經(jīng)典Trizol法并不能獲得總RNA:這個(gè)事實(shí)可能會(huì)刷不少新手甚至老手的三觀,但確有實(shí)驗(yàn)支持:經(jīng)典Trizol法會(huì)選擇性丟失低GC比的miRNA。這一點(diǎn),源自一則作者自撤稿的故事。V.NarryKim是韓國(guó)鼎鼎大名的美女科學(xué)家,專做RNA相關(guān)的研究,包括miRNA。幾年前她們組發(fā)現(xiàn)一個(gè)奇怪的“現(xiàn)象”,即貼壁細(xì)胞在消化之后,會(huì)有一些miRNA的豐度突然降低,看起來(lái)好像是被快速“降解”掉了,并據(jù)此寫了一篇文章發(fā)到MolecularCell上。但很快她們就發(fā)現(xiàn),這個(gè)“現(xiàn)象”難以重復(fù):如果用Trizol做實(shí)驗(yàn),就一定是陽(yáng)性結(jié)果,而用試劑盒提RNA,就重復(fù)不出來(lái)。難道是號(hào)稱能提總RNA的Trizol方案出了問題?確實(shí)如此。經(jīng)進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),經(jīng)典的Trizol方案會(huì)使得低GC比的miRNA丟失。用于各種植物、動(dòng)物、微生物的RNA提取,在每個(gè)試劑盒里都有一份說(shuō)明使用說(shuō)明書。深圳RNA提取試劑服務(wù)電話
RNA組成結(jié)構(gòu):RNA和DNA一樣,也是由各種核苷酸通過(guò)3′,5′-磷酸二酯鍵連接構(gòu)成的多核苷酸鏈,但與DNA有一系列差異。1.在化學(xué)組成方面,RNA含核糖而不含脫氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每個(gè)tNA分子含有一個(gè)胸腺嘧啶,這是在RNA鏈合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少數(shù)DNA含有少量核糖,但這些個(gè)別的例外并不能以此否定兩類核酸組成上的差異。2.RNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的概念雖與DNA相同.但其基本結(jié)構(gòu)單位是核糖核苷酸而不是脫氧核糖核苷酸。此外,部分RNA5′端或3′端有特殊的核苷酸序列,而且RNA一級(jí)結(jié)構(gòu)中沒有DNA那樣復(fù)雜的順序組織。3.絕大多數(shù)RNA為單鏈分子,單鏈可自身折迭形成發(fā)夾(hairpin)樣結(jié)構(gòu)而有局部雙螺旋結(jié)構(gòu)的特征,這是各種RAN空間結(jié)構(gòu)的共同特征。RNA局部雙螺旋結(jié)構(gòu)中堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律是A對(duì)U和G對(duì)C。由于RNA分子內(nèi)部不能較全形成堿基配對(duì),故其堿基克分子比A不等于U,G不等于C,不存在DNA堿基比例的Chargaff規(guī)律。無(wú)錫深圳RNA提取試劑純的RNA用RE緩沖液洗脫,不用酚提取或醇沉淀。
RNA試劑盒:用于各種植物、動(dòng)物、微生物的RNA提取,在每個(gè)試劑盒里都有一份說(shuō)明使用說(shuō)明書。實(shí)驗(yàn)者只需要按照說(shuō)明書上的步驟操作即可。使用時(shí)無(wú)需配制其它試劑,非常方便,適合于RNA的快速提取。所提取的RNA完整性好、純度高,可用于分子生物學(xué)后實(shí)驗(yàn)。但較好的試劑盒價(jià)格比較貴,在實(shí)驗(yàn)室可以根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需要來(lái)定奪試劑盒的使用。注意事項(xiàng)所有相關(guān)器皿耗材都應(yīng)為RNase-free產(chǎn)品,操作過(guò)程要小心,帶口罩、手套避免環(huán)境中RNA酶污染樣品。RNA在水溶液中OD值可能在1.5-1.9之間,但這并不表示RNA不純,需電泳檢測(cè)。
