Genovis的FabRICATOR MagIC自動(dòng)樣品制備可用于分析和監(jiān)測(cè)不同的CQA。mAb在生產(chǎn)或儲(chǔ)存過程中的氧化就是這樣一種CQA，可能會(huì)影響zhiliao產(chǎn)品的質(zhì)量。為了展示FabRICATOR MagIC如何解決這個(gè)問題，對(duì)6種mAb的混合物進(jìn)行強(qiáng)制降解（室溫下3個(gè)月），并通過反相LC-MS進(jìn)行分析。當(dāng)在完整水平上分析mAb時(shí)，可以檢測(cè)到mAb5豐度的顯著差異，同時(shí)出現(xiàn)許多新的峰。然而，無法獲得可靠的質(zhì)量數(shù)據(jù)。使用FabRICATOR MagIC，mAb5變化的來源在Fab區(qū)域內(nèi)。隨后還原為 Fc/2、LC 和 Fd' 片段，可以識(shí)別差異是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化，通過形成氧代內(nèi)酯 （+14 Da） 和二氧代內(nèi)酯 （+30 Da） 以及 mAb5 LC （-18 Da） 的琥珀酰亞胺化來揭示。此外，還可檢測(cè)到mAb3輕鏈的異構(gòu)化。該示例說明了FabRICATOR MagIC在mAb中級(jí)分析中的強(qiáng)大功能，它創(chuàng)建的片段足夠小，可以精確定位特定的修飾，而無需耗時(shí)耗費(fèi)資源的肽圖分析，所有這些都以相對(duì)較少的手動(dòng)操作時(shí)間快速完成。Genovis的FabDELLO酶在底物（包括LALA和LFLE突變的IgG1)上的有效性。河北IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

對(duì)于涉及完整Fab或Fc抗體片段的應(yīng)用，需要在抗體鉸鏈處進(jìn)行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等傳統(tǒng)酶可用于生成 Fab 片段，但非特異性酶活性需要仔細(xì)優(yōu)化，以極大限度地降低多個(gè)消化位點(diǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一個(gè)消化位點(diǎn)，可從人 IgG1 生成均質(zhì)的 Fab 和 Fc 抗體片段。生成的片段可用于結(jié)晶和高階結(jié)構(gòu) （HOS） 的 NMR 研究、結(jié)合研究等。在這里，我們提出了獲得完整Fab和Fc抗體片段的不同策略。所得片段顯示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或從依那西普上的融合 TNFR 結(jié)構(gòu)域中分離 Fc。由于 GingisKHAN 的特異性消化依賴于 IgG 的天然折疊，因此在變性條件下特異性受到負(fù)面影響。為了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上樣緩沖液之前，停止在分析樣品中加入碘乙酰胺的反應(yīng)。Genovis同時(shí)提供IdeS酶的純化試劑盒。河北IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶單一酶切位點(diǎn)和質(zhì)譜的精度確保了Fc糖基化譜檢測(cè)，用于監(jiān)測(cè)批次間的一致性和其他關(guān)鍵質(zhì)量屬性。

與IdeS不同，Genovis的GingisREX（RgpB）是一種精氨酸特異性蛋白酶，可消化精氨酸殘基的C末端蛋白質(zhì)，包括難以與其他酶消化的Arg-Pro鍵。該酶可用于肽圖分析、從頭肽測(cè)序和翻譯后修飾分析。精氨酸殘基的特異性C-末端消化；在其他困難的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化；產(chǎn)生更長(zhǎng)的肽-提高序列覆蓋率。GingisREX是一種半胱氨酸蛋白酶，可特異性地消化肽鍵C末端到精氨酸殘基，包括與脯氨酸相連的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。與胰蛋白酶消化相比，可生成更長(zhǎng)的肽，胰蛋白酶消化可以通過高分辨率質(zhì)譜進(jìn)行分離和鑒定。這為自下而上方法的樣品制備提供了更多選擇，以實(shí)現(xiàn)替代的酶解曲線和更高的序列覆蓋率。GingisREX在賴氨酸上沒有活性，通常使用Arg-C觀察到。該酶在5.0-9.0的寬pH值范圍內(nèi)具有活性，它需要半胱氨酸并被鹽酸胍抑制。該酶是從牙齦卟啉單胞菌中純化的。

