與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗，尤其是對于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實驗中做了太多的肽圖譜，而中級水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過程中出錯的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡單性，中級方法非常適合自動化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實上，肽圖譜是一個多步驟的過程，每一個步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實驗室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。FabRICATOR（IdeS）固定在磁珠上，可同時快速自動消化多種抗體，促進(jìn)中級表征工作流程。湖北FabALACTICAIdeS蛋白酶抗體酶切

不同于IdeS，Genovis的FabDELLO 是一種蛋白酶，可在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1，在兩小時內(nèi)產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段，無需還原條件。該酶對具有突變鉸鏈區(qū)域的抗體（如 LALA 突變）具有活性，并啟用中級 LC-MS 來表征具有突變鉸鏈的抗體的關(guān)鍵質(zhì)量屬性。FabDELLO 在鉸鏈上方的單個位點消化人 IgG1 （...KSCDK / THTCPPCP...），生成完整的 Fab 和 Fc 片段。FabDELLO 是一種賴氨酸特異性蛋白酶。單個消化位點是人 IgG1 的三維結(jié)構(gòu)的結(jié)果，使這種賴氨酸暴露于酶中。如果去除N-聚糖，則Fc上暴露的賴氨酸處可能會出現(xiàn)額外的消化位點。FabDELLO在天然條件下具有活性，需要鈣離子的存在。在37°C和pH 7-8.5下獲得良好活性。FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細(xì)菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 32 kDa。安徽FabRICATOR ZIdeS蛋白酶用于表征zhiliao用途的單克隆抗體、Fc融合蛋白、ADC和生物仿制藥。

Blinatumomab（一種對 CD19 和 T 細(xì)胞標(biāo)志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對消解樣品的直接分析表明，所有三個連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結(jié)構(gòu)域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個結(jié)構(gòu)域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜?？梢杂^察到每個結(jié)構(gòu)域的幾個不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結(jié)構(gòu)域無法從α-CD19 VH結(jié)構(gòu)域完全基線分離，導(dǎo)致在相關(guān)質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個結(jié)構(gòu)域的分離產(chǎn)生了有關(guān)在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結(jié)構(gòu)域。后者還含有一個帶有五六個組氨酸殘基的 His 標(biāo)簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對包含多個柔性連接子蛋白進(jìn)行質(zhì)量控制的中級工作流程的強大功能。

作為免疫系統(tǒng)的重要組成部分，IgA在自身免疫性疾病、過敏反應(yīng)、胃腸道疾病等許多不同的健康狀況中發(fā)揮作用。在天然條件和復(fù)雜生物樣品中選擇性和特異性消化IgA的能力在臨床醫(yī)學(xué)和研究中具有重要價值。IgASAP酶是降低zhiliao性IgA候選物樣品復(fù)雜性并簡化IgA分析表征的寶貴工具。人IgA1和IgA2之間的一個顯著結(jié)構(gòu)差異是鉸鏈區(qū)域。與IgA2相比，IgA1具有更長的富含O-聚糖且更靈活的鉸鏈區(qū)域。IgASAPSub1的消化位點位于該擴展區(qū)域，使酶具有IgA1特異性。IgA2亞類以三種等位基因形式存在，A2m1、A2m2和A2m3。IgASAPSub1+2在脯氨酸（P）和纈氨酸（V）之間消化IgA1和IgA2m1只有N端到鉸鏈區(qū)域，但由于A2m2和A2m3中的脯氨酸殘基被精氨酸（R）殘基取代，因此這兩種同種異體型的IgA2對消化具有抗性。Genovis發(fā)現(xiàn)大部分緩沖液與FabRICATOR活性兼容，已經(jīng)測試了PBS和150mM 醋酸銨 pH7，也適用于FabRICATOR HPLC。

Genovis將固定化酶固定在磁珠上，用于在鉸鏈下方自動消化IgG。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。這些微球能夠在中級表征工作流程中并行快速自動酶解多種抗體。它們專為自動化平臺而設(shè)計，但在無法實現(xiàn)自動化的情況下，在振動臺上的表現(xiàn)同樣出色。酶切消解后，樣品可直接轉(zhuǎn)移到LC-MS的自動進(jìn)樣器進(jìn)行快速色譜分析，或轉(zhuǎn)移到其他分析方法進(jìn)行分析。自動平行抗體酶切和亞基生成允許處理與克隆選擇、工藝開發(fā)和潛在生物制藥穩(wěn)定性研究相關(guān)的大量樣品。自動抗體亞基分析可減少操作人員的時間和樣品處理錯誤的風(fēng)險，并提高通量。IgASAP Sub1+2 特異性消化鉸鏈上方的 IgA1 和 IgA2m1，產(chǎn)生完整且均質(zhì)的 Fab 和 Fc 片段。天津FabULOUSIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

FabDELLO 是從 Bdellovibrio 細(xì)菌克隆而來的，并在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 32 kDa。湖北FabALACTICAIdeS蛋白酶抗體酶切

Genovis提供色譜柱形式的FabRICATOR（IdeS）酶，是在鉸鏈下方對IgG進(jìn)行柱上消化的固定化酶。Genovis的FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的F（ab'）2和Fc片段。酶解后，可以使用反相HPLC、質(zhì)譜或其他分析方法分析片段?？贵w消化和亞基生成的自動化使生物反應(yīng)器的在線監(jiān)測應(yīng)用成為可能，例如，作為2D-LC-MS設(shè)置的一部分，將反應(yīng)器直接耦合到MS。這種自動化的抗體亞基分析方法減少了操作人員的時間、樣品處理時間并提高了通量。湖北FabALACTICAIdeS蛋白酶抗體酶切