RNA可分為:mRNA:在蛋白分子合成過(guò)程中,作為“信使”分子,將基因組DNA的遺傳信息(即堿基排列順序)傳遞至核糖體,使核糖體能夠以其堿基排列順序摻入互補(bǔ)配對(duì)的tRNA分子,進(jìn)而合成正確的肽鏈,實(shí)現(xiàn)遺傳信息向蛋白質(zhì)分子的轉(zhuǎn)化。tRNA:把氨基酸搬運(yùn)到核糖體上,tRNA能根據(jù)mRNA的遺傳密碼,依次準(zhǔn)確地將它攜帶的氨基酸,摻入正在合成的肽鏈中,實(shí)現(xiàn)肽鏈的延伸。與正在進(jìn)行翻譯的mRNA結(jié)合,而后rRNA將各個(gè)氨基酸殘基通過(guò)肽鍵連接成肽鏈進(jìn)而構(gòu)成蛋白質(zhì)分子。rRNA:一般與核糖體蛋白質(zhì)結(jié)合在一起,形成核糖體。總共可以使用該試劑盒進(jìn)行50次標(biāo)準(zhǔn)提取。
RNA的提取:眾所周知,Trizol是一種RNA提取試劑,內(nèi)含異硫氰酸胍和酚等物質(zhì),能迅速破碎細(xì)胞和溶解細(xì)胞中的其他成分,壓制細(xì)胞釋放出核酸酶,維持細(xì)胞中RNA的穩(wěn)定性,我們可以在反應(yīng)物中加入Trizol后搖勻,在加入氯仿離心,這樣的話我們的RNA就進(jìn)入了水相中,再用異丙醇沉淀水相中的RNA,即可達(dá)到提取總RNA的目的了。首先我們需要稱取一定量的預(yù)處理好的廢酵母配10%左右的酵母溶液,在一定溫度下,加入一定濃度的氯化鈉,之后加入NaOH溶液調(diào)節(jié)反應(yīng)的pH,攪拌抽提一定時(shí)間后,離心分離上清液,調(diào)節(jié)pH至等電點(diǎn),經(jīng)酒精沉淀獲得核糖核酸,用水定容至100mL取1m適當(dāng)稀釋,調(diào)pH7.0,這樣的話RNA就出現(xiàn)了,分別測(cè)定吸光值A(chǔ)260和A280并計(jì)算A260/A280,就可以測(cè)定RNA的提取率了。當(dāng)然啦,我們還可以進(jìn)行深入研究,如測(cè)定Nacl的濃度,PH的大小,以及抽提時(shí)間對(duì)RNA提取率的影響啦。為了使這種酶對(duì)降解的影響較小化,較好在采集時(shí)就穩(wěn)定好樣本中的 RNA。深圳RNA提取試劑服務(wù)電話
RNA提取試劑注意事項(xiàng):有機(jī)相用異丙醇沉淀可回收蛋白。深圳RNA提取試劑服務(wù)電話
總RNA快速提取試劑盒背景資料;EpiQuik?總RNA分離快速試劑盒為從哺乳動(dòng)物細(xì)胞和組織中分離總RNA提供了一種快速、簡(jiǎn)單和經(jīng)濟(jì)有效的方法。洗滌劑用于溶解細(xì)胞和滅活核糖核酸酶。特殊的高鹽緩沖系統(tǒng)允許蛋白質(zhì)/DNA被去除,RNA結(jié)合到自旋柱的玻璃纖維基質(zhì)上,同時(shí)污染物通過(guò)柱。雜質(zhì)被有效地沖洗掉,純凈的RNA被洗脫。該試劑盒純化的RNA適用于多種常規(guī)應(yīng)用,包括RT-PCR、cDNA合成、northernblotting、差異顯示、引物延伸和mRNA選擇??俁NA快速提取試劑盒描述:本試劑盒包含了直接從培養(yǎng)細(xì)胞或組織中成功分離RNA所需的所有試劑。經(jīng)過(guò)裂解、結(jié)合和洗滌后,使用特殊設(shè)計(jì)的柱可以很容易地回收高達(dá)10個(gè)氧化格的RNA。然后,總RNA準(zhǔn)備用于各種下游應(yīng)用。深圳RNA提取試劑服務(wù)電話
總RNA提取試劑試劑能促進(jìn)不同種屬不同分子量大小的多種RNA的析出。例如,從大鼠肝臟抽提的RNA瓊脂糖凝膠電泳并用溴化乙啶染色,可見許多介于7kb和15kb之間不連續(xù)的高分子量條帶(mRNA和hnRNA成分),兩條優(yōu)勢(shì)核糖體~5kb(28S)和~2kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之間(tRNA,5S)。當(dāng)抽提的RNA用TE稀釋時(shí)其A260/A280比值≥1.8。注意如果是普通瓊脂糖凝膠電泳,28S的位置大約在2kb,18S大約在1kb的位置,不同濃度的凝膠位置變化較大。注意事項(xiàng):樣品用總RNA提取試劑勻漿后,如果不即刻加入氯仿之前,置于-70°C下可放置一個(gè)月以上。保存在7...