常用總RNA提取試劑:異硫氰酸胍法和Trizol法是動(dòng)物組織及動(dòng)物細(xì)胞總RNA提取較常用的方法,異硫氰酸胍法操作簡(jiǎn)單快捷,適用于樣本足夠大的常規(guī)動(dòng)物組織;Trizol法裂解能力較強(qiáng),尤其適合小樣本及特別難提取的組織,如兔子皮膚,動(dòng)物結(jié)締組織等總RNA的提?。涣硗釺rizol作為一種通用型的裂解試劑,還可以用于植物組織、細(xì)菌、菌類等組織的提取。對(duì)于含多糖多酚的植物組織如油茶、茶葉、油菜等還可以使用CTAB法進(jìn)行總RNA的提取。提取RNA時(shí)我們經(jīng)常遇到的問題是:(1)RNA產(chǎn)量較低;(2)RNA有嚴(yán)重的鹽類污染;(3)RNA有嚴(yán)重的有機(jī)溶劑污染;(4)樣品降解等問題。普通的提取實(shí)驗(yàn)用國產(chǎn)的試劑盒就足以,價(jià)格不高,基本上各地均有現(xiàn)貨。溫州正規(guī)RNA提取試劑廠家推薦
昆蟲RNA柱式提取試劑盒使用方法:RNA完整性的電泳檢測(cè):如果需要做Northern雜交,強(qiáng)烈建議用戶使用甲醛變性膠進(jìn)行RNA電泳,因?yàn)榉亲冃阅z不能分離所有的RNA分子。注意:大部分昆蟲的28SRNA被切割成兩個(gè)小的片段,彼此用氫鍵相連,所以在甲醛變性膠中,沒有28S帶出現(xiàn)。RNA產(chǎn)量產(chǎn)率測(cè)定:將5~10μLRNA溶于TE緩沖液中(pH7.5~8.2之間)檢測(cè)其在OD260的光吸收。通過光吸收可以得出RNA濃度(1OD260的RNA=40μg/mL),進(jìn)而計(jì)算出RNA的產(chǎn)量(濃度X體積)和產(chǎn)率(RNA產(chǎn)量/組織用量)。RNA純度測(cè)定:無污染的總RNA的OD260/OD280一般在1.8~2.1之間(具體數(shù)值與其堿基組成和溶液成分等多種因素有關(guān)),高于此范圍則分別表示樣品可能有蛋白質(zhì)污染,但一般不影響RT-PCR等反應(yīng)。溫州正規(guī)RNA提取試劑廠家推薦RNA提取試劑:能夠作RNA印跡分析、斑點(diǎn)雜交、poly(A)+選擇。
RNA提取試劑的選擇:對(duì)于富含多糖多酚的植物類組織提取是個(gè)難點(diǎn),Takara精心研發(fā)的柱型提取試劑TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以輕松解決這個(gè)問題。TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以高效地從各種簡(jiǎn)單的植物組織材料(葉片、莖、幼苗等)、富含多糖多酚的植物組織材料(果實(shí)、種子等)、菌類提取高純度的TotalRNA,適用范圍普遍。按照標(biāo)準(zhǔn)流程,本試劑盒可以有效地提取分子量大于200nt的RNA,也可以按照可選步驟提取得到包含SmallRNA(<200nt)的TotalRNA。試劑盒中包含了RNA提取所需的全部試劑,無需額外購買其它試劑。
piRNA。是一類長(zhǎng)度約為24-31nt的非編碼小RNA,通過特異性地與PIWI蛋白結(jié)合而發(fā)揮生物學(xué)作用?,F(xiàn)已發(fā)現(xiàn)其在生殖干細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育、維持基因組完整性、表達(dá)遺傳學(xué)調(diào)控、異染色質(zhì)的形成和物種的性別決定等方面起著重要作用,此外在壓制轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)錄和基因轉(zhuǎn)錄后調(diào)控中也扮演著重要角色,并且越來越多的研究表明在病癥組織中piRNA的表達(dá)不盡相同。lncRNA。長(zhǎng)度約為200-100000個(gè)核苷酸,可以通過不同的分子生物學(xué)機(jī)制調(diào)控編碼基因的表達(dá),參與疾病相關(guān)的信號(hào)通路,對(duì)疾病的發(fā)生、發(fā)展及醫(yī)治有重要作用。