Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個循環(huán)的熒光信號,同一次反應中針對不同的基因需單獨設(shè)置基線。閾值(threshold):自動設(shè)置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍。手動設(shè)置:置于指數(shù)擴增期,剛好可以清楚地看到熒光信號明顯增強。同一次反應中針對不同的基因可單獨設(shè)置閾值,但對于同一個基因擴增一定要用同一個閾值。Ct值:與起始濃度的對數(shù)成線性關(guān)系,分析定量時候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會導致定量的不準確。相對定量:通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計算基因之間的表達差異,一般是2-△△Ct。或者是考慮擴增效率的Pfaffl法。PCR反應的特異性決定因素為:引物與模板DNA特異正確的結(jié)合。武漢特殊樣本Real-time PCR研究方案
Real-time PCR實驗注意事項-防止RNA酶污染的措施:1.所有的玻璃器皿均應在使用前于180℃的高溫下干烤6hr或更長時間。2.塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿沖洗(注意:有機玻璃器具因可被氯仿腐蝕,故不能使用)。3.有機玻璃的電泳槽等,可先用去污劑洗滌,雙蒸水沖洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2室溫10min,然后用0.1%DEPC水沖洗,晾干。4.配制的溶液應盡可能的用0.1%DEPC,在37℃處理12hr以上。然后用高壓滅菌除去殘留的DEPC。不能高壓滅菌的試劑,應當用DEPC處理過的無菌雙蒸水配制,然后經(jīng)0.22μm濾膜過濾除菌。5.操作人員戴一次性口罩、帽子、手套,實驗過程中手套要勤換。6.設(shè)置RNA操作專業(yè)使用實驗室,所有器械等應為專業(yè)使用。廣州血液RT-PCR檢測技術(shù)原理Real-time PCR的基本目標是精確測量和鑒別非常微量的特異性核酸。
Real-time PCR鏈反應的常見問題分析與解決方法:反應緩沖液未完全融化或未充分混勻。確保反應緩沖液融化完全并徹底混勻。引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計引物。引物量過多。減少反應體系中引物的用量。模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應<50ng,而基因組DNA則應<200ng。外源DNA污染。確保操作的潔凈。陰性對照出現(xiàn)條帶:試劑,頭,工作臺污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。條帶大小與理論不符:污染。使用全新的試劑和頭,對工作臺進行清潔。模板或引物使用錯誤。更換引物和模板。基因亞型。對研究的基因進行序列分析和BLAST研究。逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應較廣用于表達譜,以確定基因的表達或鑒定RNA轉(zhuǎn)錄物的序列。
Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待檢測的樣本中是否存在我們想要檢測的成分,即待檢測成分有無的分析。通常,定性分析可以應用于病毒以及病原菌的檢測,物種鑒定以及基因分型等。病毒及病原菌檢測,如SARS、H1N1病毒,都可以通過Real-time PCR的方法進行高靈敏度的檢測,定性分析樣本是否已被病毒傳播。物種鑒定如我們國家的一些檢驗檢疫機構(gòu),想要檢測進口的牛肉制品中是否含有雞源、豬源或鴨源等成分,或者用于檢測羊奶中是否會摻有牛奶等等,可以通過Real-time PCR的方法進行檢測?;蚍中?,如啤酒型,肥胖型基因的檢測,就是Real-time PCR在基因分型方面的應用。許多疾病的未知病因的測序正在通過聚合酶鏈反應得到解決。
Real-time PCR實驗常用的RNA酶抑制劑:1.焦磷酸二乙酯(DEPC):是一種強烈但不徹底的RNA酶抑制劑。它通過和RNA酶的活性基團組氨酸的咪唑環(huán)結(jié)合使蛋白質(zhì)變性,從而抑制酶的活性。2.異硫氰酸胍:目前被認為是較有效的RNA酶抑制劑,它在裂解組織的同時也使RNA酶失活。它既可破壞細胞結(jié)構(gòu)使核酸從蛋白中解離出來,又對RNA酶有強烈的變性作用。3.氧釩核糖核苷復合物:由氧化釩離子和核苷形成的復合物,它和RNA酶結(jié)合形成過渡態(tài)類物質(zhì),幾乎能完全抑制RNA酶的活性。4.RNA酶的蛋白抑制劑(RNasin):從大鼠肝或人胎盤中提取得來的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一種非競爭性抑制劑,可以和多種RNA酶結(jié)合,使其失活。5.其它:SDS、尿素、硅藻土等對RNA酶也有一定抑制作用。聚合酶鏈式反應中的DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。廈門組織熒光PCR應用
Real-time PCR提高實驗的重復性。武漢特殊樣本Real-time PCR研究方案
內(nèi)標在傳統(tǒng)定量中的作用,由于傳統(tǒng)定量方法都是終點檢測,即PCR到達平臺期后進行檢測,而PCR經(jīng)過對數(shù)期擴增到達平臺期時,檢測重現(xiàn)性極差。同一個模板在96孔PCR儀上做96次重復實驗,所得結(jié)果有很大差異,因此無法直接從終點產(chǎn)物量推算出起始模板量。加入內(nèi)標后,可部分消除終產(chǎn)物定量所造成的不準確性。但即使如此,傳統(tǒng)的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。內(nèi)標對定量PCR的影響,若在待測樣品中加入已知起始拷貝數(shù)的內(nèi)標,則PCR反應變?yōu)殡p重PCR,雙重PCR反應中存在兩種模板之間的干擾和競爭,尤其當兩種模板的起始拷貝數(shù)相差比較大時,這種競爭會表現(xiàn)得更為明顯。但由于待測樣品的起始拷貝數(shù)是未知的,所以無法加入合適數(shù)量的已知模板作為內(nèi)標。也正是這個原因,傳統(tǒng)定量方法雖然加入內(nèi)標,但仍然只是一種半定量的方法。武漢特殊樣本Real-time PCR研究方案
上海司鼎生物科技有限公司成立于2016-06-07,同時啟動了以司鼎;OriCell為主的免疫印跡(WB)技術(shù)服務,熒光定量PCR技術(shù)服務,膜片鉗電生理技術(shù)服務,在體光纖成像記錄技術(shù)服務產(chǎn)業(yè)布局。是具有一定實力的醫(yī)藥健康企業(yè)之一,主要提供免疫印跡(WB)技術(shù)服務,熒光定量PCR技術(shù)服務,膜片鉗電生理技術(shù)服務,在體光纖成像記錄技術(shù)服務等領(lǐng)域內(nèi)的產(chǎn)品或服務。我們在發(fā)展業(yè)務的同時,進一步推動了品牌價值完善。隨著業(yè)務能力的增長,以及品牌價值的提升,也逐漸形成醫(yī)藥健康綜合一體化能力。值得一提的是,司鼎生物致力于為用戶帶去更為定向、專業(yè)的醫(yī)藥健康一體化解決方案,在有效降低用戶成本的同時,更能憑借科學的技術(shù)讓用戶極大限度地挖掘司鼎;OriCell的應用潛能。
Real-time PCR鏈反應:嵌套聚合酶鏈反應:通過減少DNA非特異性擴增的背景,提高DNA擴增的特異性。兩組引物用于兩個連續(xù)的PCR。在個反應中,一對引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應,所述引物的結(jié)合位點完全或部分不同于次反應中使用的每個引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細的目標序列知識。重疊延伸聚合酶鏈反應或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個或多個含有互補序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)...