RNA提取試劑的選擇:選擇合適的提取試劑是較重要的一步。好的提取試劑在確保成功的同時(shí),操作方便且經(jīng)濟(jì)實(shí)用。對(duì)于動(dòng)物組織、簡(jiǎn)單的植物材料、各種微生物、培養(yǎng)細(xì)胞的totalRNA提取,Takara公司的RNAisoPlus具有諸多的成功案例。隨著2013年7月柱型提取試劑TaKaRaMiniBESTUniversalTotalRNAExtractionKit的成功上市,進(jìn)一步豐富了TakaraRNA提取的產(chǎn)品線。該產(chǎn)品采用了獨(dú)特的細(xì)胞裂解系統(tǒng),無(wú)需苯酚氯仿抽提等步驟,簡(jiǎn)單快捷。組織或細(xì)胞裂解后,提取操作光需20分鐘便可完成。常用RNA提取方法有:1TRIzol法;2TRIzol+過(guò)柱法;3CTAB+過(guò)柱法;4試劑盒法。合肥廣州RNA提取試劑
植物RNA快速提取試劑盒:是一種單相RNA快速提取試劑盒,可高效裂解堅(jiān)固的植物細(xì)胞并強(qiáng)烈壓制RNA酶活性。細(xì)胞破碎之后,植物多糖立即被PlantRNAtrip獨(dú)特的成分結(jié)合。離心抽提步驟將RNA與滅活的RNA酶、蛋白、基因組DNA污染分離,并清理植物多糖多酚以及次生代謝產(chǎn)物。在RNA沉淀之前加入PlantRNAAid清理植物多酚,并清理殘余的多糖。提取可在60分鐘內(nèi)完成,所提取的RNA純度極高,不含DNA和多糖和多酚污染,可用于構(gòu)建cDNA文庫(kù)、RT-PCR、Northern轉(zhuǎn)印分析、Poly(A)mRNA純化、體外翻譯、和RNA酶保護(hù)實(shí)驗(yàn)。適于各種植物組織RNA提取,也特別適合富含糖原的動(dòng)物肝臟和肌肉組織提取高純度RNA。如果植物組織富含多酚和次生代謝產(chǎn)物,推薦使用PlantRNAExtractionkit(R1050)。南昌正規(guī)RNA提取試劑進(jìn)貨價(jià)適用樣品:全血,哺乳動(dòng)物細(xì)胞,細(xì)菌細(xì)胞和菌類細(xì)胞。
RNA是核糖核酸,DNA是脫氧核酸。區(qū)別:紫外吸收:核酸的λm=260nm,堿基展開程度越大,紫外吸收就越厲害。當(dāng)A=1時(shí),DNA:50ug/ml,RNA和單鏈DNA:40ug/ml,寡核苷酸:20ug/ml。用A260/A280還可來(lái)表示核酸的純度。沉降速度:對(duì)于拓?fù)洚悩?gòu)體(核苷酸數(shù)目相同的核酸),其沉降速度從達(dá)到小依次為:RNA;超螺旋DNA>解鏈環(huán)狀DNA;松弛環(huán)狀DNA;線形DNA也就是在離心管中較上層是線形DNA,較下面是RNA。電泳:核苷酸、核酸均可以進(jìn)行電泳,泳動(dòng)速度主要由分子大小來(lái)決定,因此,電泳是測(cè)定核酸分子量的好方法。DNA分子量測(cè)定較直接的方法:用適當(dāng)濃度的EB(溴嘧啶)染色DNA,可以將其他形式的DNA變成線形DNA,用電鏡測(cè)出其長(zhǎng)度,按B-DNA模型算出bp數(shù),根據(jù)核苷酸的平均分子量就可計(jì)算出DNA的分子量。