研究發(fā)現(xiàn),lncRNA-DANCR明顯增強(qiáng)肝病細(xì)胞的感性特征,促進(jìn)一些疾病細(xì)胞的形成,在體內(nèi)干擾DANCR的作用可導(dǎo)致一些疾病細(xì)胞活力降低,同時(shí)阻止一些miRNA的壓制效應(yīng),揭發(fā)出一個(gè)涉及l(fā)ncRNA、mRNA和miRNA的新一些疾病形成機(jī)制??梢?,lncRNA對(duì)一些疾病方面有重要作用。另外有研究發(fā)現(xiàn)lncRNA在宿主抗病菌反應(yīng)、骨關(guān)節(jié)炎、囊性纖維化、藥物研發(fā)等方面也有重要的臨床應(yīng)用價(jià)值。RNA存在于水相中。水相轉(zhuǎn)移后,RNA通過異丙醇沉淀回收。
經(jīng)典Trizol法并不能獲得總RNA:這個(gè)事實(shí)可能會(huì)刷不少新手甚至老手的三觀,但確有實(shí)驗(yàn)支持:經(jīng)典Trizol法會(huì)選擇性丟失低GC比的miRNA。這一點(diǎn),源自一則作者自撤稿的故事。V.NarryKim是韓國鼎鼎大名的美女科學(xué)家,專做RNA相關(guān)的研究,包括miRNA。幾年前她們組發(fā)現(xiàn)一個(gè)奇怪的“現(xiàn)象”,即貼壁細(xì)胞在消化之后,會(huì)有一些miRNA的豐度突然降低,看起來好像是被快速“降解”掉了,并據(jù)此寫了一篇文章發(fā)到MolecularCell上。但很快她們就發(fā)現(xiàn),這個(gè)“現(xiàn)象”難以重復(fù):如果用Trizol做實(shí)驗(yàn),就一定是陽性結(jié)果,而用試劑盒提RNA,就重復(fù)不出來。難道是號(hào)稱能提總RNA的Trizol方案出了問題?確實(shí)如此。經(jīng)進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),經(jīng)典的Trizol方案會(huì)使得低GC比的miRNA丟失。拭子RNA提取試劑的選擇?對(duì)離心柱法而言,拭子核酸得率的高低。廈門正規(guī)RNA提取試劑銷售廠家
rRNA是組成核糖體的組分,是蛋白質(zhì)合成的工作場(chǎng)所。溫州正規(guī)RNA提取試劑廠家推薦
RNA是核糖核酸,DNA是脫氧核酸。區(qū)別:紫外吸收:核酸的λm=260nm,堿基展開程度越大,紫外吸收就越厲害。當(dāng)A=1時(shí),DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280還可來表示核酸的純度。沉降速度:對(duì)于拓?fù)洚悩?gòu)體(核苷酸數(shù)目相同的核酸),其沉降速度從達(dá)到小依次為:RNA;超螺旋DNA>解鏈環(huán)狀DNA;松弛環(huán)狀DNA;線形DNA也就是在離心管中較上層是線形DNA,較下面是RNA。電泳:核苷酸、核酸均可以進(jìn)行電泳,泳動(dòng)速度主要由分子大小來決定,因此,電泳是測(cè)定核酸分子量的好方法。DNA分子量測(cè)定較直接的方法:用適當(dāng)濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線形DNA,用電鏡測(cè)出其長(zhǎng)度,按B-DNA模型算出bp數(shù),根據(jù)核苷酸的平均分子量就可計(jì)算出DNA的分子量。溫州正規(guī)RNA提取試劑廠家推薦
總RNA提取試劑試劑能促進(jìn)不同種屬不同分子量大小的多種RNA的析出。例如,從大鼠肝臟抽提的RNA瓊脂糖凝膠電泳并用溴化乙啶染色,可見許多介于7kb和15kb之間不連續(xù)的高分子量條帶(mRNA和hnRNA成分),兩條優(yōu)勢(shì)核糖體~5kb(28S)和~2kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之間(tRNA,5S)。當(dāng)抽提的RNA用TE稀釋時(shí)其A260/A280比值≥1.8。注意如果是普通瓊脂糖凝膠電泳,28S的位置大約在2kb,18S大約在1kb的位置,不同濃度的凝膠位置變化較大。注意事項(xiàng):樣品用總RNA提取試劑勻漿后,如果不即刻加入氯仿之前,置于-70°C下可放置一個(gè)月以上。保存在7...