通過EndoS糖苷內(nèi)切酶S進(jìn)行糖蛋白的糖鏈結(jié)構(gòu)分析通常涉及以下步驟:1.**樣本準(zhǔn)備**:首先,需要獲得糖蛋白的純化樣本,以確保分析的準(zhǔn)確性。2.**酶的準(zhǔn)備**:準(zhǔn)備適量的EndoS糖苷內(nèi)切酶S,根據(jù)實(shí)驗(yàn)需要選擇合適的濃度和緩沖體系。3.**酶切反應(yīng)**:-將糖蛋白樣本與EndoS酶混合,在適宜的條件下(如pH、溫度等)進(jìn)行酶切反應(yīng)。-反應(yīng)時(shí)間根據(jù)EndoS的活性和所需的切割程度來確定。4.**終止反應(yīng)**:在達(dá)到預(yù)期的酶切時(shí)間后,通過加熱或添加適當(dāng)?shù)木彌_液來終止酶切反應(yīng)。5.**分離純化**:-使用色譜技術(shù)(如凝膠滲透色譜、離子交換色譜等)將酶切后的糖蛋白和釋放的糖鏈分離。-純化過程可能需要多步色譜以確保糖鏈的純度。6.**糖鏈分析**:-對分離得到的糖鏈進(jìn)行進(jìn)一步的結(jié)構(gòu)分析,可能包括質(zhì)譜分析、核磁共振(NMR)波譜分析等。-可以使用高分辨率的質(zhì)譜技術(shù),如MALDI-TOF或ESI-MS,來確定糖鏈的精確質(zhì)量。7.**序列鑒定**:通過與已知糖鏈數(shù)據(jù)庫比對,確定糖鏈的序列和結(jié)構(gòu)。8.**功能分析**:研究酶切后的糖蛋白和釋放的糖鏈對生物活性的影響,如結(jié)合特性、免疫原性等。9.**數(shù)據(jù)分析**:收集所有數(shù)據(jù)并進(jìn)行綜合分析,以揭示糖鏈結(jié)構(gòu)與功能之間的關(guān)系。
PreScissionProtease(PSP)是一種在蛋白質(zhì)純化和分析中使用的酶,具有以下特點(diǎn):1.**特異性識別**:PSP能在低溫(4°C)下特異性識別八肽序列Leu-Glu-Val-Leu-Phe-Gln-Gly-Pro或五肽序列Leu-Phe-Gln-Gly-Pro,并在Gln和Gly之間進(jìn)行酶切。2.**應(yīng)用**:PSP常用于去除融合蛋白中的GlutathioneS-transferase(GST)、His等標(biāo)簽,有助于純化目的蛋白。3.**純度高**:PSP的純度達(dá)到95%以上,確保了實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。4.**穩(wěn)定性好**:PSP在含有50%甘油的儲存緩沖液中,-80℃長期儲存,有效期2年;小量分裝-20℃保存,有效期6個(gè)月。5.**酶活定義**:在5℃條件下反應(yīng)16小時(shí),能夠切割100μg的GST標(biāo)簽蛋白達(dá)90%以上所需的酶量定義為一個(gè)活性單位。6.**兼容性強(qiáng)**:PSP的酶切體系中可以兼容1%TritonX-100、Tween-20或NP-40,10mMEDTA和500mMNaCl。7.**注意事項(xiàng)**:某些化合物如100mMZnCl2、4mMAEBSF和100μMChymostatin會抑制PSP的酶活性50%以上。8.**優(yōu)化酶切效率**:建議進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)摸索實(shí)驗(yàn)濃度,實(shí)際操作中,建議酶用量1:25-1:100U/μg融合蛋白。MelittinPhusion DNA Polymerase 應(yīng)在后面加入反應(yīng)體系中,以避免其3'-5'外切酶活性降解引物。
