dPCR的基本原理目前dPCR主要有兩種形式,芯片式和液滴式,但基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或微滴中,每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于或者等于1個(gè)。這樣經(jīng)過(guò)PCR循環(huán)之后,有一個(gè)核酸分子模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào),沒(méi)有模板的反應(yīng)器就沒(méi)有熒光信號(hào)。根據(jù)相對(duì)比例和反應(yīng)器的體積,就可以推算出原始溶液的核酸濃度??梢允褂脦追N不同的方法來(lái)分配樣品,包括微孔板,毛細(xì)管,油乳劑和帶有核酸結(jié)合表面的小型化腔室陣列。樣品的分配使人們可以通過(guò)假設(shè)分子種群遵循泊松分布來(lái)估計(jì)不同分子的數(shù)量,根據(jù)泊松分布的原理,反應(yīng)體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)可以通過(guò)公式A=-ln[(N-X)/N]*N計(jì)算,從而解決了多個(gè)目標(biāo)分子存在于單個(gè)液滴中的可能性。線性范圍達(dá)到6個(gè)數(shù)量級(jí),靈敏度高達(dá)萬(wàn)分之一。MicroDrop-100數(shù)字PCR正規(guī)代理
數(shù)字PCR也叫DigitalPCR(dPCR),是近幾年發(fā)展起來(lái)的一種核酸定量分析技術(shù)。相較于傳統(tǒng)熒光定量PCR來(lái)說(shuō),數(shù)字PCR對(duì)結(jié)果的判定不依賴于擴(kuò)增曲線循環(huán)Ct值,不受擴(kuò)增效率的影響,能夠直接讀出DNA的分子個(gè)數(shù),能夠?qū)ζ鹗紭颖竞怂岱肿?**定量。數(shù)字PCR基本原理是將一個(gè)樣本分成幾十到幾萬(wàn)份,然后再將其分配到不同的反應(yīng)單元中,使每個(gè)微滴單元包含一個(gè)或多個(gè)拷貝的核酸分子(即DNA模板),每個(gè)單元都會(huì)對(duì)目標(biāo)分子進(jìn)行擴(kuò)增,然后再對(duì)每個(gè)單元進(jìn)行熒光信號(hào)的統(tǒng)計(jì)并計(jì)算。相對(duì)而言,傳統(tǒng)PCR或qPCR反應(yīng)都是發(fā)生于同一體系當(dāng)中,這也是數(shù)字PCR與其比較大的區(qū)別。 杭州廣州永諾數(shù)字PCR正規(guī)代理液體活檢:早篩、用藥、監(jiān)測(cè)、復(fù)發(fā)。
數(shù)字PCR檢測(cè)及分析原理在上世紀(jì)90年代就被提出來(lái)了,但是無(wú)奈受限于當(dāng)時(shí)的技術(shù)條件,樣本稀釋及分配都是靠手工來(lái)完成的,受到很多因素的干擾和限制;并且結(jié)果分析對(duì)于研究者來(lái)說(shuō)也十分枯燥與繁瑣,因此在很長(zhǎng)一段時(shí)間dPCR發(fā)展停滯不前。后來(lái)由于微流控技術(shù)與微納集成制造工藝的發(fā)展解決了dPCR過(guò)程中的幾個(gè)關(guān)鍵技術(shù)問(wèn)題,推動(dòng)了dPCR的研究與商業(yè)化的發(fā)展。目前根據(jù)dPCR樣本稀釋分配的方式,基本可分為三大類,一種是基于大規(guī)模集成微流控芯片;第二種是使用微反應(yīng)室/孔板;第三種是微滴式。但不論是走芯片式還是微滴式,其基本原理都是將大量稀釋后的核酸溶液分散至芯片的微反應(yīng)器或者微滴當(dāng)中,每個(gè)反應(yīng)器的核酸模板數(shù)少于1或者等于1。經(jīng)過(guò)PCR擴(kuò)增之后,有一個(gè)核酸分子的模板的反應(yīng)器就會(huì)給出熒光信號(hào),沒(méi)有模板的反應(yīng)器沒(méi)有熒光信號(hào)。根據(jù)相對(duì)比例和反應(yīng)器的體積,可以推算出原始溶液的核酸濃度。
