較高,使用純度高的引物可以減少由于引物錯誤導(dǎo)致的非目標(biāo)突變。
磁珠法DNA凝膠回收試劑盒是一種用于從DNA瓊脂糖凝膠中回收特定DNA片段的實(shí)驗(yàn)室工具。與傳統(tǒng)的柱純化方法相比,磁珠法具有多個優(yōu)勢:1.**操作簡便快捷**:磁珠法DNA凝膠回收試劑盒的操作步驟通常包括凝膠的融化、DNA的結(jié)合、磁珠的洗滌和DNA的洗脫,整個過程可以在20分鐘內(nèi)完成。2.**高純度和高回收率**:磁珠法能夠穩(wěn)定、高效地從凝膠中回收DNA,純化所得的DNA可直接用于酶切、連接、轉(zhuǎn)化細(xì)菌、測序、PCR、雜交等后續(xù)操作。通?;厥章蔬_(dá)到60-80%,對于200bp以下小片段和10kb以上大片段的回收率有所下降。3.**適用性廣**:適用于100bp以上DNA片段的純化,對達(dá)到10kb片段DNA的純化也能保持較好的效果。4.**安全性高**:操作過程中不涉及酚/氯仿等有毒試劑,更加環(huán)保和安全。5.**靈活性**:可以根據(jù)實(shí)際狀況靈活調(diào)節(jié)磁珠用量,適應(yīng)不同體積和濃度的樣品處理。6.**自動化和高通量**:磁珠法純化試劑盒適合手工操作,也可用于自動化工作站或核酸自動提取儀,實(shí)現(xiàn)高通量操作。
T7EndonucleaseI(T7EI)在CRISPR/Cas9基因編輯中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在突變體檢測和基因編輯效率評估上。以下是T7EI在CRISPR/Cas9中的具體應(yīng)用步驟和特點(diǎn):1.**基因編輯效率評估**:-T7EI用于評估CRISPR-Cas9在給定的導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)上對細(xì)胞群體進(jìn)行基因編輯的效率。-通過PCR擴(kuò)增圍繞CRISPR導(dǎo)向RNA靶位點(diǎn)的基因組DNA,如果CRISPR-Cas9介導(dǎo)的非同源末端連接(NHEJ)修復(fù)事件引入了突變,變性和退火將形成突變型和野生型PCR擴(kuò)增子的異源雙鏈DNA。2.**突變體檢測**:-如果CRISPR/Cas9編輯成功在DNA上引入突變,則可與野生型DNA片段退火產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。T7EI可以識別該DNA上的不完全配對的DNA位點(diǎn)然后進(jìn)行雙鏈切割,通過瓊脂糖凝膠電泳即可顯示酶切后的條帶,從而半定量判定基因編輯效果。-T7EI能識別長度大于或等于2bp的插入、缺失或突變導(dǎo)致的錯配DNA,不能識別1bp的插入、缺失或突變。3.**實(shí)驗(yàn)步驟**:-收集細(xì)胞并提取基因組DNA,然后使用PCR擴(kuò)增期望編輯的基因組區(qū)域。擴(kuò)增子的長度建議為0.5-1kb。-對擴(kuò)增的DNA進(jìn)行變性和退火復(fù)性,以產(chǎn)生異質(zhì)雙鏈DNA。-使用T7EI酶處理退火后的DNA產(chǎn)物,在37℃孵育15分鐘。
不同的DNA聚合酶在PCR中的應(yīng)用差異主要體現(xiàn)在以下幾個方面:1.**TaqDNAPolymerase**:是常用的DNA聚合酶之一,來源于Thermusaquaticus,具有較高的熱穩(wěn)定性及擴(kuò)增效率。但它缺乏3'-5'核酸外切酶活性,即沒有校正功能,因此其保真性相對較低。Taq酶適合擴(kuò)增較短的DNA片段(通常不超過3kb),且在PCR產(chǎn)物的3'端帶A堿基,可直接用于TA克隆。2.