抗體 Fc 糖基化譜是一種重要的 CQA，因?yàn)樗鼤?huì)影響療效、和免疫原性。因此，需要從早期開發(fā)、工藝開發(fā)到質(zhì)量控制和批量放行的整個(gè)過程對(duì)Fc聚糖譜進(jìn)行監(jiān)測(cè)。傳統(tǒng)的分析方法基于對(duì)游離的聚糖進(jìn)行熒光標(biāo)記，然后通過HILIC-HPLC或CE進(jìn)行分析，這需要多步驟的樣品制備方案，這需要大量的時(shí)間和資源。使用Genovis的FabRICATOR MagIC酶解mAb，然后使用LC-MS進(jìn)行中級(jí)分析，為Fc聚糖分析提供了一種快速、直接的替代方法。如上所示，它很容易實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化，以提高通量并降低處理錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)?？稍谥劓溨?CH2 結(jié)構(gòu)域下方的一個(gè)特定位點(diǎn)消化人 IgM，產(chǎn)生均質(zhì)的 F（ab'）2 和 Fc 片段。

蛋白酶用于生成肽，用于質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)。這些應(yīng)用包括蛋白質(zhì)組學(xué)和生物制藥的深度表征。由于遺漏了切割和樣品制備誘導(dǎo)的偽影，傳統(tǒng)的蛋白酶并不總是理想的，因此需要具有不同特異性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一種精氨酸特異性蛋白酶，可將蛋白質(zhì) C 末端消化為精氨酸殘基。與胰蛋白酶肽相比，所得肽更長(zhǎng)，并可能導(dǎo)致序列覆蓋率增加。質(zhì)譜分析中蛋白酶的特異性對(duì)于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集和避免復(fù)雜的數(shù)據(jù)解釋至關(guān)重要。作為模型底物，使用胰島素氧化β鏈來比較 GingisREX 和 ArgC 的酶特異性。胰島素氧化β鏈含有一個(gè)精氨酸和一個(gè)賴氨酸殘基。在RP-HPLC和質(zhì)譜法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在賴氨酸殘基上沒有酶活性或其他額外活性，即使在長(zhǎng)時(shí)間孵育過夜后，酶與底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸殘基上顯示出主要活性，但在賴氨酸殘基上也可以看到酶消化。在酶與底物的比例為 1：20 和過夜孵育下，證明了 ArgC 的額外非特異性活性。在相同條件下，GingisREX未檢測(cè)到這種情況。數(shù)據(jù)證實(shí)了GingisREX精氨酸殘基的特異性活性，并顯示使用Arg-C在賴氨酸和其他殘基處的非特異性消化。在大多數(shù)IgG上，您可以在短短30分鐘內(nèi)生成F(ab’)2和Fc/2片段。河北IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

GlySERIAS是從噬菌體K克隆而來的，在大腸桿菌中表達(dá)。該酶含有 His 標(biāo)簽，分子量為 18 kDa。河北IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶

與IdeS不同，度拉糖肽由兩個(gè)胰高xue糖素樣肽-1 （GLP-1） 分子組成，它們通過柔性 GS 接頭連接到人 IgG4 的 Fc 區(qū)域。為了分別研究肽和 Fc 區(qū)域，從而鑒定結(jié)構(gòu)域特異性 PTM，用 Genovis的GlySERIAS 在 37°C 下凍干消化度拉糖肽 1 小時(shí)。為了降低樣品復(fù)雜性，使用內(nèi)切糖苷酶GlycINATOR Lyophilized去除Fc聚糖，并用DTT還原鏈間二硫鍵。反相LC-MS對(duì)樣品的分析表明，使用GlySERIAS進(jìn)行連接子消化后，肽從Fc區(qū)域完全去除。連接子中的大量甘氨酸殘基為GlySERIAS提供了許多不同的潛在消化位點(diǎn)，這就是為什么Fc/2和GLP-1肽都被檢測(cè)為幾種變體，其中不同數(shù)量的甘氨酸和絲氨酸殘基仍然連接。此外，還鑒定了GLP-1肽的氧化。盡管GlySERIAS同時(shí)在多個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行消化，但一式三份的酶解在獲得的不同F(xiàn)c/2變體的相對(duì)量中顯示出可重復(fù)的結(jié)果。河北IgGZEROIdeS蛋白酶IgG特異性蛋白酶