數(shù)字PCR采用的策略概括起來非常簡單,就是“分而治之”(divideandconquer)[1],這種做法非常類似于計算機科學(xué)中的“分治算法”,將一個標準PCR反應(yīng)分配到大量微小的反應(yīng)器中,在每個反應(yīng)器中包含或不包含一個或多個拷貝的目標分子(DNA模板),實現(xiàn)“單分子模板PCR擴增”,擴增結(jié)束后,通過陽性反應(yīng)器的數(shù)目“數(shù)出”目標序列的拷貝數(shù)。在實際的數(shù)字PCR實驗中,事實上是通過呈現(xiàn)兩種信號類型的反應(yīng)器比例和數(shù)目進行統(tǒng)計學(xué)分析,計算出原始樣本中的模板拷貝數(shù)。數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司,用戶的信賴之選,有需要可以聯(lián)系我司哦!永諾數(shù)字PCR原理
無創(chuàng)產(chǎn)前檢查鐮狀細胞貧血(sicklecellanemia)是HBB基因突變引起的常染色體顯性遺傳病,有嚴重的危害,可以導(dǎo)致高達5%的胎兒死亡率及4.62%的孕婦死亡率 。而精細有效的無創(chuàng)產(chǎn)前診斷是預(yù)防鐮狀細胞貧血患兒出生的有效方法。研究人員采用dPCR技術(shù)檢測孕婦胎兒游離DNA(cff-DNA)HBB基因突變。結(jié)果顯示,dPCR技術(shù)能夠確定87%的男性胎兒(n=45)和75%的女性胎兒(n=20)HBB基因的突變狀態(tài)。當cff-DNA濃度大于7%時,可以**的檢測出HBB基因突變[3],可以說是相當厲害了。廣州國產(chǎn)數(shù)字PCR正規(guī)代理浚和(上海)儀器科技有限公司是一家專業(yè)提供數(shù)字PCR 的公司。
同時,從公式也可以看出,隨著反應(yīng)陽性體系數(shù)(X)的增加,體系中目標分子的拷貝數(shù)相對于X會有較大的差距,隨著X的持續(xù)增加,數(shù)字PCR結(jié)果的不確定度也隨著提高,總體來說,數(shù)字PCR陽性體系的數(shù)量不得超過總體系數(shù)量的80%。另一個方面,N的增加會使整個數(shù)字PCR體系具有較大的線性范圍,并可以提高反應(yīng)的靈敏度、穩(wěn)定性以及可重復(fù)性。因此,目前dPCR都需要在成本可控的情況下,增加分配的腔室數(shù)和液滴數(shù)。商業(yè)化dPCR平臺及其特點發(fā)展到現(xiàn)在,市面上常見的dPCR主要有兩種:微滴式dPCR(dropletdPCR,ddPCR)和芯片式dPCR(chipdPCR,cdPCR)技術(shù)。由于芯片式dPCR制造芯片的成本較高,目前微滴式dPCR正越來越受到企業(yè)的認可。
二代測序輔助建庫目前靶向測序建庫方法包括擴增子方法,在均相溶液中,當擴增引物增加時,由于擴增引物之間的相互作用,從而影響擴增的效率;如果將其分散到大量微液滴中擴增,將可降低引物間相互作用,提高擴增效率。同時還可以實現(xiàn)對于少量模板的有效擴增,得到更多的有效測序數(shù)據(jù)。CRISPR-Cas9基因編輯結(jié)果驗證CRISPR-Cas9技術(shù)的發(fā)明,是基因編輯技術(shù)的一大突破,但如何驗證實驗是否成功,仍需要高靈敏度的檢測方法,數(shù)字PCR技術(shù)可以滿足這一需求。Broad研究所張鋒團隊發(fā)明了以CRISPR為基礎(chǔ)的SHERLOCK技術(shù)可以對核酸進行高靈敏度的定性檢測,但精確定量評估時仍采取了數(shù)字PCR進行確認。數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司,用戶的信賴之選,歡迎您的來電哦!
與常規(guī)的PCR的方法相比,dPCR有很好的優(yōu)勢。***定量常規(guī)PCR和實時熒光PCR定量檢測都需要已知拷貝數(shù)的標準DNA制定標準曲線,由于樣品測定在各種條件上不會完全一致,會造成PCR擴增效率的差異,從而影響定量結(jié)果的準確性。而ddPCR不受標準曲線和擴增動力學(xué)影響,可以進行***定量。樣品需求量低在檢測珍貴樣品和樣品核酸存在降解時具有明顯的優(yōu)勢。高靈敏度ddPCR本質(zhì)上是 將一個傳統(tǒng)的PCR反應(yīng)分成了數(shù)萬個 的PCR反應(yīng),在這些反應(yīng)中可以精確地檢測到很小的目的片段的差異、單拷貝甚至是低濃度混雜樣品,且能避免非同源異質(zhì)雙鏈的形成。高耐受性由于目的序列被分配到多個微滴中,***降低了體系間的影響以及背景序列和***物對反應(yīng)的干擾,擴增基質(zhì)效應(yīng)大大減小。數(shù)字PCR ,就選浚和(上海)儀器科技有限公司,用戶的信賴之選。上海數(shù)字PCR
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目前數(shù)字PCR技術(shù)在臨床領(lǐng)域已經(jīng)有著非常***且***地應(yīng)用,例如在病原微生物檢測中的應(yīng)用:HBV檢測、HIV檢測、甲型流感病毒檢測等;在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用:13/18/21號染色體三倍體檢測、遺傳性耳聾檢測、地中海貧血檢測及優(yōu)生五項的病毒檢測等;在**靶向***相關(guān)基因檢 測中的應(yīng)用:肺*EGFR基因突變、ALK基因融合檢測、結(jié)直腸*KRAS、BRAF基因突變檢測、乳腺*HER2基因擴增檢測、神經(jīng)膠質(zhì)瘤IDH基因突變檢測等。以**靶向***相關(guān)基因檢測為例,在**形成的超早期,會出現(xiàn)**細胞的壞死和凋亡,這些凋亡或壞死的**細胞會釋放其DNA進入外周血,因此通過分析循環(huán)血液中是否含有**特異的游離DNA就可以達到**早期篩查的目的。然而此時DNA含量極低,對檢測的靈敏度和精確性要求極高,目前只有數(shù)字PCR技術(shù)可以檢測出來。另外進行個體化***時,需要對基因組樣本進行分析,此時利用數(shù)字PCR技術(shù)也能**提高結(jié)果的可信性,進而建立合理***方案。永諾數(shù)字PCR原理