CUT&RUN和ChIC是兩種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術,它們有一些關鍵的區(qū)別:1.**技術原理**:-**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:ChIC技術利用抗體將感興趣的蛋白與ProteinA-MNase相結(jié)合來進行DNA切割。ChIC的優(yōu)勢在于使用TF特異性抗體系住MNase,并只在結(jié)合位點裂解。-**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:CUT&RUN技術則是在核的輕微MNase處理后釋放單核小體和TF-DNA復合物,留下寡核小體。CUT&RUN通過在冰上進行簡短的消化反應,在TF結(jié)合的MNase擴散到周邊的基因組和裂解可接近的染色質(zhì)之前在上清中恢復TF-DNA復合物。2.**操作步驟和簡便性**:-**ChIC**:ChIC可能需要甲醛固定操作,這可能重新引入了ChIP-seq的一些問題,如交聯(lián)導致的DNA和蛋白質(zhì)的化學修飾。-**CUT&RUN**:CUT&RUN簡化了操作步驟,使用磁珠固定細胞核,適用于新鮮和冷凍組織樣本,縮短了生成DNA測序文庫的時間(1-2天)。3.**背景信號和信噪比**:-**ChIC**:ChIC產(chǎn)生的背景信號可能較高,因為它可能涉及到非特異性的DNA切割。
嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶I(BstDNAPolymeraseI)是一種熱穩(wěn)定的酶,它在高溫下(55-65°C)仍然保持活性,這使得它在分子生物學實驗中非常有用,尤其是在需要高溫反應的實驗中,如熱循環(huán)擴增(PCR)。BstDNAPolymeraseI具有以下特性:1.**熱穩(wěn)定性**:BstDNAPolymeraseI在高溫下具有較高的穩(wěn)定性,適用于高溫反應的實驗,如PCR。2.**3'到5'外切酶活性**:這種酶具有3'到5'外切酶活性,能夠切除DNA末端上的非特異性引物和雜交DNA,使其成為等溫擴增應用的理想酶。3.**耐鹽性**:BstDNAPolymeraseI在高鹽條件下仍能保持穩(wěn)定活性,這在一些特殊的PCR應用中非常有用。4.**等溫擴增**:由于其3'到5'外切酶活性,BstDNAPolymeraseI用于等溫擴增反應,如LAMP技術,這種技術能夠在恒溫下進行DNA擴增,無需繁瑣的溫度循環(huán)。5.**快速PCR**:由于其高溫穩(wěn)定性,BstDNAPolymeraseI也可用于快速PCR反應,縮短了實驗時間。6.**高GC含量模板擴增**:BstDNAPolymeraseI對高GC含量模板的擴增效果較好,因此在一些難擴增的模板中表現(xiàn)出色。Recombinant Rat NAP-2/CXCL7Pfu DNA Polymerase的熱穩(wěn)定性:Pfu DNA Polymerase在高溫下仍保持活性,適合高溫PCR反應。
Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL) 是一種從嗜熱脂肪芽孢桿菌(Thermophilic Geobacillus sp)DNA聚合酶I衍生的酶,缺乏5'-3'外切核酸酶活性。以下是關于Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL)的一些關鍵信息:來源和特性:Bst Plus DNA Polymerase 具有更強的5'-3' DNA聚合酶活性、鏈置換活性和dUTP耐受性,適合用于抗污染的等溫擴增反應,如LAMP和CPA等。應用:主要應用于等溫DNA擴增,包括環(huán)介導等溫擴增(LAMP)和其他等溫擴增技術。規(guī)格:活性定義:1 U指的是在65°C下30分鐘內(nèi)將10 nmol的dNTP整合到酸不溶物質(zhì)中的酶的量。溶液成分:包含10 mmol/L Tris-HCl、50 mmol/L KCl、0.1 mmol/L EDTA、1 mmol/L DTT、0.1% Triton X-100、50% 甘油,pH 7.5 @ 25℃。產(chǎn)品形式:提供的產(chǎn)品包括Hieff® Bst Plus DNA Polymerase (40 U/μL),貨號14402ES,以及凍干粉形式的產(chǎn)品,貨號14405ES,不含甘油。靈敏度和穩(wěn)定性:Bst Plus DNA Polymerase 具有高靈敏度,低至5copies目的基因可測,且在飛克(fg)級別的模板量下也能快速達到閾值。在37°C下,該酶可以保持相對穩(wěn)定的效應長達5天,并且在-20℃下可以穩(wěn)定保存2年。儲存條件:建議在-25℃至-15℃下儲存,以保持產(chǎn)品活性,并避免反復凍融。