**PfuDNAPolymerase**:來源于Pyrococcusfuriosus,是一種高保真聚合酶,具有3'-5'外切酶活性,可以修復(fù)并糾正PCR反應(yīng)中的腺嘌呤堿基誤配,有效防止誤差累積。Pfu聚合酶適用于需要高度準(zhǔn)確的PCR擴(kuò)增和DNA測序。3.**VentDNAPolymerase**:來源于Thermuslitoralis,具有中等保真度,比Taq聚合酶高兩倍。它適用于GC含量高或復(fù)雜序列的PCR擴(kuò)增,具有較高的熱穩(wěn)定性,半衰期可達(dá)6.7小時。4.**KODDNAPolymerase**:來源于Thermococcuskodakaraensis,具有高保真性和高熱穩(wěn)定性,保真性是Taq的約50倍,同時具有合成速度快的特點(diǎn),聚合速度約為普通PfuDNAPolymerase的5倍,特別適合于高保真地?cái)U(kuò)增6kb以內(nèi)的PCR產(chǎn)物。利用His標(biāo)簽通過親和層析從細(xì)胞裂解物中純化目標(biāo)蛋白,然后可能通過離子交換層析、等方法進(jìn)一步提純。1st Strand cDNA Synthesis Kit(RNase H-)
FnCas12a包含約1300個氨基酸,含有RuvC-like結(jié)構(gòu)域,同時具有DNA和RNA內(nèi)切酶的活性。Recombinant Human FGFR4 beta Protein,His-Avi Tag
qPCR(定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))檢測結(jié)果的準(zhǔn)確性可能受到多種因素的影響,以下是一些關(guān)鍵因素:1.**引物和探針設(shè)計(jì)**:引物和探針的設(shè)計(jì)質(zhì)量對qPCR的成功至關(guān)重要。不合適的引物設(shè)計(jì)可能導(dǎo)致低特異性或效率低的PCR反應(yīng)。引物的選擇應(yīng)考慮引物的長度、Tm值(解離溫度)和GC含量,以確保其適用于特定的核酸模板。2.**模板質(zhì)量和純度**:模板的質(zhì)量和純度直接影響qPCR的結(jié)果。污染或降解的模板可能導(dǎo)致偏差或虛假陽性結(jié)果。使用質(zhì)量高、純度高的DNA或RNA樣本是確保準(zhǔn)確和可靠的qPCR結(jié)果的關(guān)鍵。3.**反應(yīng)條件和緩沖液**:PCR反應(yīng)條件,包括溫度、離子濃度和緩沖液成分,必須嚴(yán)格控制。溫度梯度、離子濃度的變化或緩沖液成分的誤配可能會影響PCR效率。4.**反應(yīng)容器和耗材**:反應(yīng)管、微孔板、封閉膜等反應(yīng)容器和耗材的質(zhì)量也會影響qPCR結(jié)果。低質(zhì)量的材料可能導(dǎo)致樣本丟失或反應(yīng)失效。5.**標(biāo)準(zhǔn)曲線和校準(zhǔn)**:標(biāo)準(zhǔn)曲線的準(zhǔn)備和校準(zhǔn)非常重要。不正確的標(biāo)準(zhǔn)曲線可能導(dǎo)致定量結(jié)果的不準(zhǔn)確性。確保標(biāo)準(zhǔn)曲線中包含適當(dāng)?shù)膶φ諛悠?,并使用線性擬合來生成準(zhǔn)確的定量數(shù)據(jù)。6.**環(huán)境條件**:實(shí)驗(yàn)室溫度、濕度和空氣質(zhì)量都可以影響qPCR實(shí)驗(yàn)的結(jié)果。不穩(wěn)定的環(huán)境條件可能導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不穩(wěn)定性。Recombinant Human FGFR4 beta Protein,His-Avi Tag
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯誤率更低,...