Real-time PCR:基線(baseline):通常是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào),同一次反應(yīng)中針對(duì)不同的基因需單獨(dú)設(shè)置基線。閾值(threshold):自動(dòng)設(shè)置是3-15個(gè)循環(huán)的熒光信號(hào)的標(biāo)準(zhǔn)偏差的10倍。手動(dòng)設(shè)置:置于指數(shù)擴(kuò)增期,剛好可以清楚地看到熒光信號(hào)明顯增強(qiáng)。同一次反應(yīng)中針對(duì)不同的基因可單獨(dú)設(shè)置閾值,但對(duì)于同一個(gè)基因擴(kuò)增一定要用同一個(gè)閾值。Ct值:與起始濃度的對(duì)數(shù)成線性關(guān)系,分析定量時(shí)候一般取Ct:15-35.太大或者太小都會(huì)導(dǎo)致定量的不準(zhǔn)確。相對(duì)定量:通過與內(nèi)參基因Ct值之間的相差來計(jì)算基因之間的表達(dá)差異,一般是2-△△Ct?;蛘呤强紤]擴(kuò)增效率的Pfaffl法。Real-time PCR的基本目標(biāo)是精確測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸。莆田骨頭RT-PCR檢測(cè)技術(shù)設(shè)計(jì)公司
Real-time PCR從用途上分可以分為定性分析和定量分析:定性分析指的是用于分析待檢測(cè)的樣本中是否存在我們想要檢測(cè)的成分,即待檢測(cè)成分有無的分析。通常,定性分析可以應(yīng)用于病毒以及病原菌的檢測(cè),物種鑒定以及基因分型等。病毒及病原菌檢測(cè),如SARS、H1N1病毒,都可以通過Real-time PCR的方法進(jìn)行高靈敏度的檢測(cè),定性分析樣本是否已被病毒傳播。物種鑒定如我們國家的一些檢驗(yàn)檢疫機(jī)構(gòu),想要檢測(cè)進(jìn)口的牛肉制品中是否含有雞源、豬源或鴨源等成分,或者用于檢測(cè)羊奶中是否會(huì)摻有牛奶等等,可以通過Real-time PCR的方法進(jìn)行檢測(cè)?;蚍中?,如啤酒型,肥胖型基因的檢測(cè),就是Real-time PCR在基因分型方面的應(yīng)用。徐州分子生物學(xué)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。
Real-time PCR鏈?zhǔn)椒磻?yīng):每次循環(huán)都得加入新的DNA聚合酶,不但操作煩瑣,而且價(jià)格昂貴,制約了PCR技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展。耐熱DNA聚合酶-Taq酶的發(fā)現(xiàn)對(duì)于PCR的應(yīng)用有里程碑的意義,該酶可以耐受90℃以上的高溫而不失活,不需要每個(gè)循環(huán)加酶,使PCR技術(shù)變得非常簡(jiǎn)捷、同時(shí)也降低了成本,PCR技術(shù)得以大量應(yīng)用,并逐步應(yīng)用于臨床。多重連接依賴探針擴(kuò)增允許用單個(gè)引物對(duì)擴(kuò)增多個(gè)靶標(biāo),從而避免多重PCR的分辨率限制。引物的設(shè)計(jì)注意事項(xiàng):1,注意引物設(shè)計(jì)好后的產(chǎn)物長度。Real-time PCR的較佳產(chǎn)物長度在150-250kb左右(書上說這樣可以增加熒光的敏感度,減少實(shí)驗(yàn)誤差,但是我對(duì)這個(gè)說法持懷疑態(tài)度。產(chǎn)物長度越大,SYBR嵌入的越多,這樣才能夠保證之后的熒光值比較可信)。2,不同的管家基因擴(kuò)增效率不同。所以在做整個(gè)實(shí)驗(yàn)之前應(yīng)該做一次檢測(cè)擴(kuò)增效率的實(shí)驗(yàn)。如果擴(kuò)增效率相差太大,就不能使用delt,deltCt法來比較基因表達(dá)量的高低。
Real-time PCR與普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌?,所以?duì)引物的設(shè)計(jì)要求也不同。普通PCR的實(shí)驗(yàn)?zāi)康闹皇菫榱双@得目的基因產(chǎn)物,允許有非特異擴(kuò)增,只要目標(biāo)條帶清晰明亮,就可以通過切膠回收的方法回收目標(biāo)條帶,之后進(jìn)行后續(xù)的克隆、測(cè)序。但Real-time PCR的目的是為了讓目的基因按照理論值或是按照接近理論值進(jìn)行擴(kuò)增,只有這樣的擴(kuò)增后續(xù)由Ct值推算出的起始量模板量才準(zhǔn)確,基于此,Real-time PCR對(duì)非特異性擴(kuò)增和引物二聚體的存在有較嚴(yán)格的要求。實(shí)時(shí)熒光定量PCR無需內(nèi)標(biāo)是建立在兩個(gè)基礎(chǔ)之上的。
