5'DNA腺苷酰化試劑盒通過(guò)特定的酶催化反應(yīng),將5'-磷酸化的單鏈DNA(pDNA)轉(zhuǎn)化為5'-腺苷酰化DNA(AppDNA)。以下是啟用5'-磷酸化的單鏈DNA的一般步驟:1.**準(zhǔn)備反應(yīng)體系**:-根據(jù)試劑盒說(shuō)明書(shū),準(zhǔn)備所需的反應(yīng)組分,包括5'-磷酸化的單鏈DNA、腺苷?;福ㄈ鏏denylase或MthRNA連接酶)、ATP和相應(yīng)的緩沖液。2.**混合組分**:-將5'-磷酸化的單鏈DNA與腺苷?;浮TP和緩沖液混合在適當(dāng)?shù)姆磻?yīng)容器中。3.**孵育反應(yīng)**:-將混合好的反應(yīng)體系在指定的溫度(通常是65℃)下孵育一定的時(shí)間,以允許酶將ATP中的AMP部分轉(zhuǎn)移到DNA的5'端。4.**酶失活**:-反應(yīng)完成后,在85℃孵育5分鐘以失活腺苷?;福@一步是為了防止后續(xù)的去腺苷?;F(xiàn)象,確保腺苷?;嚷什幌陆?。5.**產(chǎn)物收集**:-由于轉(zhuǎn)化效率高,通常不需要進(jìn)行凝膠純化步驟。可以通過(guò)乙醇沉淀等方法收集腺苷?;蟮腄NA產(chǎn)物。6.**產(chǎn)物應(yīng)用**:-收集的腺苷酰化DNA可以直接用于后續(xù)的克隆、測(cè)序、連接或其他分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。7.**注意事項(xiàng)**:-確保所有操作在無(wú)RNA酶和無(wú)DNA酶的環(huán)境中進(jìn)行,以避免污染。-使用時(shí)需注意反應(yīng)體系的準(zhǔn)確性,確保底物、酶和ATP的比例適當(dāng)。
pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶是一種經(jīng)過(guò)特殊改造的融合蛋白,由ProteinA和高活性的Tn5轉(zhuǎn)座酶組成,具有以下主要應(yīng)用:1.**高通量測(cè)序建庫(kù)**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶可以用于快速構(gòu)建用于高通量測(cè)序的DNA文庫(kù),通過(guò)其轉(zhuǎn)座酶活性實(shí)現(xiàn)DNA片段化,同時(shí)加上測(cè)序接頭,簡(jiǎn)化了傳統(tǒng)DNA測(cè)序建庫(kù)的多步過(guò)程。2.**CUT&Tag技術(shù)**:這是一種新興的蛋白質(zhì)與DNA相互作用研究方法,pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶利用ProteinA與特定抗體結(jié)合,將轉(zhuǎn)座酶帶到目標(biāo)蛋白附近進(jìn)行DNA切割和標(biāo)簽添加,實(shí)現(xiàn)對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)合位點(diǎn)的高通量測(cè)序分析。CUT&Tag技術(shù)具有高特異性、低背景噪音、高靈敏度、良好重復(fù)性等優(yōu)點(diǎn),適用于表觀遺傳學(xué)、干細(xì)胞等領(lǐng)域的研究。3.**ATAC-seq**:pA-Tn5轉(zhuǎn)座酶也可用于ATAC-seq實(shí)驗(yàn),這是一種研究染色質(zhì)可及性的方法,通過(guò)轉(zhuǎn)座酶在沒(méi)有核酸酶消化的情況下切割染色質(zhì)DNA,然后在切割位點(diǎn)加上測(cè)序接頭,進(jìn)行后續(xù)的測(cè)序分析。4.**轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)**:有研究開(kāi)發(fā)了基于Tn5轉(zhuǎn)座酶的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序快速建庫(kù)方法,例如SHERRY方法,它利用Tn5轉(zhuǎn)座酶直接作用于RNA/DNA雜交鏈,簡(jiǎn)化了建庫(kù)過(guò)程,適用于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,提高了樣本的利用率和測(cè)序速度。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)通常提供幾種不同類型的引物用于啟動(dòng)cDNA的合成。