常規(guī)生物學實驗中,實時定量PCR技術(RT-PCR)普遍用于microRNA的檢測實踐中,但外泌體樣品中的microRNA豐度極低,普通RT-PCR技術的靈敏度已經(jīng)不能夠滿足。第三代微滴式數(shù)字PCR——ddPCR技術,成為外泌體microRNA檢測的選擇技術。微滴式數(shù)字PCR(DropletdigitalPCR),又成為“油包水PCR”,在傳統(tǒng)的PCR擴增前對樣品進行微滴化處理,即將含有核酸分子的反應體系分成成千上萬個納升級的微滴,其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子,或者含有一個至數(shù)個待檢核酸靶分子。經(jīng)PCR擴增后,逐個對每個微滴進行檢測,有熒光信號的微滴判讀為1,沒有熒光信號的微滴判讀為0,根據(jù)泊松分布原理及陽性微滴的個數(shù)與比例即可得出靶分子的起始拷貝數(shù)或濃度。外泌體功能在研究初期階段發(fā)現(xiàn)是參與細胞成熟過程中去除不必要的蛋白質(zhì)。腦脊液外泌體iTRAQ
外泌體的相關成分:1、外泌體的膜同細胞一樣,是磷脂雙分子層。2、外泌體膜含有MHC-1/2蛋白,能綁定特異性的肽鏈。3、外泌體膜中有跨膜蛋白PGRL、LAMP1、LAMP2。4、外泌體膜中有膜轉運融合蛋白annexins、RAN、GTPases。5、外泌體膜上有脂質(zhì)筏Chol、ceramide、SM、PC,限制膜流動,參與包括跨膜信號轉導、物質(zhì)內(nèi)吞、脂質(zhì)及蛋白定向分選的多種功能。6、外泌體中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA;同時還有一些蛋白、脂類也能被包裹到外泌體中。7、與外泌體產(chǎn)生相關的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族。8、一些物質(zhì)進行外泌體中是特異性的:如hnRNPA2B1能結合lncRNA或miRNA特異性的序列(GGAG/CCCU),進行主動包埋。外泌體的膜同細胞一樣,是磷脂雙分子層。植物外泌體提取試劑盒廠家利用外泌體自身的物理化學性質(zhì)所研發(fā)的各種市售的外泌體分離提取試劑盒也能達到分離效果。
細胞攝取診療性外泌體:從樹突狀細胞、成纖維細胞和間充質(zhì)細胞中分離出的診療性外泌體可對靶細胞產(chǎn)生特定的作用,包括新抗原呈遞、免疫調(diào)節(jié)和藥物有效載荷傳遞。診療性外泌體對靶細胞的影響可能是通過不同的進入或相互作用機制來控制的。完整的外泌體的進入可能包括受體介導的內(nèi)吞作用、網(wǎng)格蛋白包被小凹、脂筏、吞噬作用、小凹和大胞飲作用。外泌體內(nèi)容物的進入或外泌體信號的誘導可能涉及配體受體誘導的細胞內(nèi)信號或融合,從而將外泌體內(nèi)容物沉積到細胞質(zhì)中。近年來,隨著外泌體研究的不斷深入,它的應用已經(jīng)涉及醫(yī)學基礎和免疫領域、寄生蟲領域。
超速離心是外泌體提取較常用的方法也被認為是金標準,主要是根據(jù)外泌體的沉降系數(shù)、大小和形狀將其分離出來。首先4℃低速離心(300-500g,10min)去除死細胞以及細胞碎片,隨后以較高離心速度(2000xg,10min)去除生物聚合物以及凋亡小體,然后用10000xg,30min離心去除大型囊泡,結尾以超速離心沉淀外泌體。通過懸浮以及重復超速離心去除外泌體沉淀中的非外泌體蛋白。超速離心法具有操作簡單、不易被分離試劑污染、獲得的外泌體數(shù)量較多等優(yōu)點。但是此方法需要昂貴的超高速離心機,每次處理的樣本量較小,費時,電鏡鑒定時還發(fā)現(xiàn)外泌體易聚集成塊,且上清中仍能檢測到大型囊泡,純度不高,另外高速離心會損傷外泌體影響下游實驗。外泌體膜含有MHC-1/2蛋白,能綁定特異性的肽鏈。
流式細胞技術是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測的準確性也在不斷上升。將外泌體表面特異性標志物CD63、CD81等相應抗體進行標記,可用流式細胞儀檢測到陽性表達,從而實現(xiàn)對外泌體的定量。但流式細胞技術檢測時需要單顆粒懸浮液,當外泌體濃度高或分離過程中發(fā)生外泌體囊泡聚集時將導致一次觀察到多個顆粒,從而導致數(shù)據(jù)不準確。因此,為了通過流式細胞儀觀察,需要將外泌體通過免疫捕獲或共價結合固定在磁珠表面上,從而便于將外泌體囊泡暴露于已知或者預期在外泌體表面表達的抗原的熒光偶聯(lián)抗體中。在流式細胞術之前,可在落射熒光顯微鏡(EPI)下觀察與磁珠和熒光抗體偶聯(lián)的外泌體囊泡。當樣品通過流式細胞儀時采集熒光信號,不只可以對外泌體進行高通量分析,還可以基于抗原表達對外泌體進行定量或分類。外泌體產(chǎn)生于細胞中的多泡體。廣州外泌體iTRAQ
外泌體作為蛋白質(zhì)的藥物遞送載體。腦脊液外泌體iTRAQ
外泌體的臨床應用:間充質(zhì)干細胞是目前較普遍使用的細胞類型,它具有自我更新,多向分化、分泌細胞因子和細胞外囊泡體、免疫調(diào)節(jié)、來源普遍等特點,在臨床診療中取得了良好的成果。間充質(zhì)干細胞來源外泌體與間充質(zhì)干細胞有著相似的功能,包括修復與再生組織、阻止炎癥反應及調(diào)節(jié)機體免疫,但外泌體相對于間充質(zhì)干細胞又有許多優(yōu)勢。首先,間充質(zhì)干細胞來源外泌體更穩(wěn)定,更好保存,易于管理和控制,可以人為改變其內(nèi)容物的種類和數(shù)量。其次,它們沒有活細胞,不會像間充質(zhì)干細胞那樣可能會過多增殖而放大療效或者病變導致疾病加重;另外,它有可能避免某些針對間充質(zhì)干細胞的調(diào)控問題,間充質(zhì)干細胞來源外泌體有代替間充質(zhì)干細胞的趨勢。干細胞外泌體攝取流式細胞技術是細胞和小顆粒定性和定量表征的有效方法,其用于外泌體定量檢測的準確性也在不斷上升。腦脊液外泌體iTRAQ
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