數(shù)字PCR(DigtalPCR)是一種核酸定量精密檢測(cè)的新興技術(shù)手段,于20世紀(jì)由Vogelstein等提出。它是將稀釋后的核酸模板分配到大量不同的反應(yīng)單元中,使每個(gè)反應(yīng)單元中有一個(gè)或沒有核酸。利用PCR擴(kuò)增的同時(shí),加入可檢測(cè)熒光。待擴(kuò)增結(jié)束時(shí),使用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法采集每個(gè)反應(yīng)單元出現(xiàn)的熒光次數(shù),從而定量檢測(cè)樣本中的核酸濃度?;诜忠悍绞降牟煌?,數(shù)字PCR主要分為3種:微流體數(shù)字PCR(MicrofluidicdigitalPCR,mdPCR)、微滴數(shù)字PCR(DropletdigitalPCR,ddPCR)和芯片數(shù)字PCR(ChipdigitalPCR,cdPCR)。數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司。青海實(shí)驗(yàn)室數(shù)字PCR維修
要了解為什么傳統(tǒng)PCR存在限制,務(wù)必要了解PCR反應(yīng)過程中發(fā)生了什么?;綪CR運(yùn)行可以分為三個(gè)階段:指數(shù)期每個(gè)循環(huán)積聚的產(chǎn)物準(zhǔn)確加倍(假定**反應(yīng)效率)。該反應(yīng)具有高度特異性和精確度。出現(xiàn)指數(shù)式擴(kuò)增,因?yàn)樗性噭┚迈r可用,反應(yīng)的動(dòng)力學(xué)推動(dòng)反應(yīng)有利于擴(kuò)增子加倍。線性期(高變異性)隨著反應(yīng)繼續(xù),一些試劑因擴(kuò)增而被消耗。反應(yīng)開始減緩,并且每個(gè)循環(huán)的PCR產(chǎn)物不再加倍。平臺(tái)期(終點(diǎn):使用傳統(tǒng)方法進(jìn)行凝膠檢測(cè))反應(yīng)停止,不再產(chǎn)生更多產(chǎn)物,并且如果放置時(shí)間夠長(zhǎng),PCR產(chǎn)物將開始降解。因?yàn)槊總€(gè)樣品具有不同的反應(yīng)動(dòng)力學(xué),所以每支試管或每個(gè)反應(yīng)將在不同的時(shí)間點(diǎn)進(jìn)入平臺(tái)期。在平臺(tái)期可以看到這些差異。在平臺(tái)期內(nèi),傳統(tǒng)PCR進(jìn)行測(cè)量,又稱為終點(diǎn)檢測(cè)。貴州噪音小數(shù)字PCR商家數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司,用戶的信賴之選,有想法可以來我司咨詢!
與常規(guī)的PCR的方法相比,dPCR有很好的優(yōu)勢(shì)。***定量常規(guī)PCR和實(shí)時(shí)熒光PCR定量檢測(cè)都需要已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA制定標(biāo)準(zhǔn)曲線,由于樣品測(cè)定在各種條件上不會(huì)完全一致,會(huì)造成PCR擴(kuò)增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而ddPCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)影響,可以進(jìn)行***定量。樣品需求量低在檢測(cè)珍貴樣品和樣品核酸存在降解時(shí)具有明顯的優(yōu)勢(shì)。高靈敏度ddPCR本質(zhì)上是 將一個(gè)傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)分成了數(shù)萬個(gè) 的PCR反應(yīng),在這些反應(yīng)中可以精確地檢測(cè)到很小的目的片段的差異、單拷貝甚至是低濃度混雜樣品,且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。高耐受性由于目的序列被分配到多個(gè)微滴中,***降低了體系間的影響以及背景序列和***物對(duì)反應(yīng)的干擾,擴(kuò)增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。
與常規(guī)PCR方法相比,數(shù)字PCR有如下優(yōu)勢(shì):1、能夠完全定量:常規(guī)PCR定量需要制定已知拷貝數(shù)的標(biāo)準(zhǔn)DNA曲線,但是由于待檢樣本與標(biāo)準(zhǔn)曲線不在統(tǒng)一體系,條件上會(huì)存在差異,另外加上PCR擴(kuò)增效率的差異從而影響定量結(jié)果的準(zhǔn)確性。而數(shù)字PCR不受標(biāo)準(zhǔn)曲線和擴(kuò)增動(dòng)力學(xué)影響,可進(jìn)行完全定量。2、樣本需求量低:適用于珍貴樣本或核酸降解嚴(yán)重的樣本3、靈敏度高:數(shù)字PCR是將傳統(tǒng)PCR反應(yīng)體系分割成數(shù)萬個(gè) PCR反應(yīng),這些反應(yīng)可以精確地檢測(cè)很小的目的片段差異、單拷貝甚至低濃度的混雜樣本。且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。4、高耐受性:由于目的序列被分配到多個(gè) 反應(yīng)體系中,明顯降低了背景信號(hào)和yìzhì物對(duì)反應(yīng)的干擾,擴(kuò)增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司,用戶的信賴之選,有想法的不要錯(cuò)過哦!
在定量PCR時(shí),我們常常糾結(jié)一個(gè)問題,究竟是相對(duì)定量還是***定量呢?如今,你無需糾結(jié)了,因?yàn)閿?shù)字PCR(digitalPCR)來了。盡管這兩種技術(shù)有些類似,都是估計(jì)起始樣品中的核酸量,但它們有一個(gè)重要的區(qū)別。定量PCR是依靠標(biāo)準(zhǔn)曲線或參照基因來測(cè)定核酸量,而數(shù)字PCR則讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的***定量。因此特別適用于依靠Ct值不能很好分辨的應(yīng)用領(lǐng)域:拷貝數(shù)變異、突變檢測(cè)、基因相對(duì)表達(dá)研究(如等位基因不平衡表達(dá))、二代測(cè)序結(jié)果驗(yàn)證、miRNA表達(dá)分析、單細(xì)胞基因表達(dá)分析等??:?上海)儀器科技有限公司是一家專業(yè)提供數(shù)字PCR 的公司,歡迎您的來電哦!西藏分析數(shù)字PCR代理商
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同時(shí),從公式也可以看出,隨著反應(yīng)陽(yáng)性體系數(shù)(X)的增加,體系中目標(biāo)分子的拷貝數(shù)相對(duì)于X會(huì)有較大的差距,隨著X的持續(xù)增加,數(shù)字PCR結(jié)果的不確定度也隨著提高,總體來說,數(shù)字PCR陽(yáng)性體系的數(shù)量不得超過總體系數(shù)量的80%。另一個(gè)方面,N的增加會(huì)使整個(gè)數(shù)字PCR體系具有較大的線性范圍,并可以提高反應(yīng)的靈敏度、穩(wěn)定性以及可重復(fù)性。因此,目前dPCR都需要在成本可控的情況下,增加分配的腔室數(shù)和液滴數(shù)。商業(yè)化dPCR平臺(tái)及其特點(diǎn)發(fā)展到現(xiàn)在,市面上常見的dPCR主要有兩種:微滴式dPCR(dropletdPCR,ddPCR)和芯片式dPCR(chipdPCR,cdPCR)技術(shù)。由于芯片式dPCR制造芯片的成本較高,目前微滴式dPCR正越來越受到企業(yè)的認(rèn)可。青海實(shí)驗(yàn)室數(shù)字PCR維修