蛋白酶用于生成肽，用于質(zhì)譜分析蛋白質(zhì)。這些應(yīng)用包括蛋白質(zhì)組學(xué)和生物制藥的深度表征。由于遺漏了切割和樣品制備誘導(dǎo)的偽影，傳統(tǒng)的蛋白酶并不總是理想的，因此需要具有不同特異性的蛋白酶工具箱。Genovis的GingisREX 是一種精氨酸特異性蛋白酶，可將蛋白質(zhì) C 末端消化為精氨酸殘基。與胰蛋白酶肽相比，所得肽更長(zhǎng)，并可能導(dǎo)致序列覆蓋率增加。質(zhì)譜分析中蛋白酶的特異性對(duì)于獲得高質(zhì)量的數(shù)據(jù)集和避免復(fù)雜的數(shù)據(jù)解釋至關(guān)重要。作為模型底物，使用胰島素氧化β鏈來(lái)比較 GingisREX 和 ArgC 的酶特異性。胰島素氧化β鏈含有一個(gè)精氨酸和一個(gè)賴氨酸殘基。在RP-HPLC和質(zhì)譜法上分析GingisREX和ArgC的酶切肽。GingisREX在賴氨酸殘基上沒(méi)有酶活性或其他額外活性，即使在長(zhǎng)時(shí)間孵育過(guò)夜后，酶與底物的比例也很高（1：5）。然而，ArgC在精氨酸殘基上顯示出主要活性，但在賴氨酸殘基上也可以看到酶消化。在酶與底物的比例為 1：20 和過(guò)夜孵育下，證明了 ArgC 的額外非特異性活性。在相同條件下，GingisREX未檢測(cè)到這種情況。數(shù)據(jù)證實(shí)了GingisREX精氨酸殘基的特異性活性，并顯示使用Arg-C在賴氨酸和其他殘基處的非特異性消化。Genovis發(fā)現(xiàn)更多的緩沖液與FabRICATOR活性兼容。云南FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切

與肽圖譜相比，根據(jù)Genovis科學(xué)家的經(jīng)驗(yàn)，尤其是對(duì)于像抗體這樣的分子，許多人在常規(guī)實(shí)驗(yàn)中做了太多的肽圖譜，而中級(jí)水平（Middle-level）的方法可以很好地工作。中級(jí)方法（IdeS酶切抗體）需要更少的實(shí)際操作步驟和較少的示例處理，所有這些都意味著過(guò)程中出錯(cuò)的事情更少。我們的許多酶可以作為平臺(tái)方法，同樣的方法適用于絕大多數(shù)的抗體，這不是肽圖的情況下，可能需要優(yōu)化整個(gè)樣品制備，LC分離，質(zhì)譜設(shè)置和數(shù)據(jù)分析的每個(gè)不同的抗體分析。這些變化可能是很小的，但沒(méi)有一種適用于所有肽圖的方法。由于分析和數(shù)據(jù)分析的簡(jiǎn)單性，中級(jí)方法非常適合自動(dòng)化和高通量的工作流程。肽圖當(dāng)然可以自動(dòng)用于樣品制備，但高通量肽圖生成大量數(shù)據(jù)，仍然需要徹底分析。事實(shí)上，肽圖譜是一個(gè)多步驟的過(guò)程，每一個(gè)步驟都可能破壞方法，并可能導(dǎo)致破壞蛋白質(zhì)的人工制品，很難交叉訓(xùn)練給非專業(yè)人員。中級(jí)水平的方法很容易交叉訓(xùn)練，我們的方法在質(zhì)量控制實(shí)驗(yàn)室中被成功地使用。肽圖譜是一種用于修飾分析和氨基酸確認(rèn)的方法，但一旦完成了這一工作，我相信使用中級(jí)分析可以成功地更有效地完成抗體樣本的大部分工作。云南FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切三個(gè)柔性 GS 連接子均被切開(kāi)，這有助于識(shí)別Fc區(qū)域的修飾。

