磁珠法提取的DNA通常指的是通過(guò)磁珠吸附技術(shù)從樣本中純化得到的核酸,而基因組DNA(gDNA)是指一個(gè)生物體細(xì)胞核中包含的全套遺傳信息的DNA。兩者的主要區(qū)別在于:1.**來(lái)源和組成**:-磁珠法提取的DNA可以是基因組DNA,也可以是質(zhì)粒DNA、線粒體DNA等其他類(lèi)型的DNA。它是一個(gè)廣的概念,指的是通過(guò)磁珠法技術(shù)提取的任何類(lèi)型的DNA。-基因組DNA特指一個(gè)生物體細(xì)胞核中的DNA,包含了所有的基因信息,以及可能的非編碼區(qū)域。它通常包含了大量的堿基對(duì),如人類(lèi)基因組由大約30億個(gè)堿基對(duì)組成。2.**純度和應(yīng)用**:-磁珠法提取的DNA的純度和質(zhì)量取決于提取過(guò)程中的裂解、吸附、洗滌和洗脫步驟,以及磁珠的質(zhì)量和操作條件。高質(zhì)量的磁珠法提取的DNA可以用于多種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如PCR、克隆、測(cè)序等。-基因組DNA的提取通常需要考慮其完整性和純度,以確保后續(xù)實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性。基因組DNA提取的難點(diǎn)在于血液樣本成分復(fù)雜,且白細(xì)胞體積占比低,因此提取純化難度較高。3.**提取方法**:-磁珠法提取DNA是一種高效、快速的核酸提取技術(shù),它利用磁珠表面修飾的特定官能團(tuán)與核酸的特異性結(jié)合,通過(guò)外加磁場(chǎng)實(shí)現(xiàn)核酸與雜質(zhì)的快速分離。Cas12a不僅具有順式切割活性,還具備獨(dú)特的反式切割活性,這使得它能夠無(wú)差別地裂解附近的單鏈DNA。Mouse FGF-16
pA-MNase(蛋白A-微球菌核酸酶)在以下實(shí)驗(yàn)中特別有用:1.**ChIC(ChromatinImmunocleavage)**:這是一種用于研究蛋白質(zhì)-DNA相互作用的技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在免疫沉淀后切割染色質(zhì)DNA,以分析特定蛋白質(zhì)與DNA的結(jié)合位點(diǎn)。2.**CUT&RUN(CleavageUnderTargetsandReleaseUsingNuclease)**:這是一種蛋白質(zhì)-基因組互作研究技術(shù),pA-MNase在此技術(shù)中用于在目標(biāo)蛋白質(zhì)被抗體識(shí)別后,通過(guò)核酸酶活性切割附近的DNA,從而釋放與目標(biāo)蛋白質(zhì)相互作用的DNA片段。CUT&RUN技術(shù)相比傳統(tǒng)的ChIP-Seq具有實(shí)驗(yàn)周期短、信噪比高、可重復(fù)性好以及細(xì)胞投入量低的優(yōu)勢(shì),尤其適用于早期胚胎發(fā)育、干細(xì)胞、**以及表觀遺傳學(xué)等研究領(lǐng)域。3.**染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)**:pA-MNase在染色質(zhì)免疫沉淀實(shí)驗(yàn)中用于染色質(zhì)片段化,它在核小體間DNAlinker上進(jìn)行切割保持了核小體的完整性,并且由于其溫和的酶解條件,消除了超聲功率的可變性和超聲過(guò)程中染色質(zhì)乳化所帶來(lái)的負(fù)面影響。4.**去除核酸污染**:pA-MNase也可用于去除細(xì)胞裂解液中的核酸,以減少樣品的粘度,這對(duì)于后續(xù)的蛋白質(zhì)分析實(shí)驗(yàn)尤為重要。
在DNA提取過(guò)程中避免RNA污染的關(guān)鍵在于采取一系列措施來(lái)確保RNA被有效去除或降解,同時(shí)保護(hù)DNA的完整性和純度。以下是一些確保DNA提取過(guò)程中避免RNA污染的策略:1.**使用專門(mén)的DNA提取試劑盒**:選擇高質(zhì)量的DNA提取試劑盒,這些試劑盒通常已經(jīng)包含了防止RNA污染的措施,如特定的裂解液和純化步驟,能夠有效去除RNA。2.**加入RNA酶(RNase)處理**:在DNA提取過(guò)程中加入RNase處理步驟,可以有效地去除殘留的RNA污染。RNase是一種能夠特異性降解RNA的酶,可以在不影響DNA完整性的前提下去除RNA污染。3.**優(yōu)化實(shí)驗(yàn)操作步驟**:在破碎細(xì)胞時(shí),選擇合適的破碎方法和破碎時(shí)間,避免過(guò)度破碎導(dǎo)致RNA的釋放;在DNA純化階段,控制好離心速度和時(shí)間,避免RNA的沉淀。4.**使用無(wú)RNase的試劑和耗材**:使用經(jīng)過(guò)RNase-free處理的實(shí)驗(yàn)器材和試劑,確保實(shí)驗(yàn)過(guò)程中不會(huì)引入外源性RNA污染。5.**嚴(yán)格控制實(shí)驗(yàn)環(huán)境**:保持實(shí)驗(yàn)室臺(tái)面和工作區(qū)域干凈無(wú)塵,定期對(duì)實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行消殺,避免RNA酶污染。6.**個(gè)人防護(hù)和操作規(guī)范**:在處理DNA樣品時(shí),佩戴無(wú)菌手套和口罩,以減少呼吸道和皮膚污染的風(fēng)險(xiǎn)。使用不同的工具處理不同的樣品,或者在處理前后徹底清洗工具,避免交叉污染。
BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種經(jīng)過(guò)改造的酶,它來(lái)源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus)DNA聚合酶I,通過(guò)重組技術(shù)在大腸桿菌中表達(dá)并純化獲得。這種酶具有5'→3'的DNA聚合酶活性,但不具有5'→3'的核酸外切酶活性,因此它在等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng)中非常有用,如環(huán)介導(dǎo)的等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)和滾環(huán)擴(kuò)增(RCA)等。以下是BstDNAPolymerase,LargeFragment的一些關(guān)鍵特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**等溫?cái)U(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有很強(qiáng)的鏈置換能力,適用于多種等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),這些反應(yīng)通常在50-68°C之間進(jìn)行,比較好反應(yīng)溫度為65°C。2.**快速測(cè)序**:由于其高聚合酶活性,BstDNAPolymerase,LargeFragment可以用于快速測(cè)序,特別是對(duì)于高GC含量的DNA模板或微量(納克量級(jí))DNA模板的測(cè)序。3.**全基因組擴(kuò)增**:BstDNAPolymerase,LargeFragment也可用于全基因組擴(kuò)增(WGA),這是一種在不需要熱循環(huán)儀的情況下擴(kuò)增整個(gè)基因組DNA的技術(shù)。4.**高dUTP耐受性**:與BstDNAPolymerase2.0相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment在進(jìn)行等溫?cái)U(kuò)增時(shí)不具有將dUTP摻入合成的DNA鏈的能力,這使得它在某些應(yīng)用中更具優(yōu)勢(shì)。Cas12a還可以高效地在一些重要的工業(yè)鏈霉菌菌株中產(chǎn)生編輯,這些菌株由于毒性而不能使用SpCas9進(jìn)行編輯。
耐高鹽全能核酸酶(SaltActiveUltraNuclease)是一種重組非特異性核酸內(nèi)切酶,具有以下特點(diǎn)和應(yīng)用:1.**來(lái)源與表達(dá)**:耐高鹽全能核酸酶來(lái)源于海洋微生物,通過(guò)基因工程改造在大腸桿菌(_Escherichiacoli_)中表達(dá)純化。2.**活性條件**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**病毒純化、疫苗生產(chǎn)**:作為宿主殘留核酸去除試劑,將宿主殘留核酸降至皮克(pg)級(jí)別,提高生物制品功效和安全性。-**蛋白和多糖類(lèi)制藥工業(yè)**:用于去除核酸污染,降低細(xì)胞上清和細(xì)胞裂解液的粘度,提高蛋白純化效率及功能研究。-**防止細(xì)胞結(jié)團(tuán)**:有效防止細(xì)胞和疫苗研究中外周血單核細(xì)胞(PBMC)的結(jié)團(tuán)。4.**產(chǎn)品性質(zhì)**:-分子量:24.7kDa。-等電點(diǎn):9.61。-純度:≥99%。-酶活:250-300U/μL。-適溫度:37℃(工作范圍0-42℃)。-輔助因子:1-10mMMg2+。5.**儲(chǔ)存條件**:以無(wú)菌液體酶的形式提供,儲(chǔ)存于緩沖液(25mMTris-HCl,5mMMgCl2,500mMNaCl,50%Glycerol,pH7.5)中,無(wú)色透明液體。干冰運(yùn)輸,-15℃~-25℃保存,有效期2年。使用體外轉(zhuǎn)錄技術(shù)合成gRNA,確保gRNA的質(zhì)量和純度,這對(duì)后續(xù)實(shí)驗(yàn)的成功至關(guān)重要 。Recombinant Human CD24 Protein,GST Tag
Pfu DNA Polymerase的長(zhǎng)片段擴(kuò)增能力:Pfu DNA Polymerase能夠高效擴(kuò)增長(zhǎng)片段DNA,適合復(fù)雜基因組研究。Mouse FGF-16
耐高鹽全能核酸酶與一般核酸酶的主要區(qū)別體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面:1.**鹽耐受性**:-**耐高鹽全能核酸酶**:具有較高鹽濃度耐受性,在150-900mM鹽濃度范圍內(nèi)有效,尤其在600-700mM鹽濃度下活性比較好。-**一般核酸酶**:大多數(shù)全能核酸酶在高鹽環(huán)境下會(huì)失活,酶切效果降低。2.**活性條件**:-**耐高鹽全能核酸酶**:在0.5MNaCl條件下具有比較好活性,這使得它在高鹽環(huán)境下也能保持高效。-**一般核酸酶**:可能在低鹽或無(wú)鹽條件下活性更高,但在高鹽條件下活性受限。3.**應(yīng)用領(lǐng)域**:-**耐高鹽全能核酸酶**:廣泛應(yīng)用于生產(chǎn)工藝流程中高鹽環(huán)境下核酸污染去除,如病毒純化、疫苗生產(chǎn)、蛋白和多糖類(lèi)制藥工業(yè)等。-**一般核酸酶**:可能更多用于一般的分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn),如DNA或RNA的降解,但不特別針對(duì)高鹽環(huán)境。4.**酶切效果**:-**耐高鹽全能核酸酶**:能夠有效去除核酸殘留,將所有類(lèi)型的DNA和RNA降解為3~5個(gè)堿基片段。-**一般核酸酶**:酶切效果可能受到高鹽環(huán)境的影響,導(dǎo)致效率降低。5.**pH范圍**:-**耐高鹽全能核酸酶**:具有寬泛的pH范圍(7.0-11.0),在這一范圍內(nèi)保持活性。-**一般核酸酶**:可能具有更窄的pH活性范圍。Mouse FGF-16
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過(guò)添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測(cè)手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過(guò)程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...