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)準(zhǔn)備:PCR引物設(shè)計(jì),PCR反應(yīng)中有兩條引物,即5′端引物和3′引物。設(shè)計(jì)引物時(shí)以一條DNA單鏈為基準(zhǔn)(常以信息鏈為基準(zhǔn)),5′端引物與位于待擴(kuò)增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物與位于待擴(kuò)增片段3′端的一小段DNA序列互補(bǔ)。引物設(shè)計(jì)的基本原則:引物長度:15-30bp,常用為20bp左右。引物堿基:G+C含量以40-60%為宜,G+C太少擴(kuò)增效果不佳,G+C過多易出現(xiàn)非特異條帶。ATGC很好隨機(jī)分布,避免5個(gè)以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列參照。聚合酶鏈反應(yīng)具有定量合成產(chǎn)物的優(yōu)點(diǎn)。徐州分子生物學(xué)RT-PCR檢測(cè)技術(shù)原理及步驟
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)中的DMSO、甘油等,主要用來保持酶的活性和幫助DNA解除纏繞結(jié)構(gòu)。莆田骨頭RT-PCR檢測(cè)技術(shù)設(shè)計(jì)公司
Real-time PCR原理:所謂實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán),利用熒光信號(hào)積累實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,通過標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定量分析的方法。DNA結(jié)合染料法,應(yīng)用一種帶有熒光的、非特異的DNA結(jié)合染料檢測(cè)PCR過程中積累的擴(kuò)增產(chǎn)物。檢測(cè)所有雙鏈DNA擴(kuò)增產(chǎn)物,包括非特異反應(yīng)產(chǎn)物,如引物二聚體。可對(duì)任何雙鏈DNA進(jìn)行定量;不需要探針,因此減少了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)及運(yùn)轉(zhuǎn)成本;適合于大量基因的分析;簡(jiǎn)單易用。實(shí)時(shí)熒光定量PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR(QuantitativeReal-time PCR)是一種在DNA擴(kuò)增反應(yīng)中,以熒光化學(xué)物質(zhì)測(cè)每次聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)循環(huán)后產(chǎn)物總量的方法。通過內(nèi)參或者外參法對(duì)待測(cè)樣品中的特定DNA序列進(jìn)行定量分析的方法。Real-time PCR是在PCR擴(kuò)增過程中,通過熒光信號(hào),對(duì)PCR進(jìn)程進(jìn)行實(shí)時(shí)檢測(cè)。由于在PCR擴(kuò)增的指數(shù)時(shí)期,模板的Ct值和該模板的起始拷貝數(shù)存在線性關(guān)系,所以成為定量的依據(jù)。莆田骨頭RT-PCR檢測(cè)技術(shù)設(shè)計(jì)公司
上海司鼎生物科技有限公司位于放鶴路1088號(hào)。公司業(yè)務(wù)分為免疫印跡(WB)技術(shù)服務(wù),熒光定量PCR技術(shù)服務(wù),膜片鉗電生理技術(shù)服務(wù),在體光纖成像記錄技術(shù)服務(wù)等,目前不斷進(jìn)行創(chuàng)新和服務(wù)改進(jìn),為客戶提供良好的產(chǎn)品和服務(wù)。公司將不斷增強(qiáng)企業(yè)重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力,努力學(xué)習(xí)行業(yè)知識(shí),遵守行業(yè)規(guī)范,植根于醫(yī)藥健康行業(yè)的發(fā)展。司鼎生物秉承“客戶為尊、服務(wù)為榮、創(chuàng)意為先、技術(shù)為實(shí)”的經(jīng)營理念,全力打造公司的重點(diǎn)競(jìng)爭(zhēng)力。
Real-time PCR鏈反應(yīng):嵌套聚合酶鏈反應(yīng):通過減少DNA非特異性擴(kuò)增的背景,提高DNA擴(kuò)增的特異性。兩組引物用于兩個(gè)連續(xù)的PCR。在個(gè)反應(yīng)中,一對(duì)引物用于產(chǎn)生DNA產(chǎn)物,除了預(yù)期的靶之外,該產(chǎn)物可能仍然由非特異性擴(kuò)增的DN段組成。然后用一組引物將產(chǎn)物用于第二次聚合酶鏈反應(yīng),所述引物的結(jié)合位點(diǎn)完全或部分不同于次反應(yīng)中使用的每個(gè)引物,并且位于其中的3’。嵌套式PCR在特異性擴(kuò)增長DN段方面通常比傳統(tǒng)PCR更成功,但它需要更詳細(xì)的目標(biāo)序列知識(shí)。重疊延伸聚合酶鏈反應(yīng)或者通過重疊延伸拼接(SOEing):一種用于將兩個(gè)或多個(gè)含有互補(bǔ)序列的DN段拼接在一起的基因工程技術(shù)。它用于連接含有基因、調(diào)節(jié)...