BstDNAPolymerase,LargeFragment(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶大片段)是一種常用于分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的酶,特別是在等溫DNA擴(kuò)增技術(shù)中。以下是一些關(guān)于BstDNAPolymerase,LargeFragment的關(guān)鍵信息:1.**來源**:這種酶來源于嗜熱脂肪芽孢桿菌(Bacillusstearothermophilus),是一種熱穩(wěn)定的DNA聚合酶。2.**活性**:BstDNAPolymerase,LargeFragment具有5'到3'的DNA聚合酶活性,并且具有鏈置換活性,這使得它能夠用于等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng),如環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)。3.**熱穩(wěn)定性**:由于其嗜熱特性,BstDNAPolymerase,LargeFragment能夠在較高的溫度下保持活性,通常在60-65°C。4.**應(yīng)用**:-**等溫?cái)U(kuò)增**:用于LAMP和其他等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),這些技術(shù)不需要傳統(tǒng)的熱循環(huán)儀。-**全基因組擴(kuò)增**:用于快速擴(kuò)增少量DNA樣本,以進(jìn)行進(jìn)一步的分析。-**突變檢測(cè)**:在某些情況下,用于檢測(cè)特定基因的突變。5.**優(yōu)點(diǎn)**:-**高保真度**:與某些其他DNA聚合酶相比,BstDNAPolymerase,LargeFragment具有較高的保真度。-**快速擴(kuò)增**:等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)可以在短時(shí)間內(nèi)快速產(chǎn)生大量DNA。E2酶接收來自E1的激起泛素,并在E3酶的協(xié)助下將泛素分子轉(zhuǎn)移到靶蛋白上。Recombinant Human LIGHT/TNFSF14(His Tag)
ExoIII(ExonucleaseIII)和Lambda核酸外切酶(λExonuclease)在DNA末端處理上的主要不同點(diǎn)如下:1.**作用方向**:-**ExoIII**:具有3'→5'外切脫氧核糖核酸酶活性,它從DNA鏈的3'-OH末端逐步切去單核苷酸。-**Lambda核酸外切酶**:是一種5'→3'核酸外切酶,能選擇性地沿5'→3'方向消化5'端磷酸化的雙鏈DNA。2.**底物特異性**:-**ExoIII**:適底物是平末端或5'末端突出的DNA,但也可以作用于雙鏈DNA切刻位點(diǎn)產(chǎn)生單鏈缺口。由于對(duì)單鏈DNA無活性,因此難以切割3'突出末端。-**Lambda核酸外切酶**:適底物是5'磷酸化的雙鏈DNA,對(duì)單鏈DNA和5'端未磷酸化修飾的DNA的酶切活性較低,不能從DNA的切刻或缺口處起始消化。3.**活性差異**:-**ExoIII**:對(duì)具有3'-突出末端(至少有4個(gè)堿基,且具有3'-末端C殘基)的DNA、單鏈DNA、硫代磷酸酯連接的核苷酸無活性。-**Lambda核酸外切酶**:對(duì)5'-OH端的切割速度比5'-P端慢約20倍;對(duì)單鏈DNA的酶切速度比雙鏈DNA慢約100倍。4.**應(yīng)用場(chǎng)景**:-**ExoIII**:可以用于生產(chǎn)特定方向的單鏈DNA,將線性化DNA設(shè)計(jì)成為一端為不切割末端(3'突出端),另一端則設(shè)計(jì)為易切割末端(平端或5'突出端)。
BsuDNAPolymerase(嗜熱脂肪芽孢桿菌DNA聚合酶)與其他DNA聚合酶相比,具有一些獨(dú)特的特性和優(yōu)勢(shì):1.**鏈置換活性**:BsuDNAPolymerase保留了BacillussubtilisDNA聚合酶I的5'→3'聚合酶活性,但缺乏5'→3'核酸外切酶結(jié)構(gòu)域,這使得它具有鏈置換DNA合成的能力。這種能力對(duì)于等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)如重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增(LAMP)非常重要,因?yàn)樗梢苑蛛x雙鏈DNA,允許新的DNA鏈的合成。2.**溫度穩(wěn)定性**:BsuDNAPolymerase在高溫下保持活性,這使得它適用于需要在較高溫度下進(jìn)行的擴(kuò)增反應(yīng),如RPA技術(shù)中的65°C反應(yīng)條件。3.**無核酸外切酶活性**:BsuDNAPolymerase缺乏3'→5'和5'→3'核酸外切酶活性,這意味著它不會(huì)像某些其他聚合酶那樣在合成過程中具有校對(duì)功能。這可以減少非特異性擴(kuò)增,提高擴(kuò)增的特異性。4.**高靈敏度和特異性**:BsuDNAPolymerase在等溫?cái)U(kuò)增中展現(xiàn)出高靈敏度,能夠?qū)⑽⒘亢怂崮0鍞U(kuò)增到可檢測(cè)水平,同時(shí)保持高特異性。5.**簡化的操作流程**:與其他需要復(fù)雜操作和多個(gè)步驟的DNA聚合酶相比,BsuDNAPolymerase在等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)中的應(yīng)用簡化了操作流程,因?yàn)樗恍枰獰嵫h(huán)儀,這使得它適合現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)和診斷。
牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I(VacciniaVirusDNATopoisomeraseI)在實(shí)驗(yàn)室中的使用主要涉及以下幾個(gè)步驟:1.**DNA載體連接**:-牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可以用于DNA載體連接,特別是在TOPO克隆載體制備中。它能夠識(shí)別并切割雙鏈DNA末端[5’C(T)CCTT],并與DNA形成共價(jià)連接形成穩(wěn)定復(fù)合物,遇到DNA的5’-OH基團(tuán)后,重新連接形成完整DNA鏈。2.**接頭連接**:-在NGS建庫中,牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I可用于接頭連接。這包括將含有特定序列的接頭A和接頭B與酶一起孵育,以實(shí)現(xiàn)DNA片段的連接。3.**操作步驟**:-**質(zhì)粒解旋**:將超螺旋質(zhì)粒DNA與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)質(zhì)粒的解旋。-**接頭連接**:將接頭A(含CCCTT序列)和接頭B(含5’OH)與牛痘DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶I混合,在37°C下孵育5-15分鐘,以實(shí)現(xiàn)接頭的連接。4.**注意事項(xiàng)**:-雙鏈接頭A通常5’端做NH2封閉修飾,以防止自連接;接頭A的CCCTT后通常包含5-12bp尾巴,再長的尾巴會(huì)導(dǎo)致連接效率大幅下降。-雙鏈接頭B的5’端必須包含-OH。-由于該酶應(yīng)用廣,在不同的實(shí)驗(yàn)中使用策略不同,需要靈活運(yùn)用,并根據(jù)具體文獻(xiàn)進(jìn)行調(diào)整。
Pfu DNA Polymerase在基因克隆中的應(yīng)用:Pfu DNA Polymerase常用于基因克隆,確保DNA片段的高精度復(fù)制。
BstDNA聚合酶在等溫?cái)U(kuò)增中的優(yōu)勢(shì)主要包括以下幾點(diǎn):1.**高靈敏度和擴(kuò)增效率**:BstDNA聚合酶具有鏈置換能力,能夠在恒溫條件下快速、高效、特異性地?cái)U(kuò)增模板。翌圣生物的BstPlusDNAPolymerase靈敏度超高,低至5copies目的基因可測(cè),且始終能比競品更快達(dá)到閾值,擴(kuò)增速率更快。2.**高dUTP耐受性**:BstPlusDNAPolymerase具有較高的dUTP耐受性,在反應(yīng)體系中添加dUTP對(duì)BstPlusDNAPolymerase的靈敏度及擴(kuò)增效率無影響,這使得它在防污染系統(tǒng)中表現(xiàn)出色。3.**快速擴(kuò)增**:使用BstDNA聚合酶的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),如LAMP,可以在15-60分鐘內(nèi)實(shí)現(xiàn)109-1010倍的擴(kuò)增,顯示出快速的擴(kuò)增能力。4.**熱穩(wěn)定性**:BstDNA聚合酶具有較強(qiáng)的熱穩(wěn)定性,能在60-65℃的恒溫條件下保持活性,這使得它非常適合于不需要溫度循環(huán)的等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)。5.**簡化的反應(yīng)設(shè)置**:Bst3.0DNAPolymerase優(yōu)化了Loop-MediatedIsothermalDNAAmplification(LAMP)反應(yīng),簡化了反應(yīng)設(shè)置,可以實(shí)現(xiàn)單酶RT-LAMP反應(yīng)。6.**抗抑制劑能力強(qiáng)**:Bst3.0DNAPolymerase即使在高濃度的擴(kuò)增抑制劑中,包括dUTP,也能展現(xiàn)出強(qiáng)大的性能。
FnCas12a在切割DNA時(shí)產(chǎn)生黏性末端,有助于提高同源定向修復(fù)(HDR)的效率。Recombinant Human LIGHT/TNFSF14(His Tag)
在比較BstDNA聚合酶和TaqDNA聚合酶對(duì)于復(fù)雜DNA片段擴(kuò)增的適用性時(shí),以下是一些關(guān)鍵點(diǎn):1.**TaqDNA聚合酶**:-TaqDNA聚合酶因其高熱穩(wěn)定性和擴(kuò)增效率而被應(yīng)用于常規(guī)PCR。它擴(kuò)增速度為30-60秒/kb,缺乏3'→5'核酸外切酶活性,無校正功能,易產(chǎn)生錯(cuò)配堿基。-對(duì)于結(jié)構(gòu)復(fù)雜的模板,如GC含量高、有二級(jí)結(jié)構(gòu)等,TaqPlus可以用于擴(kuò)增,能有效地?cái)U(kuò)增10kb以下的片段。-有產(chǎn)品如TitaniumTaqDNA聚合酶,它是通過基因工程改造的Taq酶,缺失了5'-3'外切酶活性,具備更強(qiáng)大的擴(kuò)增性能,適合擴(kuò)增高度復(fù)雜的DNA混合物。2.**BstDNA聚合酶**:-BstDNA聚合酶具有高適溫度,能夠適應(yīng)更加苛刻的擴(kuò)增條件,同時(shí)消除DNA二級(jí)結(jié)構(gòu),因而能夠準(zhǔn)確并且均勻地?cái)U(kuò)增全基因組序列。-BstDNA聚合酶大片段能夠優(yōu)先擴(kuò)增短片段的DNA,并且能夠確保擴(kuò)增得到的DNA覆蓋了整個(gè)基因組,連貫并且無偏地?cái)U(kuò)增所有的遺傳位點(diǎn)。-翌圣生物HieffCanace®PlusHigh-FidelityDNAPolymerase基于PfuDNA聚合酶改造而成,其保真性是Taq酶的83倍,Pfu酶的9倍,擴(kuò)增速度高達(dá)10秒/kb,擴(kuò)增目的片段長達(dá)13kb,具有極強(qiáng)的擴(kuò)增效率的模板適應(yīng)性,非常適合復(fù)雜模板的高保真擴(kuò)增。
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測(cè)手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...