提高SpCas9蛋白在基因編輯中的特異性和效率是CRISPR-Cas9技術(shù)發(fā)展的關(guān)鍵。根據(jù)新的研究進(jìn)展,以下是一些提高SpCas9特異性和效率的策略:1.**工程化改造**:通過定向進(jìn)化和蛋白工程的方法,研究人員可以對SpCas9進(jìn)行改造,以提高其在細(xì)胞中的基因編輯活性。例如,JenniferDoudna團(tuán)隊(duì)開發(fā)的工程化iGeoCas9,通過在WED結(jié)構(gòu)域引入突變,顯著提高了基因編輯效率,比野生型GeoCas9高出100倍以上。2.**優(yōu)化gRNA設(shè)計(jì)**:合理設(shè)計(jì)的gRNA可以提高Cas9的特異性,減少脫靶效應(yīng)。研究人員通過生物信息學(xué)工具和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,篩選出與目標(biāo)DNA序列互補(bǔ)性更強(qiáng)且特異性更高的gRNA。3.**使用高保真Cas9變體**:研究人員開發(fā)了高保真Cas9變體,這些變體在保持編輯活性的同時(shí),降低了脫靶風(fēng)險(xiǎn)。例如,通過突變Cas9蛋白的關(guān)鍵氨基酸殘基,可以減少其在非目標(biāo)位點(diǎn)的切割活性。4.**PAM序列的優(yōu)化**:通過改變Cas9蛋白的PAM序列識別能力,可以擴(kuò)大其靶向范圍,從而提高編輯效率。例如,開發(fā)能夠識別非典型PAM序列的Cas9變體。5.**遞送系統(tǒng)的優(yōu)化**:使用核糖核的蛋白(RNP)復(fù)合物的形式遞送Cas9和gRNA,可以提高Cas9蛋白的穩(wěn)定性和編輯效率。這種方法避免了mRNA或質(zhì)粒遞送可能引起的免疫反應(yīng)。
酵母重組表達(dá)的PNGaseF(N-糖苷酶F)是一種用于蛋白質(zhì)去糖基化實(shí)驗(yàn)的酰胺水解酶,具有以下特點(diǎn)以確保實(shí)驗(yàn)中的活性和穩(wěn)定性:1.**高效性**:具有高比活性,例如750000U/mL,這有助于快速高效地進(jìn)行去糖基化反應(yīng)。2.**穩(wěn)定性**:在含有50%甘油的儲存緩沖液中,比較好的活性和穩(wěn)定性可維持長達(dá)24個(gè)月。3.**使用條件**:可以在原生或變性條件下使用,對于變性條件下的去糖基化,建議添加NP-40以解除SDS的抑制作用。4.**儲存條件**:建議在-15~-25℃保存,有效期1年。5.**酶活定義**:1個(gè)酶活力單位指在10μL的反應(yīng)體系中,37℃條件下1小時(shí)從10μg變性RNaseB中除去超過95%的碳水化合物所需要的酶量。6.**操作簡便**:提供了使用說明,包括變性和非變性條件下的蛋白質(zhì)去糖基化步驟。7.**His標(biāo)簽**:產(chǎn)品帶有His標(biāo)簽,便于在實(shí)驗(yàn)中進(jìn)行純化和檢測。8.**純度**:純度達(dá)到95%以上,通過SDS-PAGE和完整ESI-MS進(jìn)行確定。9.**快速反應(yīng)**:有些產(chǎn)品如FastPNGaseF,可以在數(shù)分鐘內(nèi)完成徹底且無偏好性地去糖基化。10.**注意事項(xiàng)**:產(chǎn)品供科研使用,操作時(shí)應(yīng)穿戴適當(dāng)?shù)膶?shí)驗(yàn)室防護(hù)裝備。遵循這些指導(dǎo)原則和產(chǎn)品說明,可以確保PNGaseF在實(shí)驗(yàn)中的活性和穩(wěn)定性,從而獲得可靠的去糖基化結(jié)果。來源于 Thermococcus kodakaraensis,具有高熱穩(wěn)定性和校正能力,適用于長片段PCR和熱啟動PCR。
