在生物工藝流程中，需要使用核酸酶去除終產(chǎn)品中的核酸污染，而核酸酶作為外源成份，也需要在生產(chǎn)流程中去除。核酸酶去除工藝包括熱滅活法、酶抑制劑、離子交換和親合層析法等。AAV衣殼亞種之間因表面電荷的差異導致不同的的等電點，——空衣殼pI在6.3左右，包裝了完整基因組DNA后的病毒顆粒pI大致為5.9。而來自于S.marcescens的全能核酸酶pI 6.85左右，SAN HQ高鹽核酸酶pI 9.6左右。因此，在同樣的條件下，從AAV溶液中去除SAN HQ高鹽核酸酶比去除Benzonase全能核酸酶更容易、更徹底。SAN HQ高鹽核酸酶在高鹽濃度下活性更適，DNA去除效率更高。湖北分子研究高鹽核酸酶70921-150
宿主細胞DNA（HCD）殘留以染色質(zhì)形式存在，其中有帶負電荷的DNA、帶正電荷及疏水區(qū)段的組蛋白，就像膠帶一樣能夠吸附很多物質(zhì)，包括各種雜蛋白、色譜填料、目的病毒顆粒。非特異吸附雜蛋白，會影響蛋白雜質(zhì)（如HCP）等的去除；吸附到色譜填料上，會降低色譜分離純化效率；吸附到目的病毒顆粒時，會影響目的產(chǎn)物的穩(wěn)定性，從而降低目的產(chǎn)物的得率。因此，從生產(chǎn)工藝層面來講，一定要去除HCD，從而能夠簡化工藝、提高目的產(chǎn)物的產(chǎn)量。四川上海倍篤生物高鹽核酸酶70921-160鑒于其在高鹽條件下的較高活性，SAN HQ高鹽核酸酶在不損失載體產(chǎn)量和活性的情況下改善了下游工藝。
基因療法制造商面臨的挑戰(zhàn)與抗體療法剛出現(xiàn)時單克隆抗體制造商面臨的挑戰(zhàn)相似。例如，在生產(chǎn)、儲存和處理過程中，單克隆抗體也會受到低滴度、產(chǎn)品和工藝相關雜質(zhì)和降解的挑戰(zhàn)。盡管與重組單克隆抗體相比，單劑量AAV產(chǎn)品與工藝相關雜質(zhì)相關的風險可能更低（取決于雜質(zhì)的類型、劑量和給藥途徑），但這也不能忽視。由于這些相似性，制藥商、化學品和輔料供應商有機會進行合作，并開發(fā)創(chuàng)新的解決方案，以實現(xiàn)穩(wěn)健和成本效益高的AAV產(chǎn)品生產(chǎn)。
基因藥物常用的AAV載體有三種生產(chǎn)方法，分別是三質(zhì)粒瞬轉體系、桿狀病毒表達載體體系和包裝細胞體系。其中，20多年前開發(fā)的三質(zhì)粒瞬轉表達技術仍然占據(jù)腺相關病毒AAV生產(chǎn)的主流地位，其三質(zhì)粒分別是Helper質(zhì)粒（含E2a/b、E4和VARNA基因）、目標基因表達質(zhì)粒及輔助質(zhì)粒（含Cap和Rep基因）。雖然AAV病毒載體的血清型不同，但AAV的生產(chǎn)流程基本一致，主要有質(zhì)粒共轉宿主細胞HEK293、293細胞生產(chǎn)病毒顆粒、從細胞培養(yǎng)上清或/及細胞裂解液中收獲病毒載體、純化/制劑/無菌過濾/灌裝等流程。ArcticZymes致力于提供高質(zhì)量產(chǎn)品，具有好的批間一致性、穩(wěn)定可靠的質(zhì)量。
ArcticZymes Technologies提供獨特特性的鹽活性核酸酶（Salt Active Nucleases，SANs）系列產(chǎn)品，主要包含SAN HQ高鹽核酸酶和M-SAN HQ中鹽核酸酶。這兩款酶都是非特異核酸內(nèi)切酶，跟Benzonase一樣能高效降解任何形式（雙鏈、單鏈、線狀、環(huán)狀）的DNA和RNA；都來自于深海microbes，通過Pichia pastoris發(fā)酵生產(chǎn)得到。這兩款酶的區(qū)別在于發(fā)揮酶活的適宜鹽濃度不同，——M-SAN HQ中鹽核酸酶的適宜鹽濃度在175mM-250mM，而SAN HQ高鹽核酸酶的適宜鹽濃度在400mM-600mM。在AAV生產(chǎn)過程中使用SAN HQ高鹽核酸酶。四川上海倍篤生物高鹽核酸酶70921-160
SAN HQ GMP是全球shou款市售GMP級別高鹽核酸酶，于2023年Q4上市。湖北分子研究高鹽核酸酶70921-150
宿主細胞DNA殘留的擔憂是基于致ai風險理論，特別是生產(chǎn)細胞系所包含的致ai序列，比如較常見腺病毒基因E1A和E1B（HEK293, PerC.6 和CAP 細胞系），人乳tou瘤病毒E6和E7基因（HeLa細胞系)等。當使用致ai細胞系生產(chǎn)AAV時，下游純化須盡可能減少殘留DNA。工業(yè)上一般使用核酸酶分解殘留DNA，普遍認為小于200 bp的DNA片段可有效降低致ai風險。宿主細胞蛋白殘留與免疫原性、炎癥或過敏性休克有關。盡管與非人類的生產(chǎn)原料相比（非人類細胞系如BHK21或昆蟲細胞，以及輔助病毒如HSV、腺病毒、桿狀病毒），人類細胞免疫原性比較弱。湖北分子研究高鹽核酸酶70921-150
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