這些引物包括:1.**Oligo(dT)引物**:這種引物通常與mRNA的poly(A)尾部互補(bǔ)配對(duì),適用于從真核生物的mRNA中合成cDNA。它能夠產(chǎn)生大量全長(zhǎng)cDNA,特別是當(dāng)模板來(lái)源于真核生物時(shí)。2.**隨機(jī)六聚體引物(RandomHexamers)**:這些引物是一組隨機(jī)的六核苷酸序列,可以與RNA模板的任何部分結(jié)合,從而啟動(dòng)cDNA的合成。它們適用于mRNA、rRNA、tRNA和長(zhǎng)非編碼RNA等多種類型的RNA模板。3.**基因特異性引物(GeneSpecificPrimers)**:這些引物是針對(duì)特定基因序列設(shè)計(jì)的,可以用于從總RNA或mRNA中合成特定基因的cDNA。它們通常用于當(dāng)需要選擇性地?cái)U(kuò)增特定基因或基因家族時(shí)。在選擇引物時(shí),需要考慮RNA模板的來(lái)源、RNA的質(zhì)量和特性以及后續(xù)實(shí)驗(yàn)的需求。例如,如果RNA模板具有復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)或較高的GC含量,可能需要使用隨機(jī)引物以提高cDNA合成的效率。另外,如果后續(xù)實(shí)驗(yàn)是qPCR,可以將Oligo(dT)與隨機(jī)引物混合使用,以提高qPCR結(jié)果的真實(shí)性和重復(fù)性。
熒光探針?lè)ㄊ且环N利用熒光標(biāo)記的分子(即熒光探針)來(lái)檢測(cè)和定量目標(biāo)分子的方法。這種方法廣泛應(yīng)用于生物化學(xué)、分子生物學(xué)和醫(yī)學(xué)診斷等領(lǐng)域。以下是熒光探針?lè)ǖ囊恍╆P(guān)鍵特點(diǎn)和工作原理:1.**熒光標(biāo)記**:熒光探針是一類特殊的分子,它們含有可以發(fā)出熒光的化學(xué)基團(tuán)(熒光團(tuán))。這些熒光團(tuán)在受到特定波長(zhǎng)的光激發(fā)時(shí),會(huì)發(fā)出特定波長(zhǎng)的光。2.**特異性結(jié)合**:熒光探針通常設(shè)計(jì)成能夠特異性地與目標(biāo)分子結(jié)合,如DNA、RNA、蛋白質(zhì)或其他小分子。這種結(jié)合通常是通過(guò)分子間的互補(bǔ)性,如氫鍵、疏水作用或離子鍵等實(shí)現(xiàn)的。3.**信號(hào)變化**:熒光探針在結(jié)合目標(biāo)分子前后,其熒光特性(如熒光強(qiáng)度、波長(zhǎng)、壽命等)會(huì)發(fā)生改變。這種變化可以是增強(qiáng)或減弱,取決于探針的設(shè)計(jì)和環(huán)境條件。4.**檢測(cè)原理**:-在**熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)**中,兩個(gè)不同的熒光團(tuán)被設(shè)計(jì)成靠近,使得一個(gè)熒光團(tuán)(供體)的能量可以非放射性地轉(zhuǎn)移到另一個(gè)熒光團(tuán)(受體)。當(dāng)供體和受體之間的距離改變(如由于目標(biāo)分子的結(jié)合)時(shí),F(xiàn)RET效率會(huì)改變,從而影響熒光信號(hào)。-在**熒光增強(qiáng)或減弱**中,探針的熒光特性直接受到其與目標(biāo)分子結(jié)合的影響。例如,某些探針在結(jié)合DNA后,其熒光強(qiáng)度會(huì)增強(qiáng)。CB1受體分布于大腦和外周神經(jīng)系統(tǒng)中,與多種生理功能有關(guān),包括疼痛感知、食欲調(diào)節(jié)、情緒調(diào)節(jié)。
1stStrandcDNASynthesisKit(RNaseH-)是一種用于合成互補(bǔ)DNA(cDNA)的試劑盒,它通過(guò)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程從信使RNA(mRNA)或總RNA模板合成cDNA的鏈。這類試劑盒通常包含逆轉(zhuǎn)錄酶(ReverseTranscriptase,RT)和其他必要的組分,以確保高效和準(zhǔn)確的cDNA合成。RNaseH-表示該試劑盒使用的逆轉(zhuǎn)錄酶缺乏RNaseH活性,這意味著在合成cDNA鏈的過(guò)程中不會(huì)發(fā)生RNA的降解,從而可以產(chǎn)生更高產(chǎn)量的全長(zhǎng)cDNA,特別是從較長(zhǎng)的模板(可達(dá)13kb)。