T5核酸外切酶在基因編輯中確實有應用,并且具有一些優(yōu)勢:1.**提高編輯效率**:根據(jù)一篇研究文章,T5核酸外切酶可以與CRISPR/Cas系統(tǒng)共表達或融合,以提高基因編輯的效率。這種共表達或融合可以增加indel(插入和缺失)頻率,盡管增加的幅度可能不大。2.**增強基因編輯效果**:在另一項研究中,通過使用螺旋-螺旋二聚體肽(coiled-coilpeptides)將T5核酸外切酶招募到Cas9或Cas12a蛋白上,可以提高基因編輯的效率,這種方法被稱為CCExo(CRISPR-Coiled-coil-Exonuclease)。這種招募方式優(yōu)于共表達和直接融合,其中強的親和力CC對顯示出高的突變頻率和刪除長度。3.**應用于多種細胞類型**:CCExo系統(tǒng)在多種細胞系和原代細胞中都能有效地提高基因失活效率,并且在慢性髓性白血病(CML)患者的原代細胞以及異種移植動物模型中展示了其應用潛力,這表明CCExo方法可能成為CML和其他遺傳性疾病的潛在選擇。T5核酸外切酶與CRISPR核酸酶蛋白進行融合,并引入了核定位信號(NLS)序列以構建表達載體,用于基因編輯。綜上所述,T5核酸外切酶在基因編輯中的應用可以增強編輯效率和效果,尤其是在與CRISPR/Cas系統(tǒng)結(jié)合使用時。Probe qPCR Mix (2×) 支持多重qPCR,即在單個反應中同時檢測多個靶標基因 。
確保Cre重組酶只作用于特定細胞,主要通過以下幾種方式實現(xiàn):1.**組織特異性啟動子**:-利用組織特異性啟動子控制Cre重組酶的表達,可以確保Cre酶只在特定組織或細胞中表達。這種方法通過將Cre基因置于特定細胞類型特有的啟動子控制之下,實現(xiàn)對Cre酶表達的精確控制。2.**誘導型Cre重組酶系統(tǒng)**:-通過使用Cre-ERT(雌素受體突變體與Cre重組酶的融合蛋白),可以實現(xiàn)對Cre活性的時間控制。在無他莫昔芬誘導時,Cre-ERT與熱激蛋白Hsp90結(jié)合,定位于細胞質(zhì)中;當他莫昔芬給藥誘導時,Hsp90脫離Cre-ERT,使Cre-ERT進入細胞核發(fā)揮基因重組的作用。這種系統(tǒng)相當于為Cre-Lox系統(tǒng)加裝了一個由他莫昔芬控制的外源開關,使得體內(nèi)基因編輯更具時空靈活性。3.**藥物誘導的Cre系統(tǒng)**:-例如Tet-on系統(tǒng),通過四環(huán)素或其衍生物多西環(huán)素的添加來激起基因表達。在三重轉(zhuǎn)基因動物中,rtTA在特定啟動子的控制下表達,多西環(huán)素與rtTA結(jié)合,Cre的表達,導致固定的報告基因重組。4.**AAV遞送Cre**:-利用包含組織特異性啟動子的腺相關病毒(AAV)載體可以選擇性地將Cre重組酶遞送至特定細胞。
泛素從E1轉(zhuǎn)移到泛素結(jié)合酶E2的活性位點半胱氨酸殘基上,形成E2-泛素硫酯中間體。Recombinant Cynomolgus LILRB1/CD85j/ILT2 Protein,His Tag
使用 Tn5 轉(zhuǎn)座酶可以保證 DNA的 片段化的質(zhì)量,同時獲得的蛋白純度高、核酸殘留低,能夠為后續(xù)的實驗。NAP-2/CXCL7,Rat
qPCR(定量聚合酶鏈式反應)檢測結(jié)果的準確性可能受到多種因素的影響,以下是一些關鍵因素:1.**引物和探針設計**:引物和探針的設計質(zhì)量對qPCR的成功至關重要。不合適的引物設計可能導致低特異性或效率低的PCR反應。引物的選擇應考慮引物的長度、Tm值(解離溫度)和GC含量,以確保其適用于特定的核酸模板。2.**模板質(zhì)量和純度**:模板的質(zhì)量和純度直接影響qPCR的結(jié)果。污染或降解的模板可能導致偏差或虛假陽性結(jié)果。使用質(zhì)量高、純度高的DNA或RNA樣本是確保準確和可靠的qPCR結(jié)果的關鍵。3.**反應條件和緩沖液**:PCR反應條件,包括溫度、離子濃度和緩沖液成分,必須嚴格控制。溫度梯度、離子濃度的變化或緩沖液成分的誤配可能會影響PCR效率。4.**反應容器和耗材**:反應管、微孔板、封閉膜等反應容器和耗材的質(zhì)量也會影響qPCR結(jié)果。低質(zhì)量的材料可能導致樣本丟失或反應失效。5.**標準曲線和校準**:標準曲線的準備和校準非常重要。不正確的標準曲線可能導致定量結(jié)果的不準確性。確保標準曲線中包含適當?shù)膶φ諛悠罚⑹褂镁€性擬合來生成準確的定量數(shù)據(jù)。6.**環(huán)境條件**:實驗室溫度、濕度和空氣質(zhì)量都可以影響qPCR實驗的結(jié)果。不穩(wěn)定的環(huán)境條件可能導致實驗結(jié)果的不穩(wěn)定性。NAP-2/CXCL7,Rat
在分子生物學實驗中,PCR技術是基因擴增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實驗提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應緩沖液以及用于實時監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯誤摻入的堿基,提高擴增產(chǎn)物的準確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯誤率更低,...