對(duì)于涉及完整Fab或Fc抗體片段的應(yīng)用，需要在抗體鉸鏈處進(jìn)行消化。木瓜蛋白酶和 Lys-C 等傳統(tǒng)酶可用于生成 Fab 片段，但非特異性酶活性需要仔細(xì)優(yōu)化，以極大限度地降低多個(gè)消化位點(diǎn)的風(fēng)險(xiǎn)。Genovis的SmartEnzymes IgG 蛋白酶 GingisKHAN 和 FabALACTICA 具有一個(gè)消化位點(diǎn)，可從人 IgG1 生成均質(zhì)的 Fab 和 Fc 抗體片段。生成的片段可用于結(jié)晶和高階結(jié)構(gòu) （HOS） 的 NMR 研究、結(jié)合研究等。在這里，我們提出了獲得完整Fab和Fc抗體片段的不同策略。所得片段顯示 GingisKHAN 的有效消化，用于生成完整的 Fab 片段或從依那西普上的融合 TNFR 結(jié)構(gòu)域中分離 Fc。由于 GingisKHAN 的特異性消化依賴于 IgG 的天然折疊，因此在變性條件下特異性受到負(fù)面影響。為了使用SDS-PAGE分析消解效率，在加入SDS上樣緩沖液之前，停止在分析樣品中加入碘乙酰胺的反應(yīng)。Genovis同時(shí)提供IdeS酶的純化試劑盒。

在Genovis，我們的策略是幫助客戶進(jìn)行中級(jí)（或亞基）分析，這是我們的工作，特別是我們的蛋白質(zhì)酶切產(chǎn)品。完整質(zhì)量和肽圖譜是蛋白質(zhì)表征的常用方法，我們發(fā)現(xiàn)，與簡(jiǎn)單但信息有限的完整質(zhì)量和高度復(fù)雜但信息豐富的肽圖譜相比，中級(jí)方法具有優(yōu)勢(shì)。通過(guò)執(zhí)行中級(jí)描述，您可以生成從完整的質(zhì)量實(shí)驗(yàn)中獲得的所有信息，具有額外的優(yōu)勢(shì)。在對(duì)抗體進(jìn)行完整質(zhì)量分析時(shí)，很難明確地識(shí)別某些修飾。質(zhì)譜儀器正在改進(jìn)，可以更有效地分析更大的分子，但通過(guò)使用我們的SmartEnzymes，如IdeS，可以將抗體分解成更小的片段，這提高了這些實(shí)驗(yàn)可以執(zhí)行的分辨率，因此，增加了鑒定修飾的信心。此外，你不僅能夠更好地識(shí)別修改，而且你能夠?qū)⑺鼈兌ㄎ坏降鞍踪|(zhì)上的單個(gè)結(jié)構(gòu)域，這是你在完整水平上無(wú)法做到的。自動(dòng)抗體亞基分析可減少操作人員的時(shí)間和樣品處理錯(cuò)誤的風(fēng)險(xiǎn)，并提高通量。

Genovis提供FabRICATOR（IdeS）驗(yàn)證包。三種不同批次的凍干酶，用于驗(yàn)證基于FabRICATOR的分析方法。FabRICATOR（IdeS）是一種IgG特異性半胱氨酸蛋白酶，可消化鉸鏈下方單個(gè)氨基酸位點(diǎn)的抗體，產(chǎn)生均質(zhì)的F（ab'）2和Fc片段。FabRICATOR酶已成為生物制藥行業(yè)中使用的工具，用于表征用于zhiliao用途的單克隆抗體、Fc融合蛋白、ADC和生物仿制藥。每批FabRICATOR酶在釋放前都經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的酶活性、特性和純度測(cè)試。FabRICATOR驗(yàn)證試劑盒由三批凍干酶組成，使方法驗(yàn)證更容易。每批都附有一份分析證書(shū)。QC應(yīng)用的簡(jiǎn)化方法驗(yàn)證；批次間變異性評(píng)估的理想形式；提高批量放行檢測(cè)性能的可信度。Genovis提供凍干和固定化的FabRICATOR（IdeS），為客戶提供了許多選擇，滿足他們的需求。云南FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切

使用胰島素氧化β鏈來(lái)比較GingisREX和ArgC的酶特異性。云南FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切

Genovis酶的適應(yīng)性和更高的通量和自動(dòng)化工作流程的中級(jí)方法，這是非常重要的。 隨著分析方法和儀器的改進(jìn)，在表征實(shí)驗(yàn)室中有更大的能力進(jìn)行更多類型的分析，或者在工藝開(kāi)發(fā)或QC實(shí)驗(yàn)室中有更先進(jìn)的分析儀器。 當(dāng)涉及到能夠支持大量樣本分析的活動(dòng)時(shí)，例如克隆篩選，工藝開(kāi)發(fā)和驗(yàn)證以及穩(wěn)定性研究，這是非常好的。 此外，Genovis產(chǎn)品的效率、健壯性（Robust）和易用性使它們更容易應(yīng)用于這些類型的工作，而且，也適用于受控環(huán)境中的批次放行方法。Genovis的產(chǎn)品很好地支持這種類型的工作，這也促使Genovis不斷推出新產(chǎn)品和現(xiàn)有產(chǎn)品的不同形式，以支持客戶的工作。云南FabDELLOIdeS蛋白酶抗體酶切