該試劑盒通常包括以下組分:-逆轉(zhuǎn)錄酶,如RevertAidHMinusM-MuLVReverseTranscriptase,它通過(guò)點(diǎn)突變完全消除了RNaseH活性。-RiboLockRNaseInhibitor,這是一種重組蛋白,可有效保護(hù)RNA在高達(dá)55°C的溫度下不受RNases的降解。-緩沖液、dNTPs(去氧核苷酸三磷酸)和其他輔助成分,以支持cDNA合成反應(yīng)。-有時(shí)還包括用于去除RNA樣品中污染的基因組DNA的DNaseI。合成的cDNA可以作為PCR或?qū)崟r(shí)PCR的模板直接使用,也適用于第二鏈cDNA合成或線性RNA放大。此外,可以在cDNA合成過(guò)程中加入放射性或非放射性標(biāo)記的核苷酸,以便在包括微陣列在內(nèi)的雜交實(shí)驗(yàn)中作為探針使用??缒さ鞍自谒拗骷?xì)胞中的表達(dá)水平通常有點(diǎn)低,研發(fā)困難,對(duì)蛋白表達(dá)生產(chǎn)平臺(tái)技術(shù)要求極高。Recombinant Human IL-13Ra1 Protein,hFc Tag
在一項(xiàng)研究中,比較了具有不同NLS融合的Cas9蛋白和Cas9 mRNA在斑馬魚(yú)基因組編輯中的效率。Endo S糖苷內(nèi)切酶S
dCTPSolution(脫氧胞苷三磷酸溶液)是一種分子生物學(xué)試劑,它是進(jìn)行DNA合成反應(yīng)的關(guān)鍵成分之一。dCTP與dATP、dGTP和dTTP一起,構(gòu)成DNA聚合過(guò)程中所需的四種脫氧核苷三磷酸(dNTPs)。每種dNTP對(duì)應(yīng)DNA中的一個(gè)堿基:腺嘌呤(A)、胞嘧啶(C)、鳥(niǎo)嘌呤(G)和胸腺嘧啶(T)。dCTP的化學(xué)名稱是2'-脫氧胞苷-5'-三磷酸,它在DNA合成中起到以下作用:-**DNA合成**:在聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和其他DNA合成過(guò)程中,dCTP作為底物,由DNA聚合酶催化,與DNA模板鏈上的鳥(niǎo)嘌呤(G)配對(duì),形成新的DNA鏈。-**DNA測(cè)序**:在某些DNA測(cè)序方法中,dCTP可能用于標(biāo)記或合成測(cè)序產(chǎn)物。-**分子克隆和其他技術(shù)**:dCTP在分子克隆、基因表達(dá)分析和其他涉及DNA合成的實(shí)驗(yàn)中也有應(yīng)用。dCTPSolution通常以高濃度(如100mM)的溶液形式提供,以便于在實(shí)驗(yàn)中使用時(shí)進(jìn)行稀釋。這種溶液需要在低溫(通常是-20°C)條件下儲(chǔ)存,以保持其穩(wěn)定性和避免分解。在購(gòu)買(mǎi)和使用dCTPSolution時(shí),用戶應(yīng)確保產(chǎn)品具有高純度、無(wú)PCR抑制劑、無(wú)核酸酶污染等特性,以保證實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性和重復(fù)性。此外,dCTPSolution應(yīng)用于研究用途,不應(yīng)用于臨床診斷過(guò)程。Endo S糖苷內(nèi)切酶S
在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)中,PCR技術(shù)是基因擴(kuò)增的重要工具,而Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 則是結(jié)合了高保真性和便捷性的理想選擇。這種預(yù)混液不僅繼承了Pfu DNA聚合酶的重要的保真性,還通過(guò)添加熒光染料,為實(shí)驗(yàn)提供了更直觀的監(jiān)測(cè)手段。Pfu Master Mix (2×) (With Dye) 是一種即用型的2倍濃度預(yù)混液,含有Pfu DNA聚合酶、dNTPs、優(yōu)化的反應(yīng)緩沖液以及用于實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)的熒光染料。Pfu DNA聚合酶以其高保真性著稱,其3'-5'外切酶活性能夠在DNA合成過(guò)程中糾正錯(cuò)誤摻入的堿基,提高擴(kuò)增產(chǎn)物的準(zhǔn)確性。與普通Taq酶相比,Pfu酶的錯(cuò)誤率更低,...