RNA組成結(jié)構(gòu):RNA和DNA一樣,也是由各種核苷酸通過(guò)3′,5′-磷酸二酯鍵連接構(gòu)成的多核苷酸鏈,但與DNA有一系列差異。1.在化學(xué)組成方面,RNA含核糖而不含脫氧核糖。含尿嘧啶而不含胸腺密啶。例外的是,每個(gè)tNA分子含有一個(gè)胸腺嘧啶,這是在RNA鏈合成后由尿嘧啶甲基化生的,此外,前面已提到,少數(shù)DNA含有少量核糖,但這些個(gè)別的例外并不能以此否定兩類核酸組成上的差異。2.RNA一級(jí)結(jié)構(gòu)的概念雖與DNA相同.但其基本結(jié)構(gòu)單位是核糖核苷酸而不是脫氧核糖核苷酸。此外,部分RNA5′端或3′端有特殊的核苷酸序列,而且RNA一級(jí)結(jié)構(gòu)中沒有DNA那樣復(fù)雜的順序組織。3.絕大多數(shù)RNA為單鏈分子,單鏈可自身折迭形成發(fā)夾(hairpin)樣結(jié)構(gòu)而有局部雙螺旋結(jié)構(gòu)的特征,這是各種RAN空間結(jié)構(gòu)的共同特征。RNA局部雙螺旋結(jié)構(gòu)中堿基互補(bǔ)配對(duì)規(guī)律是A對(duì)U和G對(duì)C。由于RNA分子內(nèi)部不能較全形成堿基配對(duì),故其堿基克分子比A不等于U,G不等于C,不存在DNA堿基比例的Chargaff規(guī)律。拭子RNA提取試劑的選擇?離心柱的硅膠膜RNA吸附性能好、裂解液細(xì)胞裂解能力強(qiáng)。
RNA提取濃度不高或質(zhì)量不佳原因及解決辦法:1、得率過(guò)低:提取樣本過(guò)低總量不足或者提取樣本過(guò)多裂解不徹底;應(yīng)當(dāng)使用適當(dāng)質(zhì)量的組織或細(xì)胞進(jìn)行提取,樣本前處理一定要做好,裂解應(yīng)充分。2、基因組殘留:Trizol法提取時(shí),分層后吸取上清時(shí)吸到中間層會(huì)帶來(lái)嚴(yán)重的基因組污染;分層吸取時(shí)應(yīng)當(dāng)格外小心,不要吸取到中間層。如果是采用柱式法提取,可選擇含有DNaseI的試劑盒進(jìn)行提取,吸附在膜上的核酸直接用DNaseI進(jìn)行消化,可極大限度的降低DNA殘留。細(xì)胞裂解后,細(xì)胞釋放出蛋白質(zhì)、DNA、RNA等物質(zhì)。合肥廣州RNA提取試劑
根據(jù)它們?cè)诓煌腜H值和不同極性溶劑的溶解度不同而使得分開。合肥廣州RNA提取試劑
RNA提取試劑的選擇:對(duì)于富含多糖多酚的植物類組織提取是個(gè)難點(diǎn),Takara精心研發(fā)的柱型提取試劑TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以輕松解決這個(gè)問題。TaKaRaMiniBESTPlantRNAExtractionKit可以高效地從各種簡(jiǎn)單的植物組織材料(葉片、莖、幼苗等)、富含多糖多酚的植物組織材料(果實(shí)、種子等)、菌類提取高純度的TotalRNA,適用范圍普遍。按照標(biāo)準(zhǔn)流程,本試劑盒可以有效地提取分子量大于200nt的RNA,也可以按照可選步驟提取得到包含SmallRNA(<200nt)的TotalRNA。試劑盒中包含了RNA提取所需的全部試劑,無(wú)需額外購(gòu)買其它試劑~合肥廣州RNA提取試劑
總RNA提取試劑試劑能促進(jìn)不同種屬不同分子量大小的多種RNA的析出。例如,從大鼠肝臟抽提的RNA瓊脂糖凝膠電泳并用溴化乙啶染色,可見許多介于7kb和15kb之間不連續(xù)的高分子量條帶(mRNA和hnRNA成分),兩條優(yōu)勢(shì)核糖體~5kb(28S)和~2kb(18S),低分子量RNA介于0.1和0.3kb之間(tRNA,5S)。當(dāng)抽提的RNA用TE稀釋時(shí)其A260/A280比值≥1.8。注意如果是普通瓊脂糖凝膠電泳,28S的位置大約在2kb,18S大約在1kb的位置,不同濃度的凝膠位置變化較大。注意事項(xiàng):樣品用總RNA提取試劑勻漿后,如果不即刻加入氯仿之前,置于-70°C下可放置一個(gè)月以上。保存在7...