在蛋白質(zhì)糖基化分析中,除了N-糖苷酶F(PNGaseF),還有其他幾種酶也發(fā)揮著重要作用,具有各自的優(yōu)勢:1.**EndoH糖苷內(nèi)切酶H**:這種酶可以水解高甘露糖型N-連接糖鏈,通常用于區(qū)分高甘露糖型和復(fù)雜型糖鏈。2.**EndoS糖苷內(nèi)切酶S**:EndoS能夠從IgG重鏈的殼二糖結(jié)構(gòu)之間切除N-連接糖,有助于分析抗體的糖基化模式。3.**FastPNGaseF**:這是一種經(jīng)過優(yōu)化的PNGaseF,能在數(shù)分鐘內(nèi)對抗體、免疫球蛋白、融合蛋白以及其他糖蛋白進(jìn)行徹底和快速的去糖基化,簡化了實(shí)驗(yàn)流程,同時(shí)保持了靈敏度和重復(fù)性。4.**O-糖苷酶O-glycosidase**:用于去除O-連接的糖鏈,這對于O-糖基化蛋白質(zhì)的分析至關(guān)重要。5.**三氟甲基磺酸(TFMS)法**:這是一種化學(xué)去糖基化方法,可以用于釋放糖鏈,尤其在某些難以使用酶法去除糖鏈的情況下。6.**質(zhì)譜法**:雖然不是酶,但質(zhì)譜法是分析糖鏈結(jié)構(gòu)的強(qiáng)大工具,可以結(jié)合酶法或化學(xué)法釋放的糖鏈進(jìn)行詳細(xì)分析。7.**核磁共振法(NMR)**:NMR技術(shù)可以確定糖鏈的構(gòu)型、連接位置、分支和微觀多樣性,是糖鏈立體化學(xué)結(jié)構(gòu)分析的重要方法。這些酶和方法各有優(yōu)勢,可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)的具體需求和糖基化類型的不同進(jìn)行選擇,以獲得比較好的分析結(jié)果。
His-Avi Tag包含了特定肽段,分子量預(yù)測為50.20 kDa,但由于糖基化,其在Tris-Bis PAGE結(jié)果上遷移至55-60 kDa。Recombinant Rat IL-13Ra2 Protein,hFc Tag
EndoS糖苷內(nèi)切酶S在抗體藥物偶聯(lián)物(ADCs)研究中的應(yīng)用主要體現(xiàn)在糖鏈定點(diǎn)偶聯(lián)技術(shù)上。通過上海藥物所的研究,開發(fā)了一種新穎的糖鏈定點(diǎn)ADC制備策略,利用EndoS2這種糖苷內(nèi)切酶,可以將小分子細(xì)胞毒藥物“一步”定點(diǎn)連接到抗體的糖基化位點(diǎn),實(shí)現(xiàn)了糖鏈定點(diǎn)ADC化合物的制備。定點(diǎn)偶聯(lián)技術(shù)相比傳統(tǒng)的隨機(jī)偶聯(lián)具有更好的方法指數(shù),能夠提高ADC的均一性和穩(wěn)定性,是當(dāng)前ADC領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)之一。在抗體的Fc結(jié)構(gòu)域N297位,這是一個(gè)保守的糖基化位點(diǎn),通過在該位點(diǎn)引入細(xì)胞物質(zhì),可以形成具有優(yōu)勢的糖鏈定點(diǎn)ADC化合物(glycosite-specificADCs,gsADCs)。此外,EndoS2對多樣化的LacNAc修飾顯示出良好的兼容性,能夠高效獲得功能修飾的糖工程抗體,并且可以用于抗體的內(nèi)吞成像研究及糖鏈延伸等功能化研究。研究人員通過這種“一步”制備策略得到的糖鏈定點(diǎn)ADC化合物,在結(jié)構(gòu)均一性、親水性、體外穩(wěn)定性以及體外活性方面表現(xiàn)良好,并且在體內(nèi)瘤抑制活性方面,相比陽性對照ADC化合物,在低載藥量的情況下具有更強(qiáng)的抑制效果。EndoS酶的這些應(yīng)用,不僅展示了其在簡化ADC制備流程中的潛力,還有助于推動定點(diǎn)ADC藥物的深入發(fā)展,為未來的生物藥物開發(fā)提供了新的思路和方法。Recombinant Rat IL-13Ra2 Protein,hFc Tag
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...