數(shù)字PCR(dPCR)是近年來(lái)引起重視并迅速發(fā)展起來(lái)的一種突破性的核酸定量分析技術(shù)。該技術(shù)先將核酸模板進(jìn)行稀釋,分配到大量 的反應(yīng)單元中,使每個(gè)反應(yīng)單元中只有單個(gè)模板分子,然后進(jìn)行PCR擴(kuò)增反應(yīng),擴(kuò)增結(jié)束后對(duì)每個(gè)反應(yīng)室的熒光信號(hào)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,來(lái)定量DNA拷貝數(shù)。數(shù)字PCR采用先擴(kuò)增后定量,因此不依賴擴(kuò)增曲線的循環(huán)閾值(Ct),也無(wú)需采用內(nèi)參基因和標(biāo)準(zhǔn)曲線,準(zhǔn)確度高、重現(xiàn)性好,可以實(shí)現(xiàn)***定量分析。由于其獨(dú)特的技術(shù)優(yōu)勢(shì),已經(jīng)在臨床診斷、轉(zhuǎn)基因成分定量、單細(xì)胞基因表達(dá)分析、環(huán)境微生物檢測(cè)和下一代測(cè)序等研究領(lǐng)域顯示出巨大的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用前景。不依賴Ct值,無(wú)需標(biāo)準(zhǔn)曲線。
研究方向病原微生物的檢測(cè)(***、細(xì)菌等)疾病預(yù)防控制中心、出入境檢驗(yàn)檢疫局系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室目前主要采用基于TaqMan探針?lè)ǖ亩縋CR體系對(duì)病原微生物進(jìn)行核酸水平的檢測(cè),而這些目前正在使用著的檢測(cè)體系可以無(wú)縫地轉(zhuǎn)移到QX200上,從而滿足該類實(shí)驗(yàn)室對(duì)于檢測(cè)結(jié)果的要求:靈敏度更高、重復(fù)性更好、無(wú)需依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線的***定量結(jié)果,同時(shí)操作簡(jiǎn)便。對(duì)于其他類型的研究實(shí)驗(yàn)室,也可以利用ddPCR靈敏度高的特點(diǎn),對(duì)各種樣品中的病原微生物展開***的研究。如HIV抗逆轉(zhuǎn)錄***治療過(guò)程中***殘留量的監(jiān)控;HBV耐藥突變的檢測(cè);HCV的分子分型;抗甲氧西林金黃色葡萄球菌的院內(nèi)***監(jiān)控;環(huán)境微生物不同功能基因之間的連鎖分析等等。雙通道熒光檢測(cè),支持EvaGreen染料及探針?lè)āicroDrop-100數(shù)字PCR
MicroDrop?數(shù)字PCR平臺(tái)是由永諾生物自主研發(fā)并已投入生產(chǎn)的微滴式數(shù)字PCR檢測(cè)系統(tǒng)。MicroDrop-100數(shù)字PCR正規(guī)代理
目前數(shù)字PCR技術(shù)在臨床領(lǐng)域已經(jīng)有著非常***且***地應(yīng)用,例如在病原微生物檢測(cè)中的應(yīng)用:HBV檢測(cè)、HIV檢測(cè)、甲型流感病毒檢測(cè)等;在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用:13/18/21號(hào)染色體三倍體檢測(cè)、遺傳性耳聾檢測(cè)、地中海貧血檢測(cè)及優(yōu)生五項(xiàng)的病毒檢測(cè)等;在**靶向***相關(guān)基因檢測(cè)中的應(yīng)用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測(cè)、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測(cè)、乳腺*HER2基因 擴(kuò)增檢測(cè)、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測(cè)等。以**靶向***相關(guān)基因檢測(cè)為例,在**形成的超早期,會(huì)出現(xiàn)**細(xì)胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細(xì)胞會(huì)釋放其DNA進(jìn)入外周血,因此通過(guò)分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達(dá)到**早期篩查的目的。然而此時(shí)DNA含量極低,對(duì)檢測(cè)的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術(shù)可以檢測(cè)出來(lái)。另外進(jìn)行個(gè)體化***時(shí),需要對(duì)基因組樣本進(jìn)行分析,此時(shí)利用數(shù)字PCR技術(shù)也能**提高結(jié)果的可信性,進(jìn)而建立合理***方案。MicroDrop-100數(shù)字PCR正規(guī)代理
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