CNV(CopyNumberVariations,拷貝數(shù)變異)研究需要極高的定量精度以區(qū)別不同拷貝數(shù)之間的微小差異,測序方法適用于高于30%的變異率檢測,而qPCR的比較**辨在1.5倍左右,數(shù)字PCR通過直接計數(shù)目標(biāo)基因與參照基因(拷貝數(shù)為1的基因,例如RNaseP)的數(shù)目, 計算比值,直接得到目標(biāo)基因的拷貝數(shù)可以達(dá)到極高的拷貝數(shù)分辨精度。除此之外,dPCR在病原微生物檢測、microRNA研究、基因表達(dá)研究、NGS測序文庫的***定量、表觀遺傳學(xué)直接相關(guān)的DNA甲基化定量檢測、ChIP定量鑒定等領(lǐng)域的應(yīng)用都令人極為期待,而在轉(zhuǎn)基因成分鑒定、分子標(biāo)準(zhǔn)品精確定量、環(huán)境樣本檢測等具體的應(yīng)用方向上,已經(jīng)有大量實驗數(shù)據(jù)和結(jié)果證明了dPCR技術(shù)的優(yōu)良性能。MicroDrop?數(shù)字PCR平臺是由永諾生物自主研發(fā)并已投入生產(chǎn)的微滴式數(shù)字PCR檢測系統(tǒng)。上海安全數(shù)字PCR銷售
數(shù)字PCR也叫DigitalPCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來的一種核酸定量分析技術(shù)。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來說,數(shù)字PCR對結(jié)果的判定不依賴于擴(kuò)增曲線循環(huán)Ct值,不受擴(kuò)增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。數(shù)字PCR基本原理是將一個樣本分成幾十到幾萬份,然后再將其分配到不同的反應(yīng)單元中,使每個微滴單元包含一個或多個拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個單元都會對目標(biāo)分子進(jìn)行擴(kuò)增,然后再對每個單元進(jìn)行熒光信號的統(tǒng)計并計算。相對而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應(yīng)都是發(fā)生于同一體系當(dāng)中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。四川易操作數(shù)字PCR咨詢報價CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證。
目前數(shù)字PCR技術(shù)在臨床領(lǐng)域已經(jīng)有著非常***且***地應(yīng)用,例如在病原微生物檢測中的應(yīng)用:HBV檢測、HIV檢測、甲型流感病毒檢測等;在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用:13/18/21號染色體三倍體檢測、遺傳性耳聾檢測、地中海貧血檢測及優(yōu)生五項的病毒檢測等;在**靶向***相關(guān)基因檢測中的應(yīng)用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測、乳腺*HER2基因 擴(kuò)增檢測、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測等。以**靶向***相關(guān)基因檢測為例,在**形成的超早期,會出現(xiàn)**細(xì)胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細(xì)胞會釋放其DNA進(jìn)入外周血,因此通過分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達(dá)到**早期篩查的目的。然而此時DNA含量極低,對檢測的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術(shù)可以檢測出來。另外進(jìn)行個體化***時,需要對基因組樣本進(jìn)行分析,此時利用數(shù)字PCR技術(shù)也能**提高結(jié)果的可信性,進(jìn)而建立合理***方案。
研究方向低豐度及稀有序列的精確定量目前對于低豐度目標(biāo)序列的檢測,定量PCR、雜交、毛細(xì)管測序及NGS等方法都因受到背景DNA的干擾,使得檢測靈敏度及精確性都達(dá)不到精細(xì)定量的要求(如定量PCR檢測中Ct值大于33的情況下,其重復(fù)性就不是很高),而微滴式數(shù)字PCR系統(tǒng)通過**的微滴化處理,使得稀有的核酸序列從大量的背景DNA中分離出來,從而提高了檢測的靈敏度及重復(fù)性。此外,由于樣品微滴化處理的同時,也將樣品中可能存在的***劑進(jìn)行了分裝,提高了數(shù)字PCR擴(kuò)增對于***劑的耐受程度,因此可具體應(yīng)用于很多臨床樣品(血液、尿液、糞便、痰液、腦脊液等)中對**核酸標(biāo)記物的檢測。一般而言,毛細(xì)管電泳和定量PCR的檢測靈敏度約在10%;NGS的靈敏度可達(dá)到1%;而ddPCR的檢測下限為0.001%。檢測數(shù)量一次可達(dá)96個樣品。
精細(xì)診斷是精細(xì)醫(yī)學(xué)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),液體活檢作為一種無創(chuàng)、均一的檢測技術(shù),迅速成為精細(xì)診斷領(lǐng)域的新星,2015年被《麻省理工大學(xué)科技評論》評選為年度**突破技術(shù),2017年入選世界經(jīng)濟(jì)論壇評出的全球**新興技術(shù),引發(fā)了全球科研、臨床和產(chǎn)業(yè)界的極大熱情,已在**、產(chǎn)前診斷、***移植等疾病領(lǐng)域***被應(yīng)用。數(shù)字PCR技術(shù)與高通量的二代測序技術(shù),共同組成液體活檢領(lǐng)域的兩大利器;數(shù)字PCR技術(shù)是公認(rèn)的液體活檢領(lǐng)域靈敏度比較高的檢測方法,采用有限稀釋的方法將目標(biāo)分子分割到**的反應(yīng)體系中,在不依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線條件下實現(xiàn)靶標(biāo)***定量檢測,能檢測低至0.01%的突變基因;Bio-Rad及ThermoFisher目前是這一領(lǐng)域的主導(dǎo)者,分別采用微滴或芯片方式將樣本分割成兩萬份,MiniDrop?創(chuàng)新性采用高壓驅(qū)動的方法將樣本分割成50萬份,打破了國外廠商在微滴式數(shù)字PCR領(lǐng)域的壟斷。支持多重數(shù)字PCR,可選全中文分析軟件。上海安全數(shù)字PCR銷售
超高靈敏度,適用于稀有序列及稀有突變的檢測。上海安全數(shù)字PCR銷售
無創(chuàng)產(chǎn)前檢查鐮狀細(xì)胞貧血(sicklecellanemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴(yán)重的危害,可以導(dǎo)致高達(dá)5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率 。而精細(xì)有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預(yù)防鐮狀細(xì)胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測孕婦胎兒游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當(dāng)cff-DNA濃度大于7%時,可以**的檢測出HBB基因突變[3],可以說是相當(dāng)厲害了。上海安全數(shù)字PCR銷售
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