與IdeS不同,Genovis的FabULOUS(SpeB)是一種半胱氨酸蛋白酶,可在來自多個不同物種和亞類的IgG的鉸鏈區(qū)域消化,產生Fab和Fc片段。人、小鼠、大鼠、山羊和綿羊的IgG被FabULOUS消化,產生Fab和Fc片段。人IgG1的主要消化位點是......KTHT...例如,制備的Fab片段可用于親和力研究、Fab糖基化研究和結構研究。對來自多個物種和亞類的IgG有活性–上鉸鏈區(qū)域的消化物;快速-在一小時內生成Fab和Fc片段;有效消化小鼠IgG1。FabULOUS來源于化膿性鏈球菌,在大腸桿菌中表達。FabULOUS的分子量為29kDa,該酶含有His標簽。如mAb在生產或儲存過程中的氧化,它可能會影響zhiliao產品的質量。IdeS蛋白酶
Genovis的FabRICATOR MagIC自動樣品制備可用于分析和監(jiān)測不同的CQA。mAb在生產或儲存過程中的氧化就是這樣一種CQA,可能會影響zhiliao產品的質量。為了展示FabRICATOR MagIC如何解決這個問題,對6種mAb的混合物進行強制降解(室溫下3個月),并通過反相LC-MS進行分析。當在完整水平上分析mAb時,可以檢測到mAb5豐度的顯著差異,同時出現(xiàn)許多新的峰。然而,無法獲得可靠的質量數(shù)據(jù)。使用FabRICATOR MagIC,mAb5變化的來源在Fab區(qū)域內。隨后還原為 Fc/2、LC 和 Fd' 片段,可以識別差異是由于 mAb5 Fd' 片段上的色氨酸氧化,通過形成氧代內酯 (+14 Da) 和二氧代內酯 (+30 Da) 以及 mAb5 LC (-18 Da) 的琥珀酰亞胺化來揭示。此外,還可檢測到mAb3輕鏈的異構化。該示例說明了FabRICATOR MagIC在mAb中級分析中的強大功能,它創(chuàng)建的片段足夠小,可以精確定位特定的修飾,而無需耗時耗費資源的肽圖分析,所有這些都以相對較少的手動操作時間快速完成。IdeS蛋白酶獲得完整Fab和Fc抗體片段,用于結晶和高階結構 (HOS) 的 NMR 研究、結合研究等。
與IdeS不同,Genovis的GingisREX(RgpB)是一種精氨酸特異性蛋白酶,可消化精氨酸殘基的C末端蛋白質,包括難以與其他酶消化的Arg-Pro鍵。該酶可用于肽圖分析、從頭肽測序和翻譯后修飾分析。精氨酸殘基的特異性C-末端消化;在其他困難的精氨酸-脯氨酸序列中可靠消化;產生更長的肽-提高序列覆蓋率。GingisREX是一種半胱氨酸蛋白酶,可特異性地消化肽鍵C末端到精氨酸殘基,包括與脯氨酸相連的精氨酸。半胱氨酸是酶活性所必需的。與胰蛋白酶消化相比,可生成更長的肽,胰蛋白酶消化可以通過高分辨率質譜進行分離和鑒定。這為自下而上方法的樣品制備提供了更多選擇,以實現(xiàn)替代的酶解曲線和更高的序列覆蓋率。GingisREX在賴氨酸上沒有活性,通常使用Arg-C觀察到。該酶在5.0-9.0的寬pH值范圍內具有活性,它需要半胱氨酸并被鹽酸胍抑制。該酶是從牙齦卟啉單胞菌中純化的。
Genovis的FabRICATOR(IdeS)酶 可用于 IgG 的所有人類亞類以及人源化和嵌合 IgG。該酶對其他物種的 IgG 也有活性,包括來自大鼠、猴子、兔子和綿羊的某些類別的 IgG。因此,F(xiàn)abRICATOR的高特異性在某些情況下會使其對鉸鏈區(qū)域的突變敏感,并損害酶活性。來自小鼠 IgG2a 和 IgG3 的片段可以由 FabRICATOR Z 生成,與 FabRICATOR 相比,F(xiàn)abRICATOR Z 在消化這些 IgG 方面具有更高的效率。然而,小鼠 IgG1 在鉸鏈下方具有不同的序列,并且不被 FabRICATOR Z 消化。對于這種抗體種類,F(xiàn)abULOUS 和 FabULOUS Fab 試劑盒可用于制備 Fab 片段。Blinatumomab(一種對 CD19 和 T 細胞標志物 CD3 具有特異性的 BiTE 分子)。
Genovis將固定化酶固定在磁珠上,用于在鉸鏈下方自動消化IgG。FabRICATOR(IdeS)是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶,可消化鉸鏈下方單個氨基酸位點的抗體,產生均質的F(ab')2和Fc片段。FabRICATORMagIC磁珠含有FabRICATOR固定化酶。這些微球能夠在中級表征工作流程中并行快速自動酶解多種抗體。它們專為自動化平臺而設計,但在無法實現(xiàn)自動化的情況下,在振動臺上的表現(xiàn)同樣出色。酶切消解后,樣品可直接轉移到LC-MS的自動進樣器進行快速色譜分析,或轉移到其他分析方法進行分析。自動平行抗體酶切和亞基生成允許處理與克隆選擇、工藝開發(fā)和潛在生物制藥穩(wěn)定性研究相關的大量樣品。自動抗體亞基分析可減少操作人員的時間和樣品處理錯誤的風險,并提高通量。Genovis的FabULOUS (SpeB)制備的Fab片段可用于親和力研究、Fab糖基化研究和結構研究。IdeS蛋白酶
Genovis的FabRICATOR Fab2 (IdeS蛋白酶)試劑盒可消化兔 IgG。IdeS蛋白酶
與肽圖譜相比,根據(jù)Genovis科學家的經(jīng)驗,尤其是對于像抗體這樣的分子,許多人在常規(guī)實驗中做了太多的肽圖譜,而中級水平(Middle-level)的方法可以很好地工作。中級方法(IdeS酶切抗體)需要更少的實際操作步驟和較少的示例處理,所有這些都意味著過程中出錯的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺方法,同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體,這不是肽圖的情況下,可能需要優(yōu)化整個樣品制備,LC分離,質譜設置和數(shù)據(jù)分析的每個不同的抗體分析。這些變化可能是很小的,但沒有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡單性,中級方法非常適合自動化和高通量的工作流程。肽圖當然可以自動用于樣品制備,但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù),仍然需要徹底分析。事實上,肽圖譜是一個多步驟的過程,每一個步驟都可能破壞方法,并可能導致破壞蛋白質的人工制品,很難交叉訓練給非專業(yè)人員。中級水平的方法很容易交叉訓練,我們的方法在質量控制實驗室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認的方法,但一旦完成了這一工作,我相信使用中級分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。IdeS蛋白酶
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