樣品制備的條件可能會在樣品中誘發(fā)偽影，因此需要避免高溫和堿性pH值進(jìn)行質(zhì)譜分析。如果可能的話，避免多個(gè)步驟并在一鍋反應(yīng)中進(jìn)行消化和還原也可能是有益的。與IdeS不同，為了探索Genovis的GingisREX對離液劑和去液劑的穩(wěn)定性和耐受性，在一系列試劑中測試了酶活性，并使用底物測定進(jìn)行了評估。數(shù)據(jù)顯示，GingisREX在6M時(shí)耐受尿素，吐溫高達(dá)1%，但活性在0.1%時(shí)受到SDC的負(fù)面影響。該酶在 pH 值范圍為 5.0 至 9.0 時(shí)顯示出活性，在 pH 值為 6.5-8.0 之間。綜上所述，GingisREX可用于一鍋反應(yīng)，以同時(shí)消化和變性6M尿素。與Genovis的IdeS不同，雙特異性 T 細(xì)胞接合器 （BiTE） 分子是一種融合蛋白療法，其中兩個(gè) scFv 融合，形成一個(gè)雙特異性分子，其中一個(gè) scFv 靶向細(xì)胞毒性 T 細(xì)胞，另一個(gè)靶向Ai癥抗原。該蛋白質(zhì)由四個(gè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域組成，兩個(gè) scFv 均由 VL 和 VH 區(qū)域組成，總共由三個(gè)柔性 GS 連接子連接。這種蛋白質(zhì)的大尺寸（54 kDa）可能對通過完整質(zhì)譜法進(jìn)行產(chǎn)品質(zhì)量監(jiān)測構(gòu)成挑戰(zhàn)，因?yàn)闃?biāo)準(zhǔn)MS儀器可能無法提供蛋白質(zhì)的單同位素分辨率。Genovis的GingisREX （RgpB）可用于肽圖分析、從頭肽測序和翻譯后修飾分析；產(chǎn)生更長的肽 - 提高序列覆蓋率。山西FabULOUSIdeS蛋白酶抗體酶切

大多數(shù)zhiliao抗體攜帶人 IgG1 骨架，雙特異性或多特異性形式的開發(fā)正在迅速增加。此類抗體的分析需要特異性酶來表征特性，例如單價(jià)結(jié)合、二硫鍵擾亂和配對 Fc 糖基化。傳統(tǒng)方案包括使用木瓜蛋白酶和 Lys-C 的酶消化，這需要優(yōu)化以大限度地減少過度消化并獲得足夠的產(chǎn)量。Genovis的半胱氨酸蛋白酶 FabALACTICA （IgdE） 在鉸鏈上方的一個(gè)特定位點(diǎn)消化人 IgG1，以產(chǎn)生完整的 Fab 和 Fc 片段。該酶在大多數(shù)人IgG1 上也具有活性，其中鉸鏈區(qū)域以下的突變已被引入。為了證明FabALACTICA的性能，我們消化了不同的人IgG1抗體，并使用RP-HPLC分析了所得片段。用FabALACTICA消化后觀察到的定義峰顯示了不同人IgG1抗體的均質(zhì)片段生成和強(qiáng)大的酶性能。FabALACTICA 酶也可用于生成完整的 Fc 片段。安徽FabDELLOIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶可消化精氨酸殘基的 C 末端蛋白質(zhì)，包括難以與其他酶消化的 Arg-Pro 鍵。

大多數(shù)商業(yè)zhiliao性抗體屬于IgG類，在Fc結(jié)構(gòu)域中含有N-聚糖。一個(gè)重要的關(guān)鍵質(zhì)量屬性是糖基化曲線，因?yàn)樗鼤绊懛€(wěn)定性、溶解度、藥效學(xué)和藥代動力學(xué)特性。這種翻譯后修飾可能發(fā)生在生物工藝開發(fā)和制造過程中，因此需要密切監(jiān)測。Genovis的FabRICATOR（IdeS）酶已成為一種被接受的快速表征單克隆抗體（mAb）的分析工具。FabRICATOR在鉸鏈下方消化IgG，產(chǎn)生F（ab'）2和Fc/2片段。單個(gè)FabRICATOR消解位點(diǎn)和質(zhì)量譜的后續(xù)精度使Fc糖基化譜能夠檢測，從而可以監(jiān)測批次間的一致性和其他關(guān)鍵質(zhì)量屬性。

