pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶組成,具有以下主要應(yīng)用:1.**高通量測序建庫**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶可以用于快速構(gòu)建用于高通量測序的DNA文庫,通過其轉(zhuǎn)座酶活性實現(xiàn)DNA片段化,同時加上測序接頭,簡化了傳統(tǒng)DNA測序建庫的多步過程。2.**CUT&Tag技術(shù)**:這是一種新興的蛋白質(zhì)與DNA相互作用研究方法,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶利用ProteinA與特定抗體結(jié)合,將轉(zhuǎn)座酶帶到目標(biāo)蛋白附近進(jìn)行DNA切割和標(biāo)簽添加,實現(xiàn)對蛋白質(zhì)結(jié)合位點的高通量測序分析。CUT&Tag技術(shù)具有高特異性、低背景噪音、高靈敏度、良好重復(fù)性等優(yōu)點,適用于表觀遺傳學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶也可用于ATAC-seq實驗,這是一種研究染色質(zhì)可及性的方法,通過轉(zhuǎn)座酶在沒有核酸酶消化的情況下切割染色質(zhì)DNA,然后在切割位點加上測序接頭,進(jìn)行后續(xù)的測序分析。4.**轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫**:有研究開發(fā)了基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測序快速建庫方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5轉(zhuǎn)座酶直接作用于RNA/DNA雜交鏈,簡化了建庫過程,適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序,提高了樣本的利用率和測序速度。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中的逆轉(zhuǎn)錄酶(ReverseTranscriptase,RT)具有一個關(guān)鍵特性:它們通過特定的突變消除了RNaseH活性。RNaseH是一種通常與某些逆轉(zhuǎn)錄酶相關(guān)的酶活性,它能夠降解RNA。然而,在1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中,逆轉(zhuǎn)錄酶被設(shè)計成不具有這種降解RNA的能力,從而在合成cDNA的鏈時保護(hù)RNA模板不被降解。以下是1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)中逆轉(zhuǎn)錄過程的一般步驟,以及如何避免RNA降解:1.**RNA模板準(zhǔn)備**:首先確保RNA模板的純度和完整性,避免DNA污染??梢酝ㄟ^DNaseI處理去除RNA樣品中的DNA污染。2.**混合反應(yīng)組分**:將RNA模板、dNTPs(去氧核苷酸三磷酸)、逆轉(zhuǎn)錄引物(如oligo(dT)或隨機(jī)引物)和緩沖液混合。3.**逆轉(zhuǎn)錄酶添加**:加入經(jīng)過突變處理的逆轉(zhuǎn)錄酶,這種酶缺乏RNaseH活性,因此不會在合成過程中降解RNA。4.**逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)**:在適宜的溫度下進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),逆轉(zhuǎn)錄酶根據(jù)RNA模板合成cDNA鏈。5.**終止反應(yīng)**:通過加熱至一定溫度來終止逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。Recombinant Porcine IL-1RAFnCas12a產(chǎn)品不含DNA內(nèi)切酶和外切酶,也不含RNA酶,保證了實驗的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。
磁珠法質(zhì)粒小量抽提試劑盒通過一系列優(yōu)化的步驟來確保從細(xì)菌細(xì)胞中提取高質(zhì)量和高純度的質(zhì)粒DNA。以下是這一過程的一般步驟:1.**細(xì)胞培養(yǎng)**:-首先,將含有質(zhì)粒的大腸桿菌在適宜的培養(yǎng)基中培養(yǎng)至適宜密度(通常是OD600約0.6-1.2)。2.**裂解細(xì)胞**:-使用試劑盒提供的裂解液(含有SDS和可能的其他裂解成分)破壞細(xì)菌細(xì)胞壁和膜,釋放出細(xì)胞內(nèi)容物。3.**吸附磁珠**:-將磁珠加入裂解后的混合物中,磁珠表面修飾有能夠特異性結(jié)合核酸的配體,使得質(zhì)粒DNA吸附于磁珠表面。4.**磁分離**:-利用磁力架將吸附有質(zhì)粒DNA的磁珠從溶液中分離出來,去除未結(jié)合的蛋白質(zhì)和其他細(xì)胞碎片。5.**洗滌雜質(zhì)**:-經(jīng)過幾次洗滌步驟,使用試劑盒提供的洗滌液去除吸附在磁珠表面的蛋白質(zhì)、RNA和其他雜質(zhì)。6.**去除洗滌液**:-磁分離后,小心地移除洗滌液,避免磁珠干燥或吸入磁珠,以確保純度。7.**洗脫質(zhì)粒**:-使用試劑盒提供的洗脫液(通常是低鹽或高pH的緩沖液)將質(zhì)粒DNA從磁珠上洗脫下來。8.**收集質(zhì)粒**:-洗脫后的質(zhì)粒DNA通常在室溫或4°C下保存,避免多次凍融,以維持DNA的完整性。
