經(jīng)典Trizol法并不能獲得總RNA:這個(gè)事實(shí)可能會(huì)刷不少新手甚至老手的三觀,但確有實(shí)驗(yàn)支持:經(jīng)典Trizol法會(huì)選擇性丟失低GC比的miRNA。這一點(diǎn),源自一則作者自撤稿的故事。V.NarryKim是韓國(guó)鼎鼎大名的美女科學(xué)家,專做RNA相關(guān)的研究,包括miRNA。幾年前她們組發(fā)現(xiàn)一個(gè)奇怪的“現(xiàn)象”,即貼壁細(xì)胞在消化之后,會(huì)有一些miRNA的豐度突然降低,看起來好像是被快速“降解”掉了,并據(jù)此寫了一篇文章發(fā)到MolecularCell上。但很快她們就發(fā)現(xiàn),這個(gè)“現(xiàn)象”難以重復(fù):如果用Trizol做實(shí)驗(yàn),就一定是陽性結(jié)果,而用試劑盒提RNA,就重復(fù)不出來。難道是號(hào)稱能提總RNA的Trizol方案出了問題?確實(shí)如此。經(jīng)進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)后發(fā)現(xiàn),經(jīng)典的Trizol方案會(huì)使得低GC比的miRNA丟失。細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核RNA提取試劑盒特點(diǎn):細(xì)胞質(zhì)RNA不含DNA,直接用于RT-PCR/qRT-PCR。開封RNA提取試劑哪家便宜
常用總RNA提取試劑:異硫氰酸胍法和Trizol法是動(dòng)物組織及動(dòng)物細(xì)胞總RNA提取較常用的方法,異硫氰酸胍法操作簡(jiǎn)單快捷,適用于樣本足夠大的常規(guī)動(dòng)物組織;Trizol法裂解能力較強(qiáng),尤其適合小樣本及特別難提取的組織,如兔子皮膚,動(dòng)物結(jié)締組織等總RNA的提??;另外Trizol作為一種通用型的裂解試劑,還可以用于植物組織、細(xì)菌、菌類等組織的提取。對(duì)于含多糖多酚的植物組織如油茶、茶葉、油菜等還可以使用CTAB法進(jìn)行總RNA的提取。提取RNA時(shí)我們經(jīng)常遇到的問題是:(1)RNA產(chǎn)量較低;(2)RNA有嚴(yán)重的鹽類污染;(3)RNA有嚴(yán)重的有機(jī)溶劑污染;(4)樣品降解等問題。珠海正規(guī)RNA提取試劑直銷廠家RNA提取試劑注意事項(xiàng):為防止濺入眼睛,請(qǐng)戴防護(hù)眼鏡或使用透明保護(hù)屏。
RNA提取濃度不高或質(zhì)量不佳原因及解決辦法:1、得率過低:提取樣本過低總量不足或者提取樣本過多裂解不徹底;應(yīng)當(dāng)使用適當(dāng)質(zhì)量的組織或細(xì)胞進(jìn)行提取,樣本前處理一定要做好,裂解應(yīng)充分。2、基因組殘留:Trizol法提取時(shí),分層后吸取上清時(shí)吸到中間層會(huì)帶來嚴(yán)重的基因組污染;分層吸取時(shí)應(yīng)當(dāng)格外小心,不要吸取到中間層。如果是采用柱式法提取,可選擇含有DNaseI的試劑盒進(jìn)行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI進(jìn)行消化,可極大限度的降低DNA殘留。