Blinatumomab（一種對 CD19 和 T 細(xì)胞標(biāo)志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子）的研究級生物仿制藥在室溫下用固定化過夜的 Genovis的GlySERIAS 消化。通過LC-MS對消解樣品的直接分析表明，所有三個(gè)連接子區(qū)域均被消解，α-CD3 VL和VH鏈洗脫為一個(gè)色譜峰，α-CD19 VH和VL鏈作為單獨(dú)的峰洗脫。來自連接的 α-CD3 VH 和 α-CD19 VH 結(jié)構(gòu)域的小峰顯示該短連接子未完全消化，表明 GlySERIAS 對短連接子的活性較低。與完整的蛋白質(zhì)分析相比，四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離提供了具有單同位素分辨率的高質(zhì)量光譜?？梢杂^察到每個(gè)結(jié)構(gòu)域的幾個(gè)不同變體，剩余的連接子殘基數(shù)量不同。在色譜分離過程中，α-CD3 VH結(jié)構(gòu)域無法從α-CD19 VH結(jié)構(gòu)域完全基線分離，導(dǎo)致在相關(guān)質(zhì)譜中觀察到一些共洗脫。四個(gè)結(jié)構(gòu)域的分離產(chǎn)生了有關(guān)在完整蛋白質(zhì)水平上鑒定的蛋白質(zhì)修飾位置的信息。例如，在完整水平上鑒定的 37 Da 的蛋白質(zhì)修飾被分配給 α-CD3 VH 鏈。此外，240Da 和 320da 的兩個(gè)修飾分別被分配給 α-CD3 VL 結(jié)構(gòu)域。后者還含有一個(gè)帶有五六個(gè)組氨酸殘基的 His 標(biāo)簽。這些數(shù)據(jù)證明了使用 Genovis的GlySERIAS Immobilized 對包含多個(gè)柔性連接子蛋白進(jìn)行質(zhì)量控制的中級工作流程的強(qiáng)大功能。消化在1小時(shí)內(nèi)完成，且具有特異性。即使孵育時(shí)間延長，也沒有過度消化的風(fēng)險(xiǎn)。

與IdeS不同，為了獲得更均勻的度拉糖肽融合蛋白的消化產(chǎn)物，用Genovis的GlySERIAS固定化蛋白質(zhì)消化該蛋白質(zhì)，該蛋白由與瓊脂糖珠共價(jià)偶聯(lián)的GlySERIAS酶組成。通過將酶偶聯(lián)到樹脂上，可以增加酶與蛋白質(zhì)的比率，從而可以進(jìn)一步加速反應(yīng)，以獲得更完整的連接子消化。此外，該酶不會存在于樣品制備中，可能會干擾樣品分析。為了進(jìn)行比較，度拉糖肽在37°C下用GlySERIAS固定化過夜，或用GlySERIAS凍干1小時(shí)并在37°C下過夜消化。 為了降低樣品復(fù)雜性，使用內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR凍干去除Fc聚糖，并減少鏈間二硫鍵。通過反相LC-MS對樣品的分析表明，GlySERIAS Immobilized幾乎完全消化了Fc結(jié)構(gòu)域中的連接子，留下了接近均質(zhì)的Fc/2產(chǎn)物，其中含有來自連接子的一個(gè)絲氨酸殘基。用 GlySERIAS 凍干 1 小時(shí)或過夜消化，兩者都會產(chǎn)生幾種 Fc 產(chǎn)物，并附著不同數(shù)量的絲氨酸和甘氨酸殘基。GLP-1肽在所有三個(gè)樣品中以兩種變體存在。使用GlySERIAS固定化消化的均質(zhì)Fc/2能夠詳細(xì)研究特定于Fc區(qū)域的質(zhì)量屬性。此外，在樣品中未觀察到干擾分析的酶峰。作為補(bǔ)充，F(xiàn)c/2 產(chǎn)物在用 GlySERIAS 凍干消化后殘留部分連接子，有助于研究位于 GS 連接子的修飾。GlySERIAS酶能夠分離多功能融合蛋白的各個(gè)結(jié)構(gòu)域，以促進(jìn)表征并增加對這些分子的理解。天津FabRICATOR ZIdeS蛋白酶蛋白組學(xué)

Genovis提供具有低水平內(nèi)du素的FabRICATOR （IdeS）凍干。山西FabULOUSIdeS蛋白酶抗體酶切

對于攜帶突變鉸鏈的 Fc 融合蛋白或抗體來說，F(xiàn)ab 和 Fc 片段的生成可能具有挑戰(zhàn)性。Genovis的GingisKHAN酶在鉸鏈上方一個(gè)可觸及的賴氨酸位點(diǎn)消化人IgG1，在足夠溫和的還原條件下保留鏈內(nèi)和鏈間二硫鍵，從而產(chǎn)生完整的Fab和Fc片段。對于融合蛋白，消化通常在鉸鏈上方獲得，但融合伴侶的結(jié)構(gòu)和氨基酸序列可能導(dǎo)致其他暴露的消化位點(diǎn)。如果去除保守的 Fc N-聚糖，F(xiàn)c 中的第二個(gè)切割位點(diǎn)也可能被GingisKHAN酶切。將精選的單克隆人 IgG1 抗體和 Fc 融合蛋白與 GingisKHAN 在 37°C 下孵育 1 小時(shí)，并通過 HPLC 進(jìn)行分析。山西FabULOUSIdeS蛋白酶抗體酶切