PCR預(yù)混合溶液是一種為聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)實驗預(yù)先配制好的混合試劑,它包含進(jìn)行PCR所需的大部分或全部成分,除了特定的DNA模板、引物和可能的水之外。這種預(yù)混合溶液的設(shè)計旨在簡化實驗步驟,減少實驗過程中的誤差,提高實驗的重復(fù)性和效率。通常,PCR預(yù)混合溶液包含以下成分:-**DNA聚合酶**:負(fù)責(zé)在PCR過程中合成新的DNA鏈。-**dNTPs**(脫氧核苷三磷酸):是DNA合成的原料,包括dATP、dCTP、dGTP和dTTP。-**緩沖體系**:提供適宜的pH和離子環(huán)境,保證DNA聚合酶的活性。-**Mg2+**:作為DNA聚合酶的輔助因子,影響酶的活性和PCR的特異性。-**穩(wěn)定劑**:延長預(yù)混合溶液的有效期和穩(wěn)定性。-**染料**(可選):如溴酚藍(lán)或類似物質(zhì),用于在電泳時觀察DNA條帶。PCR預(yù)混合溶液的使用可以減少實驗者在每次實驗時手動添加各種成分的需要,從而節(jié)省時間并降低污染的風(fēng)險。此外,一些預(yù)混合溶液還可能包含其他添加劑,比如增強(qiáng)劑或保護(hù)劑,以提高PCR的效率和穩(wěn)定性。與其他Cas12蛋白相比,F(xiàn)nCas12a蛋白的分子量較小,大約在400-700個氨基酸之間。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)主要用于從RNA模板合成鏈cDNA,而不是直接用于線性RNA的放大。然而,合成的cDNA可以作為模板用于后續(xù)的線性RNA放大過程,這通常涉及以下幾個步驟:1.**cDNA合成**:使用1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)按照試劑盒的說明進(jìn)行操作,從線性RNA模板合成鏈cDNA。2.**第二鏈cDNA合成**:在某些情況下,可能需要合成雙鏈cDNA。這可以通過使用DNA聚合酶和第二鏈合成試劑來完成,從而獲得完整的雙鏈cDNA。3.**線性RNA放大**:一旦獲得了cDNA,可以使用體外轉(zhuǎn)錄(IVT,InVitroTranscription)技術(shù)來放大RNA。這通常涉及以下步驟:-使用含有RNA聚合酶啟動子序列的特定引物對cDNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增。-使用含有RNA聚合酶識別位點的引物進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng),以合成大量RNA拷貝。4.**RNA純化**:體外轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的RNA需要通過適當(dāng)?shù)姆椒ǎㄈ缰鶎游龌虺恋恚┻M(jìn)行純化,以去除DNA模板、未反應(yīng)的核苷酸和其他雜質(zhì)。5.**RNA質(zhì)量檢測**:使用凝膠電泳或生物分析儀檢測RNA的質(zhì)量和大小,確保RNA的完整性和純度。FnCas12a特異性識別并剪切帶PAM序列的雙鏈DNA(dsDNA)靶標(biāo),其PAM序列為5'-TTN-3',與Cas9的PAM序列不同。Biotinylated Recombinant Human PD-L1/B7-H1 (His-Avi Tag)
研究泛素-蛋白酶體途徑:重組人泛素可用于研究泛素化修飾和蛋白降解過程。Recombinant Human IL-23R Protein,hFc Tag
磁珠法質(zhì)粒小量抽提試劑盒中的磁珠分離通常涉及以下步驟:1.**裂解細(xì)胞**:-首先,使用裂解液(含有SDS等成分)裂解細(xì)菌細(xì)胞,釋放出質(zhì)粒DNA。2.**結(jié)合磁珠**:-將磁珠加入到裂解后的混合物中,磁珠表面通常修飾有能夠特異性結(jié)合核酸的配體,使得質(zhì)粒DNA吸附于磁珠表面。3.**磁分離**:-將含有磁珠和質(zhì)粒DNA的混合物置于磁分離架上。磁分離架產(chǎn)生磁場,使得磁珠迅速聚集在管壁或管底。4.**未結(jié)合物質(zhì)**:-在磁珠固定后,小心移除上清液,避免擾動磁珠。上清液中含有未吸附的蛋白質(zhì)、RNA和其他細(xì)胞碎片。5.**洗滌磁珠**:-向磁珠中加入洗滌液,輕輕混勻以去除殘留的雜質(zhì),然后再次使用磁分離架分離磁珠和洗滌液。6.**重復(fù)洗滌**:-根據(jù)試劑盒的說明,可能需要進(jìn)行多次洗滌以確保高度純化。每次洗滌后都需洗滌液。7.**干燥磁珠**(如果需要):-在某些情況下,可能需要去除洗滌后的殘留液體,讓磁珠在磁場作用下干燥,但要注意不要使磁珠完全干燥,以免影響DNA的洗脫。8.**洗脫質(zhì)粒DNA**:-使用洗脫液(通常是低鹽或高pH的緩沖液)將質(zhì)粒DNA從磁珠上洗脫。洗脫液可以破壞磁珠與DNA之間的結(jié)合力,釋放DNA。。
在分子生物學(xué)實驗中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過添加熒光染料,為實驗提供了更直觀的監(jiān)測手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實時監(jiān)測的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過程中糾正錯誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯誤率更低,...