RNA是核糖核酸,DNA是脫氧核酸。區(qū)別:紫外吸收:核酸的λm=260nm,堿基展開程度越大,紫外吸收就越厲害。當(dāng)A=1時(shí),DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280還可來表示核酸的純度。沉降速度:對(duì)于拓?fù)洚悩?gòu)體(核苷酸數(shù)目相同的核酸),其沉降速度從達(dá)到小依次為:RNA;超螺旋DNA>解鏈環(huán)狀DNA;松弛環(huán)狀DNA;線形DNA也就是在離心管中較上層是線形DNA,較下面是RNA。電泳:核苷酸、核酸均可以進(jìn)行電泳,泳動(dòng)速度主要由分子大小來決定,因此,電泳是測(cè)定核酸分子量的好方法。DNA分子量測(cè)定較直接的方法:用適當(dāng)濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線形DNA,用電鏡測(cè)出其長(zhǎng)度,按B-DNA模型算出bp數(shù),根據(jù)核苷酸的平均分子量就可計(jì)算出DNA的分子量??俁NA提取試劑:自備新開封或?qū)iT氯仿,異丙醇,75%乙醇,DEPC處理水。
細(xì)胞RNA提取的方法:實(shí)驗(yàn)提取步驟:標(biāo)準(zhǔn)Trizol提取步驟為液氮研磨--加入Trizol裂解--加入氯仿抽提--離心--加入氯丙醇沉淀--離心--酒精洗滌--離心。將細(xì)胞培養(yǎng)皿置于冰上,加入Trizol裂解5-10分鐘,用泵頭輕輕吹打后吸取液體放入進(jìn)口EP管中。加入1/5體積的氯仿,上下混勻液體,4度靜置10-15分鐘。(氯仿為有機(jī)溶劑,有效的使有機(jī)相和無機(jī)相迅速分離。有機(jī)相中主要是酚和蛋白結(jié)合,從而使得蛋白和RNA脫離,RNA進(jìn)入水相)。4度離心15分鐘,一定注意選擇低溫離心。離心后分成三層,RNA在上清里,從離心機(jī)輕輕拿出EP管,以免管內(nèi)物質(zhì)震蕩導(dǎo)致下層沉淀激起。吸取上清的時(shí)候一定要?jiǎng)幼鬏p柔,切忌吸取太多,一般吸到400-500ul,避免吸到下層沉淀,將液體置于新的EP管中。加入等體積異丙醇,4度靜置10min,然后12000rpm離心10min。RNA提取試劑注意事項(xiàng):間層用乙醇沉淀可回收DNA。南昌RNA提取試劑廠家直銷
好的試劑盒價(jià)格比較貴,在實(shí)驗(yàn)室可以根據(jù)自己的實(shí)驗(yàn)需要來定奪試劑盒的使用。開封RNA提取試劑哪家便宜
多糖多酚植物RNA提取試劑盒專門針對(duì)多糖,多酚等難提的植物RNA樣本提取設(shè)計(jì),至今為止未發(fā)現(xiàn)不能攻克的樣本(棉花,番茄,板栗,龍眼,荔枝,葡萄,針葉植物,百合,獼猴桃,香蕉,甘蔗,海棠,蘋果,銀杏,小麥,水稻,玉米等農(nóng)作物,果實(shí),花卉,蔬菜等多糖多酚,色素等次級(jí)代謝物嚴(yán)重的植物樣本,全部攻克)。絕無DNA污染,可直接反轉(zhuǎn)錄,熒光定量,不會(huì)出現(xiàn)其他公司試劑盒中出現(xiàn)的洗脫液含絡(luò)合Mg離子成分,壓制后續(xù)PCR反應(yīng)的情況。本試劑盒提取的RNA可直接用于對(duì)前期RNA提取質(zhì)量非常高的后續(xù)實(shí)驗(yàn),如轉(zhuǎn)錄組RNA測(cè)序,制作基因芯片,熒光定量PCR,核酸雜交,反轉(zhuǎn)錄等所有后續(xù)實(shí)驗(yàn)。一個(gè)樣十多分鐘搞定!具有世界品質(zhì)的植物RNA試劑盒!開封RNA提取試劑哪家便宜
總RNA提取試劑試劑能促進(jìn)不同種屬不同分子量大小的多種RNA的析出。例如,從大鼠肝臟抽提的RNA瓊脂糖凝膠電泳并用溴化乙啶染色,可見許多介于7kb和15kb之間不連續(xù)的高分子量條帶(mRNA和hnRNA成分),兩條優(yōu)勢(shì)核糖體~5kb(28S)和~2kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之間(tRNA,5S)。當(dāng)抽提的RNA用TE稀釋時(shí)其A260/A280比值≥1.8。注意如果是普通瓊脂糖凝膠電泳,28S的位置大約在2kb,18S大約在1kb的位置,不同濃度的凝膠位置變化較大。注意事項(xiàng):樣品用總RNA提取試劑勻漿后,如果不即刻加入氯仿之前,置于-70°C下可放置一個(gè)月以上。保存在7...